RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 E7EWF7 191 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 SPDYE6P0CI01 402 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 PPARAQ07869 468 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 CTR9Q6PD62 1173 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 LAMB1P07942 1786 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 ST18O60284 1047 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 NEK4P51957 841 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 SBK1Q52WX2 424 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 NEK1Q96PY6 1258 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 FLT1P17948 1338 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 MYH1P12882 1939 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 PICALMQ13492 652 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 MICALL2Q8IY33 904 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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MEIS3-204ENST00000558555 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
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MEIS3-204ENST00000558555 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
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MEIS3-204ENST00000558555 TBC1D10CQ8IV04 446 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 RRAGCQ9HB90 399 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 GLTPD2A6NH11 291 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 H7C1D1 291 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 BECN1Q14457 450 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 RUFY3Q7L099 469 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 NBPF3Q9H094 633 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 NCOA7Q8NI08 942 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 IDI2Q9BXS1 227 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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MEIS3-204ENST00000558555 C12orf60Q5U649 245 aa28.27■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 SHTN1A0MZ66 631 aa28.26■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.26■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
MEIS3-204ENST00000558555 CYP2D6P10635 497 aa28.26■■■□□ 2.11
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MEIS3-204ENST00000558555 HSCBQ8IWL3 235 aa28.26■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 SNX21Q969T3 373 aa28.26■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.26■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 CEP350Q5VT06 3117 aa28.26■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 CPA1P15085 419 aa28.25■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 CACNB3P54284 484 aa28.25■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 NFIAQ12857 509 aa28.25■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.25■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 KRT23Q9C075 422 aa28.25■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.25■■■□□ 2.11
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MEIS3-204ENST00000558555 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 TTC6Q86TZ1 520 aa28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 TOMM22Q9NS69 142 aa28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 CLRN2A0PK11 232 aa28.23■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 WNT10BO00744 389 aa28.23■■■□□ 2.11
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MEIS3-204ENST00000558555 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.23■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 ENTPD3O75355 529 aa28.23■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.23■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.23■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 ROBO3Q96MS0 1386 aa28.22■■■□□ 2.11
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MEIS3-204ENST00000558555 HLA-DOAP06340 250 aa28.22■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 MCM2P49736 904 aa28.22■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 TCP10Q12799 353 aa28.22■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.22■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 VEZTQ9HBM0 779 aa28.22■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 MCM5P33992 734 aa28.21■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.21■■■□□ 2.11
MEIS3-204ENST00000558555 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
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