RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRC-211ENST00000484135 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRC-211ENST00000484135 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRC-211ENST00000484135 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRC-211ENST00000484135 FOXD1Q16676 465 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRC-211ENST00000484135 POTEDQ86YR6 584 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRC-211ENST00000484135 MSH5O43196 834 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRC-211ENST00000484135 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRC-211ENST00000484135 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRC-211ENST00000484135 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRC-211ENST00000484135 ADRA2BP18089 450 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRC-211ENST00000484135 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRC-211ENST00000484135 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRC-211ENST00000484135 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRC-211ENST00000484135 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRC-211ENST00000484135 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRC-211ENST00000484135 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRC-211ENST00000484135 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRC-211ENST00000484135 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRC-211ENST00000484135 RNF39Q9H2S5 420 aa17.27■□□□□ 0.36
PTPRC-211ENST00000484135 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRC-211ENST00000484135 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRC-211ENST00000484135 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-211ENST00000484135 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
PTPRC-211ENST00000484135 KCNA4P22459 653 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRC-211ENST00000484135 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRC-211ENST00000484135 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRC-211ENST00000484135 CAPN15O75808 1086 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRC-211ENST00000484135 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRC-211ENST00000484135 DSG3P32926 999 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRC-211ENST00000484135 POTEHQ6S545 545 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRC-211ENST00000484135 APLP2Q06481 763 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRC-211ENST00000484135 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PTPRC-211ENST00000484135 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRC-211ENST00000484135 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRC-211ENST00000484135 SLC4A2P04920 1241 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRC-211ENST00000484135 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRC-211ENST00000484135 ABCB7O75027 752 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRC-211ENST00000484135 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRC-211ENST00000484135 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRC-211ENST00000484135 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRC-211ENST00000484135 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRC-211ENST00000484135 POLA2Q14181 598 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB22O15209 634 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRC-211ENST00000484135 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRC-211ENST00000484135 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.03■□□□□ -0
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PTPRC-211ENST00000484135 AKT1S1Q96B36 256 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRC-211ENST00000484135 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRC-211ENST00000484135 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRC-211ENST00000484135 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRC-211ENST00000484135 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRC-211ENST00000484135 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRC-211ENST00000484135 OSCARQ8IYS5 282 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRC-211ENST00000484135 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRC-211ENST00000484135 HAX1O00165 279 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRC-211ENST00000484135 PITPNM1O00562 1244 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRC-211ENST00000484135 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
PTPRC-211ENST00000484135 FBLN2P98095 1184 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRC-211ENST00000484135 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRC-211ENST00000484135 SPDYE6P0CI01 402 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRC-211ENST00000484135 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRC-211ENST00000484135 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
PTPRC-211ENST00000484135 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PTPRC-211ENST00000484135 EVX2Q03828 476 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PTPRC-211ENST00000484135 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PTPRC-211ENST00000484135 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.16□□□□□ -0.14
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.11□□□□□ -0.15
PTPRC-211ENST00000484135 PRR29P0C7W0 189 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRC-211ENST00000484135 CHADLQ6NUI6 762 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRC-211ENST00000484135 GABBR2O75899 941 aa14.01□□□□□ -0.17
PTPRC-211ENST00000484135 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14□□□□□ -0.17
PTPRC-211ENST00000484135 LHX8Q68G74 356 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRC-211ENST00000484135 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PTPRC-211ENST00000484135 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRC-211ENST00000484135 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PTPRC-211ENST00000484135 CLCN6P51797 869 aa13.77□□□□□ -0.21
PTPRC-211ENST00000484135 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRC-211ENST00000484135 POTEIP0CG38 1075 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRC-211ENST00000484135 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRC-211ENST00000484135 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP8Q14318 412 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRC-211ENST00000484135 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRC-211ENST00000484135 CREBZFQ9NS37 354 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRC-211ENST00000484135 PROM2Q8N271 834 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRC-211ENST00000484135 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRC-211ENST00000484135 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
PTPRC-211ENST00000484135 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRC-211ENST00000484135 PHF12Q96QT6 1004 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRC-211ENST00000484135 OTUD5Q96G74 571 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRC-211ENST00000484135 POTEB2H3BUK9 544 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRC-211ENST00000484135 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHG5O94827 1062 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO3Q9UK99 471 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRC-211ENST00000484135 MIER1Q8N108 512 aa13.14□□□□□ -0.31
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