RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546102.1

CUL3-215, Transcript of cullin 3, human

TSL 4

Gene CUL3, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-215	ENST00000546102	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	CDC25B	P30305	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	GIPC1	O14908	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	FSCN2	O14926	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	MARCH6	O60337	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PTPRA	P18433	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	HMX2	A2RU54	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	WISP1	O95388	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	MED26	O95402	600 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ARL4D	P49703	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	IGBP1	P78318	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ATP11A	P98196	1134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ABCA8	O94911	1581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	CLSTN1	O94985	981 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	BMP3	P12645	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	HSD3B2	P26439	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102		F6X3S4	739 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PHACTR2	O75167	634 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	SPINK2	P20155	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RXRB	P28702	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	SERINC3	Q13530	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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