RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 KIF21BO75037 1637 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 AOC2O75106 756 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 ATP2B2Q01814 1243 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 WDR18Q9BV38 432 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRC-211ENST00000484135 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRC-211ENST00000484135 PRR19A6NJB7 356 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRC-211ENST00000484135 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
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PTPRC-211ENST00000484135 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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PTPRC-211ENST00000484135 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 CEP170Q5SW79 1584 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF862O60290 1169 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 KRT82Q9NSB4 513 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 FAM170BA6NMN3 283 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO24O75426 580 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 NME2P22392 152 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 DTX1Q86Y01 620 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 CYP27A1Q02318 531 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRC-211ENST00000484135 SAMM50Q9Y512 469 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 CEP162Q5TB80 1403 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 IQGAP2Q13576 1575 aa7.41□□□□□ -1.22
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