RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 SLF2Q8IX21 1173 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 TEKT1Q969V4 418 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC2Q9BYS8 371 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 USP17L8P0C7I0 530 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 USP5P45974 858 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 GMLQ99445 158 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 SHTN1A0MZ66 631 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 RPS6KB1P23443 525 aa21.98■■□□□ 1.11
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CAPN3-209ENST00000466222 AK2P54819 239 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 KRT32Q14532 448 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 TEX11Q8IYF3 940 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 PANK2Q9BZ23 570 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 CACNB3P54284 484 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.98■■□□□ 1.11
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CAPN3-209ENST00000466222 PPARAQ07869 468 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 USP40Q9NVE5 1235 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 ZMYM6O95789 1325 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 NEDD4P46934 1319 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 PICALMQ13492 652 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPN3-209ENST00000466222 NFIAQ12857 509 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 CFAP100Q494V2 611 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.95■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 FZD9O00144 591 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 FLT1P17948 1338 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 B4E1Z4 1266 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 PRDM1O75626 825 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 PLCD1P51178 756 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 MRIQ9BWK5 157 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 DTNBO60941 627 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 ANTXR2P58335 489 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 PLCG2P16885 1265 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 LMNB1P20700 586 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 Q6ZUG5 572 aa21.92■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 NCOA7Q8NI08 942 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 TOMM22Q9NS69 142 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.92■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 CLCN1P35523 988 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF445P59923 1031 aa21.92■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.92■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 C12orf60Q5U649 245 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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CAPN3-209ENST00000466222 SLURP2P0DP57 97 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 CUL4AQ13619 759 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 TNIP1Q15025 636 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 MCTP1Q6DN14 999 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 KDM4AO75164 1064 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 TCP10Q12799 353 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN3-209ENST00000466222 TRDNQ13061 729 aa21.9■■□□□ 1.1
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