RNA–Protein interactions for RNA: YKL157W

APE2, Transcript of Aminopeptidase yscII, yeast

Gene APE2, Length 2,859 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APE2	YKL157W	VTH1	P40438	1549 aa		5.23	□□□□□ -1.57
APE2	YKL157W	VTH2	P40890	1549 aa		5.23	□□□□□ -1.57
APE2	YKL157W	IRC20	Q06554	1556 aa		5.23	□□□□□ -1.57
APE2	YKL157W	SNT2	P53127	1403 aa		5.23	□□□□□ -1.57
APE2	YKL157W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	TSC11	P40061	1430 aa		5.21	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	CDC25	P04821	1589 aa		5.2	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	PAN1	P32521	1480 aa		5.18	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	NTE1	Q04958	1679 aa		5.18	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.18	□□□□□ -1.58	not detected
APE2	YKL157W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	GCN2	P15442	1659 aa		5.16	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	VPS15	P22219	1454 aa		5.16	□□□□□ -1.58
APE2	YKL157W	CAT8	P39113	1433 aa		5.15	□□□□□ -1.59
APE2	YKL157W	DNF1	P32660	1571 aa		5.14	□□□□□ -1.59
APE2	YKL157W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
APE2	YKL157W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
APE2	YKL157W	NUP159	P40477	1460 aa		5.12	□□□□□ -1.59
APE2	YKL157W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
APE2	YKL157W	PDR12	Q02785	1511 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	IQG1	Q12280	1495 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	SRB8	P25648	1427 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	GDB1	Q06625	1536 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	IFH1	P39520	1085 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	SPO14	P36126	1683 aa		5.04	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	YOR093C	Q12275	1648 aa		5.04	□□□□□ -1.6
APE2	YKL157W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		5.02	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		5.02	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		5.02	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	MMS1	Q06211	1407 aa		5	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	RTT106	P40161	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	SPT7	P35177	1332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	MHP1	P43638	1398 aa		4.96	□□□□□ -1.61
APE2	YKL157W	BUD3	P25558	1636 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	CAB3	P36076	571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	LTE1	P07866	1435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	VMR1	P38735	1592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APE2	YKL157W	MET5	P47169	1442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	NUP192	P47054	1683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	RAV1	P47104	1357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	TFA1	P36100	482 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	MET10	P39692	1035 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	PDR11	P40550	1411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	IML1	P47170	1584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	CKB1	P43639	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APE2	YKL157W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	BNR1	P40450	1375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	IOC4	Q04213	475 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	PAF1	P38351	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	YPR148C	Q06523	435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	DRS2	P39524	1355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	SNF2	P22082	1703 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	SIS2	P36024	562 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APE2	YKL157W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	SCT1	P32784	759 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	ESL2	P36168	1195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	NST1	P53935	1240 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	LEU3	P08638	886 aa		4.73	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	CDC45	Q08032	650 aa		4.73	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	TAF5	P38129	798 aa		4.71	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
APE2	YKL157W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	IME2	P32581	645 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	OPY1	P38271	328 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	YIR014W	P40570	242 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
APE2	YKL157W	FKH1	P40466	484 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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