RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 HCFC1P51610 2035 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 FSTL3O95633 263 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 EML5Q05BV3 1969 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WZ39 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 REG3AQ06141 175 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01548A6NM66 108 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 TRIAP1O43715 76 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 HILS1P60008 231 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 SIRPDQ9H106 197 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 XGP55808 180 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 RNF185Q96GF1 192 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC140Q96MF4 163 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 IMUPQ9GZP8 106 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 ODF3BA8MYP8 253 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 CEP350Q5VT06 3117 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 SLPIP03973 132 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 MUC7Q8TAX7 377 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 A6NED7 52 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 CRYGDP07320 174 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 Q8N976 141 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC179H3BU77 68 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 GAS8-AS1O95177 125 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV2-11P01706 119 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 SYCNQ0VAF6 134 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 U3KQK5 164 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 CCKP06307 115 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 A6NDX4 124 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 A8MZ25 164 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 SERP2Q8N6R1 65 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 IGF2RP11717 2491 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM223A0PJW6 202 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 LY6LH3BQJ8 138 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 A0A096LNI7 61 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB4AO15263 64 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 MIFP14174 115 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 LMO4P61968 165 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0U1RQV1 116 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2D1P51668 147 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 PIEZO1Q92508 2521 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 ENHOQ6UWT2 76 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 SCXQ7RTU7 201 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 C20orf173Q96LM9 149 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 TIMM17BO60830 172 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 EBI3Q14213 229 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 NRGNQ92686 78 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf85Q96MD7 179 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZS46 218 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZTI0 123 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 BRCA2P51587 3418 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 M0R378 163 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFA7O95182 113 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 NRACQ8N912 160 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 JMJD1CQ15652 2540 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 DSCAMO60469 2012 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 K7EQG2 157 aa6.59□□□□□ -1.35
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