RNA–Protein interactions for RNA: YHR009C

TDA3, Transcript of Putative oxidoreductase involved in late endosome to Golgi transport, yeast

Gene TDA3, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TDA3	YHR009C	TMA10	Q06177	86 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	SUL2	Q12325	893 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	TPK1	P06244	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	BCD1	P38772	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
TDA3	YHR009C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	ELO3	P40319	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	COS12	P53053	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	RIM8	P53179	542 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	MDG1	P53885	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	MRP7	P12687	371 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
TDA3	YHR009C	MPS3	P47069	682 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	BUL1	P48524	976 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	YAP1802	P53309	568 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	CDA2	Q06703	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	MET8	P15807	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	STE11	P23561	717 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	DSS4	P32601	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	COG1	P53079	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	YKU80	Q04437	629 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	IRC13	Q08630	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	TRM13	Q12383	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	PET122	P10355	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	NTH1	P32356	751 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	TOD6	P34219	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	REV7	P38927	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	KHA1	P40309	873 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	LYS14	P40971	790 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	IDS2	P46958	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	HOF1	Q05080	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	IZH3	Q07959	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	SIR3	P06701	978 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	ESL2	P36168	1195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	UBS1	P38290	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	SIP4	P46954	829 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	YJL163C	P46996	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	BSC5	P53755	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	SPC19	Q03954	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	VPS34	P22543	875 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	PHO11	P35842	467 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	MRPL7	P36519	292 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	CTP1	P38152	299 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	PHO12	P38693	467 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	YJR061W	P40355	935 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	VTC2	P43585	828 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	ZAP1	P47043	880 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	SGM1	P47166	707 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TAM41	P53230	385 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	FHN1	P53279	174 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	MLH3	Q12083	715 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	SKM1	Q12469	655 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	YLR302C	O13544	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TIM10	P87108	93 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	FRE5	Q08908	694 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	TAH18	Q12181	623 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	YLR358C	O13565	187 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	ERG4	P25340	473 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	YCR061W	P25639	631 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	SWC3	P31376	625 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	MRP20	P32387	263 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	NUP120	P35729	1037 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	PSD1	P39006	500 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	FMP52	P40008	231 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TDA3	YHR009C	FMP10	P40098	244 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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