RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	CLB3	P24870	427 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PHO11	P35842	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YKL133C	P36066	463 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	CAF4	P36130	643 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MRPL17	P36528	281 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	APM3	P38153	483 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MGE1	P38523	228 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PHO12	P38693	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PRM9	P39551	298 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MAD3	P47074	515 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PIP2	P52960	996 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MNT2	P53059	558 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	DAL4	Q04895	635 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PDR8	Q06149	701 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	NTG2	Q08214	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	DAS2	Q12084	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	GPR1	Q12361	961 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	YLR358C	O13565	187 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	BI4	P03879	638 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	RAP1	P11938	827 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	BUD16	P39988	312 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	MND2	P40577	368 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	STB1	P42845	420 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	YDL183C	P48569	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	TEL2	P53038	688 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	YGL117W	P53133	265 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	SLT2	Q00772	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	PIG1	Q06216	648 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	MCM21	Q06675	368 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	VAC14	Q06708	880 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	YEH2	Q07950	538 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	SSP2	Q08646	371 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	AEP3	Q12089	606 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	SRB8	P25648	1427 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	ADR1	P07248	1323 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	PEX1	P24004	1043 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	KRE2	P27809	442 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	ZIP1	P31111	875 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	SWC5	P38326	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	SHU2	P38957	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	GCV1	P48015	400 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	GCV2	P49095	1034 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	NIT3	P49954	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	LIF1	P53150	421 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	USA1	Q03714	838 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	TOS4	Q06266	489 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	NDE2	Q07500	545 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	PPM2	Q08282	695 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	TAH18	Q12181	623 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	YPR089W	O13585	888 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	MRP7	P12687	371 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	SEC63	P14906	663 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	TUP1	P16649	713 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	ERS1	P17261	260 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	NAM9	P27929	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	PTP2	P29461	750 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	AFG2	P32794	780 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	TIM23	P32897	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	ERT1	P38140	529 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	BMT2	P38278	337 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	MNL1	P38888	796 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	STL1	P39932	569 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	FCY21	P40039	528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	YIL077C	P40508	320 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	RTS2	P40962	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	POL31	P46957	487 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSE1	YOL033W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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