RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 TBC1D10CQ8IV04 446 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 SMC2O95347 1197 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 KCNJ6P48051 423 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 TRDNQ13061 729 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 AIDAQ96BJ3 306 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 C8orf76Q96K31 380 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 IFNKQ9P0W0 207 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 SPTLC2O15270 562 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 KCNQ4P56696 695 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 MAP3K12Q12852 859 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 ARMCX5Q6P1M9 558 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 TMC6Q7Z403 805 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 L2HGDHQ9H9P8 463 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 FAM53CQ9NYF3 392 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 NLRP12P59046 1061 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 TPM4P67936 248 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 BRAPQ7Z569 592 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 MAGEB6Q8N7X4 407 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 USP21Q9UK80 565 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 BCORQ6W2J9 1755 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-206ENST00000414253 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.33■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 SLFN14P0C7P3 912 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 BCAMP50895 628 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 ALX1Q15699 326 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF202O95125 648 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 CHRNDQ07001 517 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 CYB5R4Q7L1T6 521 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 NRDCO43847 1150 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 FAM182BQ5T319 152 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 TUBB4AP04350 444 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 NCAPHQ15003 741 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
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FAAP20-206ENST00000414253 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 MBD4O95243 580 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 COL4A1P02462 1669 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 ZMYM6O95789 1325 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 C4AP0C0L4 1744 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 C4BP0C0L5 1744 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 BIN1O00499 593 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 CPLX1O14810 134 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 B4E1Z4 1266 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 CMA1P23946 247 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 TERF2Q15554 542 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC93Q567U6 631 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 SYT10Q6XYQ8 523 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 IKBKBO14920 756 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 ANO1Q5XXA6 986 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 ARMT1Q9H993 441 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-206ENST00000414253 ERFEQ4G0M1 354 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 PFKFB1P16118 471 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 CHD4Q14839 1912 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 KIF28PB7ZC32 967 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 NAPBQ9H115 298 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 FANCCQ00597 558 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 TAF3Q5VWG9 929 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 SMIM5Q71RC9 77 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 CERKQ8TCT0 537 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM87BQ96K49 555 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 TIGD1Q96MW7 591 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 INCENPQ9NQS7 918 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 TAF1P21675 1872 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 RGS22Q8NE09 1264 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 CCP110O43303 1012 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 SENP2Q9HC62 589 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF446Q9NWS9 450 aa28.23■■■□□ 2.11
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