RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W PET123P17558 318 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W PET309P32522 965 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W LRG1P35688 1017 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YKT6P36015 200 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YEL076CP39971 216 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W TEP1P53916 434 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W MRS2Q01926 470 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W NRG1Q03125 231 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W APL4Q12028 832 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W KCS1Q12494 1050 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YKL068W-AQ3E826 78 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W OSM1P21375 501 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W CDC20P26309 610 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W CDC15P27636 974 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W PCH2P38126 564 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W PSY4P38193 441 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RPP1P38786 293 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W COX18P53239 316 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RNT1Q02555 471 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YDR132CQ03900 495 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W HLR1Q04429 423 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W SML1Q04964 104 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YCG1Q06680 1035 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W ARP7Q12406 477 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W TRM11Q12463 433 aa5.94□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W MSH1P25846 959 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W PEP3P27801 918 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W IMP2'P32351 346 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W OMA1P36163 345 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YHR112CP38716 378 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W VPS41P38959 992 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W PLB1P39105 664 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W SPT20P50875 604 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W VPS75P53853 264 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W NSE5Q03718 556 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W PPN1Q04119 674 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YLR224WQ05947 369 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W ERG20P08524 352 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W IME1P21190 360 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W OPI1P21957 404 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W STE11P23561 717 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W MCM4P30665 933 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W TGL1P34163 548 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W EXO84P38261 753 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W MED8P38304 223 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YHR033WP38690 423 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W OSH3P38713 996 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W SSP120P39931 234 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W SCS2P40075 244 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W PXA1P41909 870 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W EPL1P43572 832 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W ECL1P48235 211 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W PUS4P48567 403 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W TAF4P50105 388 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RMT2Q03305 412 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W GAD1Q04792 585 aa5.93□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W SEC18P18759 758 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W UBC1P21734 215 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W MSM1P22438 575 aa5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W CAD1P24813 409 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W CTF13P35203 478 aa5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RTT107P38850 1070 aa5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YNL195CP40168 261 aa5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W APT1P49435 187 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W ADE16P54113 591 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W FCP1Q03254 732 aa5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W VPS36Q06696 566 aa5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W TMA16Q08687 178 aa5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W VPS5Q92331 675 aa5.92□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YRF1-3P0CX14 1859 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YRF1-7P0CX15 1859 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YRF1-6P53819 1859 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W HSP82P02829 709 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RPS13P05756 151 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RNA1P11745 407 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RNR1P21524 888 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W KAR4P25583 335 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W SSH4P32343 579 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W DSN1P40568 576 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W BUD8P41698 603 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W TEX1P53851 422 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YMR102CQ03177 834 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W GYL1Q04322 720 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W RBA50Q04418 439 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W SSP2Q08646 371 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W TGL5Q12043 749 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YOL087CQ99247 1116 aa5.91□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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