RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324685.10

RNF40-201, Transcript of ring finger protein 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF40, Length 5,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40-201ENST00000324685 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 VPS16Q9H269 839 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 MLKLQ8NB16 471 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 SLC27A2O14975 620 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 FANCCQ00597 558 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 PAK1Q13153 545 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 VPS52Q8N1B4 723 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 DCAF5Q96JK2 942 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 NEDD9Q14511 834 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 RLBP1P12271 317 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 ZNF365Q70YC5 407 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 TSPYL6Q8N831 410 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 CRCPO75575 148 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 GBP1P32455 592 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 KIFC2Q96AC6 838 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 SLC8A3P57103 927 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 DDB1Q16531 1140 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 NLRP12P59046 1061 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 GOLGA6CA6NDK9 693 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 RBSNQ9H1K0 784 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 TNNQ9UQP3 1299 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 ZNF75DP51815 510 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 NDUFAB1O14561 156 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 TSKSQ9UJT2 592 aa23.47■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 CETN3O15182 167 aa23.47■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 A0A1B0GUA9 196 aa23.47■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 SH3BP5O60239 455 aa23.47■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.47■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 TAF12Q16514 161 aa23.47■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 NAA25Q14CX7 972 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 NPATQ14207 1427 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 B4E1Z4 1266 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 ABCC1P33527 1531 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 VCX3BQ9H321 246 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 RASA3Q14644 834 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF40-201ENST00000324685 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.45■■□□□ 1.34
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RNF40-201ENST00000324685 TEX11Q8IYF3 940 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.45■■□□□ 1.34
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RNF40-201ENST00000324685 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 KRT9P35527 623 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 TTC38Q5R3I4 469 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.44■■□□□ 1.34
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RNF40-201ENST00000324685 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 INPP5BP32019 993 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 STRN3Q13033 797 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 GEN1Q17RS7 908 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 CERS3Q8IU89 383 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 ARHGAP6O43182 974 aa23.43■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 PPP2R5BQ15173 497 aa23.43■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 PAK2Q13177 524 aa23.43■■□□□ 1.34
RNF40-201ENST00000324685 TRPC3Q13507 836 aa23.43■■□□□ 1.34
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