RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 SLURP2P0DP57 97 aa21.92■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 DEFB118Q96PH6 123 aa21.92■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.92■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 DLL1O00548 723 aa21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 RGS3P49796 1198 aa21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 LRCH3Q96II8 777 aa21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 PTPRAP18433 802 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 USP44Q9H0E7 712 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 SIL1Q9H173 461 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 STAP2Q9UGK3 403 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 ATP2B3Q16720 1220 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 COL6A3P12111 3177 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM75PA6NK02 468 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 PTPRCP08575 1304 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 PHKA1P46020 1223 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 LAMA3Q16787 3333 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1W2PPC1 479 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 PICALMQ13492 652 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 IRF5Q13568 498 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 ENTPD3O75355 529 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 IDI2Q9BXS1 227 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 TREML2Q5T2D2 321 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 COA7Q96BR5 231 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 GAKO14976 1311 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 ADORA1P30542 326 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 ABCF2Q9UG63 623 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-211ENST00000574099 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 FAM196BA6NMK8 535 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 SEMA3EO15041 775 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 ANP32CO43423 234 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 BTDP43251 543 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 CIAO1O76071 339 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 MAP3K10Q02779 954 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC102BQ68D86 513 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 PNMA3Q9UL41 463 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 RASGRF1Q13972 1273 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF521Q96K83 1311 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 HMGCRP04035 888 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 SYN1P17600 705 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 CAPN2P17655 700 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM32Q13049 653 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 GDF15Q99988 308 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO3Q9UK99 471 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 SPP2Q13103 211 aa21.77■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 SLF2Q8IX21 1173 aa21.77■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 PLXNB2O15031 1838 aa21.77■■□□□ 1.08
CCDC40-211ENST00000574099 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCDC40-211ENST00000574099 HMGCS2P54868 508 aa21.76■■□□□ 1.07
CCDC40-211ENST00000574099 Q7L0L9 218 aa21.76■■□□□ 1.07
CCDC40-211ENST00000574099 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCDC40-211ENST00000574099 RHBDL3P58872 404 aa21.75■■□□□ 1.07
CCDC40-211ENST00000574099 DEFB123Q8N688 67 aa21.75■■□□□ 1.07
CCDC40-211ENST00000574099 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.75■■□□□ 1.07
CCDC40-211ENST00000574099 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms