RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641286.1

SAMMSON-211, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

Gene SAMMSON, Length 1,645 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-211ENST00000641286 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.04■□□□□ 0.32
SAMMSON-211ENST00000641286 SHROOM2Q13796 1616 aa17.03■□□□□ 0.32
SAMMSON-211ENST00000641286 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SAMMSON-211ENST00000641286 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.02■□□□□ 0.32
SAMMSON-211ENST00000641286 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SAMMSON-211ENST00000641286 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.94■□□□□ 0.3
SAMMSON-211ENST00000641286 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.92■□□□□ 0.3
SAMMSON-211ENST00000641286 JPH4Q96JJ6 628 aa16.92■□□□□ 0.3
SAMMSON-211ENST00000641286 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.91■□□□□ 0.3
SAMMSON-211ENST00000641286 IQGAP2Q13576 1575 aa16.9■□□□□ 0.3
SAMMSON-211ENST00000641286 EEA1Q15075 1411 aa16.88■□□□□ 0.29
SAMMSON-211ENST00000641286 PRXQ9BXM0 1461 aa16.83■□□□□ 0.28
SAMMSON-211ENST00000641286 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
SAMMSON-211ENST00000641286 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.79■□□□□ 0.28
SAMMSON-211ENST00000641286 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.78■□□□□ 0.28
SAMMSON-211ENST00000641286 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SAMMSON-211ENST00000641286 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.76■□□□□ 0.27
SAMMSON-211ENST00000641286 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.75■□□□□ 0.27
SAMMSON-211ENST00000641286 KIAA0556O60303 1618 aa16.74■□□□□ 0.27
SAMMSON-211ENST00000641286 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.74■□□□□ 0.27
SAMMSON-211ENST00000641286 DISP1Q96F81 1524 aa16.74■□□□□ 0.27
SAMMSON-211ENST00000641286 KIF21BO75037 1637 aa16.71■□□□□ 0.27
SAMMSON-211ENST00000641286 PTPRGP23470 1445 aa16.7■□□□□ 0.26
SAMMSON-211ENST00000641286 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.7■□□□□ 0.26
SAMMSON-211ENST00000641286 GOLGA3Q08378 1498 aa16.66■□□□□ 0.26
SAMMSON-211ENST00000641286 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SAMMSON-211ENST00000641286 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.65■□□□□ 0.26
SAMMSON-211ENST00000641286 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
SAMMSON-211ENST00000641286 P3H3Q8IVL6 736 aa16.61■□□□□ 0.25
SAMMSON-211ENST00000641286 SAMD9Q5K651 1589 aa16.6■□□□□ 0.25
SAMMSON-211ENST00000641286 ABCC2Q92887 1545 aa16.6■□□□□ 0.25
SAMMSON-211ENST00000641286 UACAQ9BZF9 1416 aa16.6■□□□□ 0.25
SAMMSON-211ENST00000641286 MAPKBP1O60336 1514 aa16.58■□□□□ 0.25
SAMMSON-211ENST00000641286 CEP162Q5TB80 1403 aa16.58■□□□□ 0.25
SAMMSON-211ENST00000641286 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SAMMSON-211ENST00000641286 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.57■□□□□ 0.24
SAMMSON-211ENST00000641286 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SAMMSON-211ENST00000641286 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.56■□□□□ 0.24
SAMMSON-211ENST00000641286 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.56■□□□□ 0.24
SAMMSON-211ENST00000641286 TSPOAP1O95153 1857 aa16.55■□□□□ 0.24
SAMMSON-211ENST00000641286 DIP2BQ9P265 1576 aa16.55■□□□□ 0.24
SAMMSON-211ENST00000641286 ABCA8O94911 1581 aa16.53■□□□□ 0.24
SAMMSON-211ENST00000641286 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.51■□□□□ 0.23
SAMMSON-211ENST00000641286 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SAMMSON-211ENST00000641286 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.5■□□□□ 0.23
SAMMSON-211ENST00000641286 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.49■□□□□ 0.23
SAMMSON-211ENST00000641286 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.49■□□□□ 0.23
SAMMSON-211ENST00000641286 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.49■□□□□ 0.23
SAMMSON-211ENST00000641286 ASXL2Q76L83 1435 aa16.49■□□□□ 0.23
SAMMSON-211ENST00000641286 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.49■□□□□ 0.23
SAMMSON-211ENST00000641286 ARID3CA6NKF2 412 aa16.48■□□□□ 0.23
SAMMSON-211ENST00000641286 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.4■□□□□ 0.22
SAMMSON-211ENST00000641286 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.4■□□□□ 0.22
SAMMSON-211ENST00000641286 CLIP1P30622 1438 aa16.4■□□□□ 0.22
SAMMSON-211ENST00000641286 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SAMMSON-211ENST00000641286 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SAMMSON-211ENST00000641286 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SAMMSON-211ENST00000641286 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SAMMSON-211ENST00000641286 GLI2P10070 1586 aa16.37■□□□□ 0.21
SAMMSON-211ENST00000641286 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.37■□□□□ 0.21
SAMMSON-211ENST00000641286 ATP10BO94823 1461 aa16.37■□□□□ 0.21
SAMMSON-211ENST00000641286 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SAMMSON-211ENST00000641286 KCNH8Q96L42 1107 aa16.35■□□□□ 0.21
SAMMSON-211ENST00000641286 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 KDM6BO15054 1643 aa16.33■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.32■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 HECW1Q76N89 1606 aa16.32■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.31■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 FMN1Q68DA7 1419 aa16.31■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 HRCP23327 699 aa16.3■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.29■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
SAMMSON-211ENST00000641286 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.25■□□□□ 0.19
SAMMSON-211ENST00000641286 CD109Q6YHK3 1445 aa16.24■□□□□ 0.19
SAMMSON-211ENST00000641286 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.24■□□□□ 0.19
SAMMSON-211ENST00000641286 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.2■□□□□ 0.18
SAMMSON-211ENST00000641286 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.19■□□□□ 0.18
SAMMSON-211ENST00000641286 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.18■□□□□ 0.18
SAMMSON-211ENST00000641286 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.17■□□□□ 0.18
SAMMSON-211ENST00000641286 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
SAMMSON-211ENST00000641286 KIF14Q15058 1648 aa16.17■□□□□ 0.18
SAMMSON-211ENST00000641286 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.16■□□□□ 0.18
SAMMSON-211ENST00000641286 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SAMMSON-211ENST00000641286 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.14■□□□□ 0.17
SAMMSON-211ENST00000641286 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.14■□□□□ 0.17
SAMMSON-211ENST00000641286 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SAMMSON-211ENST00000641286 APLP2Q06481 763 aa16.1■□□□□ 0.17
SAMMSON-211ENST00000641286 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.1■□□□□ 0.17
SAMMSON-211ENST00000641286 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SAMMSON-211ENST00000641286 FANCAO15360 1455 aa16.07■□□□□ 0.16
SAMMSON-211ENST00000641286 NEO1Q92859 1461 aa16.06■□□□□ 0.16
SAMMSON-211ENST00000641286 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.05■□□□□ 0.16
SAMMSON-211ENST00000641286 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.04■□□□□ 0.16
SAMMSON-211ENST00000641286 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.04■□□□□ 0.16
SAMMSON-211ENST00000641286 RICTORQ6R327 1708 aa16.03■□□□□ 0.16
SAMMSON-211ENST00000641286 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.03■□□□□ 0.16
SAMMSON-211ENST00000641286 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.03■□□□□ 0.16
SAMMSON-211ENST00000641286 PREX2Q70Z35 1606 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms