RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560256.1

AKAP13-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 322 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-216	ENST00000560256	SCP2	P22307	547 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	GJB2	P29033	226 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	TFCP2	Q12800	502 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	BIRC2	Q13490	618 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256		A0A0D9SFI3	127 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	MAP2K7	O14733	419 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	IRF6	O14896	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	C21orf2	O43822	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	PDE8A	O60658	829 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	NEBL	O76041	1014 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	ELF1	P32519	619 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	NF2	P35240	595 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	TXLNA	P40222	546 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	NT5C2	P49902	561 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	AK2	P54819	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	PTH1R	Q03431	593 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	NEDD9	Q14511	834 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	IQCB1	Q15051	598 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	CCDC102A	Q96A19	550 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP13-216	ENST00000560256	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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