RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 ANTXR2P58335 489 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 TEX11Q8IYF3 940 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 NCOA7Q8NI08 942 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 DTNBO60941 627 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 FOCADQ5VW36 1801 aa23.85■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 CXCL9Q07325 125 aa23.85■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.85■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.85■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 ME3Q16798 604 aa23.84■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.84■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.84■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 BRF1Q92994 677 aa23.84■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.84■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.84■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 PRC1O43663 620 aa23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 JDP2Q8WYK2 163 aa23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 GMLQ99445 158 aa23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 FLT1P17948 1338 aa23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.83■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 PRDM1O75626 825 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 TRDNQ13061 729 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 TOMM22Q9NS69 142 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 USP40Q9NVE5 1235 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 MYH1P12882 1939 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 KDM4AO75164 1064 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 PLCG2P16885 1265 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 MCM5P33992 734 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 ST3GAL1Q11201 340 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 PICALMQ13492 652 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 NECAB1Q8N987 351 aa23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 CACNB3P54284 484 aa23.81■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 FGD1P98174 961 aa23.81■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 CUL4AQ13619 759 aa23.81■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.81■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.81■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 PLCD1P51178 756 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 APOBRQ0VD83 1088 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 SBK1Q52WX2 424 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 C12orf60Q5U649 245 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 IL27Q8NEV9 243 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 DDIT3P35638 169 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 NFIAQ12857 509 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 STK3Q13188 491 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 CERS3Q8IU89 383 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 SHTN1A0MZ66 631 aa23.79■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.79■■□□□ 1.44e-10■□□□□ 10.9
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ODC1-202ENST00000405333 ANKRD1Q15327 319 aa23.79■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 CFAP100Q494V2 611 aa23.79■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 MRIQ9BWK5 157 aa23.79■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 SENP2Q9HC62 589 aa23.79■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.78■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.78■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.78■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.78■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.78■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.77■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 KRT23Q9C075 422 aa23.77■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 SBF1O95248 1867 aa23.77■■□□□ 1.4
ODC1-202ENST00000405333 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.76■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 FGRP09769 529 aa23.76■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.76■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.75■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.75■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 FZD9O00144 591 aa23.74■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.74■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 FBXL16Q8N461 479 aa23.74■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.74■■□□□ 1.39
ODC1-202ENST00000405333 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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