RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	BET4	Q00618	327 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MSH6	Q03834	1242 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MPC54	Q08550	464 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.89	□□□□□ -1.47	not detected
AMD1	YML035C	OAF3	P36023	863 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	DUG2	P38149	878 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	CKB2	P38930	258 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	NUP60	P39705	539 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	LSB6	P42951	607 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ALY2	P47029	1046 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PIR3	Q03180	325 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	BSP1	Q06604	576 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	CDC73	Q06697	393 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SAM3	Q08986	587 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	IMA3	P0CW40	589 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	IMA4	P0CW41	589 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ARG1	P22768	420 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	BIT2	P38346	545 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YJL132W	P47014	750 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	IML2	P47031	731 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	URB2	P47108	1174 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YPR003C	P53394	754 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	IMA2	Q08295	589 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PEX1	P24004	1043 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YME1	P32795	747 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YBR062C	P38239	180 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MSR1	P38714	643 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SCC4	P40090	624 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YNL144C	P53907	740 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ARA2	Q04212	335 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YPQ1	Q12010	308 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SEY1	Q99287	776 aa		5.88	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	CBF1	P17106	351 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SIC1	P38634	284 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PEX28	P38848	579 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MRX1	P40050	688 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SNG1	P46950	547 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RSM26	P47141	266 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RTA1	P53047	317 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PCL10	P53124	433 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	INP2	Q03824	705 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	NRT1	Q08485	598 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	HEM15	P16622	393 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ATG12	P38316	186 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	UBX4	P54730	416 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SHR3	Q02774	210 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	INA17	Q02888	182 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	AAD15	Q08361	143 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RRD2	Q12461	358 aa		5.87	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ADY2	P25613	283 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MGT1	P26188	188 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PPE1	P38796	400 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	STL1	P39932	569 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	VAC8	P39968	578 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YEL028W	P39989	153 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MOB1	P40484	314 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	UFE1	P41834	346 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SAE2	P46946	345 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	COG6	P53959	839 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YMR027W	Q04371	470 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	FRA1	Q07825	749 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	COQ8	P27697	501 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	AIM26	P32858	118 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ZIP2	P53061	704 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YGR127W	P53275	312 aa		5.86	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	APE1	P14904	514 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	TSR4	P25040	408 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	KAR4	P25583	335 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SEC6	P32844	805 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YAT2	P40017	923 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	NMA111	P53920	997 aa		5.85	□□□□□ -1.47

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