RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918		Q5PR19	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TEN1	Q86WV5	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918		A8MWV9	139 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918		Q96MF0	132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	ERG28	Q9UKR5	140 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	PDZD2	O15018	2839 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	GATA3	P23771	443 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	FSHB	P01225	129 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6ZTI0	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	CRLF1	O75462	422 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF415	Q09FC8	603 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	CKS1B	P61024	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM101	Q96IK0	257 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A0B4J2C4	111 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	GAGE12J	A6NER3	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	DSCR9	P59020	149 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	GAGE4	Q13068	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	GAGE5	Q13069	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	ESM1	Q9NQ30	184 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	CRYBA4	P53673	196 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918		J3QLI3	93 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	INS	P01308	110 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918		Q8N2B8	174 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918		Q9H8V8	135 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	MIA	Q16674	131 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	ATR	Q13535	2644 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CAGE1-203	ENST00000379918	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918		A8MTW9	85 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918		H7C423	109 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	STH	Q8IWL8	128 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	RS1	O15537	224 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF183	Q96D59	192 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	CIDEA	O60543	219 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	GAGE7	O76087	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	GAGE12F	P0CL80	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	GAGE12G	P0CL81	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	GAGE12I	P0CL82	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	ATXN8	Q156A1	80 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	SCGB1A1	P11684	91 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A1B0GV72	72 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	TTC32	Q5I0X7	151 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	CCL24	O00175	119 aa		5	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		5	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		5	□□□□□ -1.61
CAGE1-203	ENST00000379918	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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