RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 SIPA1L1O43166 1804 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CDC27P30260 824 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 LIFRP42702 1097 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 PPARAQ07869 468 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CTR9Q6PD62 1173 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 APOA5Q6Q788 366 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 OLFM4Q6UX06 510 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 VPS37DQ86XT2 251 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 NAPBQ9H115 298 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CD209Q9NNX6 404 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 RAI14Q9P0K7 980 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 UFL1O94874 794 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 POLD1P28340 1107 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 DDX11Q96FC9 970 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 TMEM87BQ96K49 555 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 MTA3Q9BTC8 594 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 JAG2Q9Y219 1238 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 PPFIA3O75145 1194 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 KDM4AO75164 1064 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CHRNA5P30532 468 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 PPP4CP60510 307 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 TGFB2P61812 414 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 FERMT3Q86UX7 667 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 MPNDQ8N594 471 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 SHISA4Q96DD7 197 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 ELP1O95163 1332 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 ZBTB7AO95365 584 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 APPP05067 770 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 PDCP20941 246 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 SBK1Q52WX2 424 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 RGS22Q8NE09 1264 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 PANK2Q9BZ23 570 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 GAKO14976 1311 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 C6orf229H3BNL8 230 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CYP2D6P10635 497 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 KCNA3P22001 575 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 RHBDL3P58872 404 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 FUT2Q10981 343 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 NBPF11Q86T75 865 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CERS5Q8N5B7 392 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 PGBD1Q96JS3 809 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 AIFM3Q96NN9 605 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 KIF28PB7ZC32 967 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 USP17L12C9JPN9 530 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 USP17L21D6R901 530 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 ORC4O43929 436 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 MBD3O95983 291 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 RXRAP19793 462 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 TDO2P48775 406 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 TTLL6Q8N841 843 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 EYA3Q99504 573 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-203ENST00000546585 MYL10Q9BUA6 226 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms