RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000642113.1

TMC3-AS1-207, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

BASIC

Gene TMC3-AS1, Length 2,043 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.29■□□□□ 0.36
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.29■□□□□ 0.36
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARHGEF11O15085 1522 aa17.26■□□□□ 0.35
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NUP160Q12769 1436 aa17.24■□□□□ 0.35
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.23■□□□□ 0.35
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.16■□□□□ 0.34
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SHROOM2Q13796 1616 aa17.14■□□□□ 0.33
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARAP1Q96P48 1450 aa17.13■□□□□ 0.33
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.13■□□□□ 0.33
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.09■□□□□ 0.33
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PRXQ9BXM0 1461 aa17.09■□□□□ 0.33
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.09■□□□□ 0.33
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.08■□□□□ 0.33
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.08■□□□□ 0.32
TMC3-AS1-207ENST00000642113 JPH4Q96JJ6 628 aa17.07■□□□□ 0.32
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.05■□□□□ 0.32
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EEA1Q15075 1411 aa17.05■□□□□ 0.32
TMC3-AS1-207ENST00000642113 IQGAP2Q13576 1575 aa17.04■□□□□ 0.32
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.01■□□□□ 0.31
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIF21BO75037 1637 aa16.95■□□□□ 0.3
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DISP1Q96F81 1524 aa16.92■□□□□ 0.3
TMC3-AS1-207ENST00000642113 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.92■□□□□ 0.3
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIAA0556O60303 1618 aa16.89■□□□□ 0.29
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.88■□□□□ 0.29
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.84■□□□□ 0.29
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.84■□□□□ 0.29
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GOLGA3Q08378 1498 aa16.83■□□□□ 0.29
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PTPRGP23470 1445 aa16.83■□□□□ 0.29
TMC3-AS1-207ENST00000642113 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TMC3-AS1-207ENST00000642113 P3H3Q8IVL6 736 aa16.8■□□□□ 0.28
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SAMD9Q5K651 1589 aa16.79■□□□□ 0.28
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.73■□□□□ 0.27
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TMC3-AS1-207ENST00000642113 UACAQ9BZF9 1416 aa16.73■□□□□ 0.27
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.71■□□□□ 0.27
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCC2Q92887 1545 aa16.71■□□□□ 0.27
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCA8O94911 1581 aa16.69■□□□□ 0.26
TMC3-AS1-207ENST00000642113 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.68■□□□□ 0.26
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.67■□□□□ 0.26
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.67■□□□□ 0.26
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.65■□□□□ 0.26
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MAPKBP1O60336 1514 aa16.65■□□□□ 0.26
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ARID3CA6NKF2 412 aa16.63■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.63■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-207ENST00000642113 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.63■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-207ENST00000642113 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.62■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-207ENST00000642113 DIP2BQ9P265 1576 aa16.6■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ASXL2Q76L83 1435 aa16.59■□□□□ 0.25
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.57■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-207ENST00000642113 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TSPOAP1O95153 1857 aa16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CLIP1P30622 1438 aa16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ATP10BO94823 1461 aa16.55■□□□□ 0.24
TMC3-AS1-207ENST00000642113 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.51■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.51■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FMN1Q68DA7 1419 aa16.51■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CEP162Q5TB80 1403 aa16.5■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 HECW1Q76N89 1606 aa16.47■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KCNH8Q96L42 1107 aa16.46■□□□□ 0.23
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GLI2P10070 1586 aa16.45■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.44■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.4■□□□□ 0.22
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.39■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-207ENST00000642113 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.37■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-207ENST00000642113 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.36■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-207ENST00000642113 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.36■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CD109Q6YHK3 1445 aa16.34■□□□□ 0.21
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KIF14Q15058 1648 aa16.33■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.33■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.32■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.32■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 KDM6BO15054 1643 aa16.32■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.32■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MSH5O43196 834 aa16.29■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.28■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.27■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-207ENST00000642113 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-207ENST00000642113 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-207ENST00000642113 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms