RNA–Protein interactions for RNA: YGL039W

YGL039W, Transcript of Oxidoreductase shown to reduce carbonyl compounds to chiral alcohols, yeast

Gene YGL039W, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL039W	YGL039W	SWC3	P31376	625 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	PPZ2	P33329	710 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	YLF2	P38746	405 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	LRO1	P40345	661 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	BNR1	P40450	1375 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	MAD2	P40958	196 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	PMT6	P42934	759 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	IMO32	P53219	342 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	YNR071C	P53757	342 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	COQ11	Q05892	277 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	ICT1	Q12385	394 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	URA3	P03962	267 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	POL3	P15436	1097 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
YGL039W	YGL039W	ARG1	P22768	420 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	RAD16	P31244	790 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	UME6	P39001	836 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	VFA1	P40080	203 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	PSF2	P40359	213 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	SMK1	P41808	388 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	THI6	P41835	540 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	YDL121C	Q07541	149 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	CRD1	Q07560	283 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	DIN7	Q12086	430 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	RPN13	O13563	156 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	BET2	P20133	325 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	CNE1	P27825	502 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	FLO10	P36170	1169 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	LNP1	P38878	278 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	YJL193W	P39542	402 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	RAD26	P40352	1085 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	IMA5	P40884	581 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	YIP4	P53093	235 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	TRS23	Q03784	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	VPS64	Q03944	604 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	ARO10	Q06408	635 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	NKP1	Q12493	238 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	TPK2	P06245	380 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	STE12	P13574	688 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	VPS33	P20795	691 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	CLB4	P24871	460 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	SWE1	P32944	819 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	PSY4	P38193	441 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	EXO84	P38261	753 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	PAC2	P39937	518 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	CAB2	P40506	365 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	GSM1	P42950	618 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	IDS2	P46958	469 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	MRK1	P50873	501 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	SAP4	P53036	818 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	YGL117W	P53133	265 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	GTR1	Q00582	310 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	MFM1	Q02783	413 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	ATG21	Q02887	496 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	YML131W	Q03102	365 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	AAD4	Q07747	329 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	SPO11	P23179	398 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	DSS4	P32601	143 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	XRS2	P33301	854 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	SLC1	P33333	303 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	ERR3	P42222	437 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	SKP2	P42843	763 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	BUD17	P53727	317 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	CPR8	P53728	308 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	ACS1	Q01574	713 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	USA1	Q03714	838 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YGL039W	YGL039W	SIR1	P21691	654 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YGL039W	YGL039W	RIT1	P23796	513 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YGL039W	YGL039W	RER1	P25560	188 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YGL039W	YGL039W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YGL039W	YGL039W	TMT1	P32643	299 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YGL039W	YGL039W	BEM3	P32873	1128 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YGL039W	YGL039W	STB5	P38699	743 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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