RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W NUP159P40477 1460 aa16.93■□□□□ 0.3
RNQ1YCL028W SNT2P53127 1403 aa16.92■□□□□ 0.3
RNQ1YCL028W NTE1Q04958 1679 aa16.89■□□□□ 0.29
RNQ1YCL028W MLP2P40457 1679 aa16.88■□□□□ 0.29
RNQ1YCL028W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
RNQ1YCL028W RTT106P40161 455 aa16.87■□□□□ 0.29
RNQ1YCL028W IFH1P39520 1085 aa16.86■□□□□ 0.29
RNQ1YCL028W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RNQ1YCL028W ULS1Q08562 1619 aa16.83■□□□□ 0.28
RNQ1YCL028W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RNQ1YCL028W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RNQ1YCL028W MET10P39692 1035 aa16.72■□□□□ 0.27
RNQ1YCL028W YRF1-1P0CX20 1796 aa16.71■□□□□ 0.27
RNQ1YCL028W YRF1-5P0CX21 1796 aa16.71■□□□□ 0.27
RNQ1YCL028W YRF1-8P0CX22 1796 aa16.71■□□□□ 0.27
RNQ1YCL028W VPS15P22219 1454 aa16.69■□□□□ 0.26
RNQ1YCL028W LTE1P07866 1435 aa16.67■□□□□ 0.26
RNQ1YCL028W IRC20Q06554 1556 aa16.62■□□□□ 0.25
RNQ1YCL028W PDR12Q02785 1511 aa16.58■□□□□ 0.24
RNQ1YCL028W SPO14P36126 1683 aa16.56■□□□□ 0.24
RNQ1YCL028W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
RNQ1YCL028W TY3B-GQ99315 1547 aa16.54■□□□□ 0.24
RNQ1YCL028W CAT8P39113 1433 aa16.53■□□□□ 0.24
RNQ1YCL028W GDB1Q06625 1536 aa16.5■□□□□ 0.23
RNQ1YCL028W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RNQ1YCL028W PDR10P51533 1564 aa16.47■□□□□ 0.23
RNQ1YCL028W DRS2P39524 1355 aa16.43■□□□□ 0.22
RNQ1YCL028W YBT1P32386 1661 aa16.43■□□□□ 0.22
RNQ1YCL028W NUP170P38181 1502 aa16.4■□□□□ 0.22
RNQ1YCL028W CKB1P43639 278 aa16.4■□□□□ 0.22
RNQ1YCL028W ITT1Q04638 464 aa16.4■□□□□ 0.22
RNQ1YCL028W IQG1Q12280 1495 aa16.39■□□□□ 0.21
RNQ1YCL028W BNI1P41832 1953 aa16.38■□□□□ 0.21
RNQ1YCL028W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
RNQ1YCL028W BUD3P25558 1636 aa16.3■□□□□ 0.2
RNQ1YCL028W SSM4P40318 1319 aa16.27■□□□□ 0.2
RNQ1YCL028W SRB8P25648 1427 aa16.27■□□□□ 0.19
RNQ1YCL028W YSP2Q06681 1438 aa16.23■□□□□ 0.19
RNQ1YCL028W MMS1Q06211 1407 aa16.21■□□□□ 0.19
RNQ1YCL028W TRM3Q07527 1436 aa16.2■□□□□ 0.18
RNQ1YCL028W DOP1Q03921 1698 aa16.14■□□□□ 0.18
RNQ1YCL028W BNR1P40450 1375 aa16.14■□□□□ 0.17
RNQ1YCL028W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RNQ1YCL028W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RNQ1YCL028W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RNQ1YCL028W DNF2Q12675 1612 aa16.01■□□□□ 0.15
RNQ1YCL028W ABP1P15891 592 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RNQ1YCL028W MIF2P35201 549 aa15.92■□□□□ 0.14
RNQ1YCL028W FAP1P53971 965 aa15.83■□□□□ 0.12
RNQ1YCL028W GCN2P15442 1659 aa15.83■□□□□ 0.12
RNQ1YCL028W URN1Q06525 465 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
RNQ1YCL028W YAP3P38749 330 aa15.77■□□□□ 0.12
RNQ1YCL028W YOR093CQ12275 1648 aa15.76■□□□□ 0.11
RNQ1YCL028W PAF1P38351 445 aa15.72■□□□□ 0.11
RNQ1YCL028W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
RNQ1YCL028W IPL1P38991 367 aa15.7■□□□□ 0.1
RNQ1YCL028W VMR1P38735 1592 aa15.7■□□□□ 0.1
RNQ1YCL028W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
RNQ1YCL028W NOP7P53261 605 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
RNQ1YCL028W IML1P47170 1584 aa15.66■□□□□ 0.1
RNQ1YCL028W TYS1P36421 394 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
RNQ1YCL028W PDR11P40550 1411 aa15.62■□□□□ 0.09
RNQ1YCL028W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
RNQ1YCL028W DNF3Q12674 1656 aa15.58■□□□□ 0.08
RNQ1YCL028W RAV1P47104 1357 aa15.56■□□□□ 0.08
RNQ1YCL028W RTC1Q08281 1341 aa15.5■□□□□ 0.07
RNQ1YCL028W MAK10Q02197 733 aa15.5■□□□□ 0.07
RNQ1YCL028W HAP1P0CE41 1502 aa15.44■□□□□ 0.06
RNQ1YCL028W YFR006WP43590 535 aa15.41■□□□□ 0.06
RNQ1YCL028W TAF5P38129 798 aa15.36■□□□□ 0.05
RNQ1YCL028W ESL2P36168 1195 aa15.34■□□□□ 0.05
RNQ1YCL028W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
RNQ1YCL028W ALD4P46367 519 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
RNQ1YCL028W NUP192P47054 1683 aa15.3■□□□□ 0.04
RNQ1YCL028W MRX12P47084 519 aa15.3■□□□□ 0.04
RNQ1YCL028W RAD9P14737 1309 aa15.28■□□□□ 0.04
RNQ1YCL028W POL5P39985 1022 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
RNQ1YCL028W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
RNQ1YCL028W CAB1Q04430 367 aa15.27■□□□□ 0.04
RNQ1YCL028W BCK1Q01389 1478 aa15.26■□□□□ 0.03
RNQ1YCL028W KRE5P22023 1365 aa15.25■□□□□ 0.03
RNQ1YCL028W RIA1P53893 1110 aa15.24■□□□□ 0.03
RNQ1YCL028W KIP3P53086 805 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RNQ1YCL028W NAP1P25293 417 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RNQ1YCL028W TAF8Q03750 510 aa15.19■□□□□ 0.02
RNQ1YCL028W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RNQ1YCL028W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RNQ1YCL028W USO1P25386 1790 aa15.16■□□□□ 0.02
RNQ1YCL028W YMR196WQ04336 1088 aa15.16■□□□□ 0.02
RNQ1YCL028W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RNQ1YCL028W SPE2P21182 396 aa15.13■□□□□ 0.01
RNQ1YCL028W ISW2Q08773 1120 aa15.11■□□□□ 0.01
RNQ1YCL028W PRI1P10363 409 aa15.09■□□□□ 0.01
RNQ1YCL028W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
RNQ1YCL028W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
RNQ1YCL028W THI12P42883 340 aa15.08■□□□□ 0
RNQ1YCL028W THI5P43534 340 aa15.08■□□□□ 0
RNQ1YCL028W THI11P47183 340 aa15.08■□□□□ 0
RNQ1YCL028W THI13Q07748 340 aa15.08■□□□□ 0
RNQ1YCL028W SCT1P32784 759 aa15.06■□□□□ 0
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