RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640484.1

SZT2-217, Transcript of SZT2, KICSTOR complex subunit, humanhuman

TSL 5

Gene SZT2, Length 2,266 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2-217ENST00000640484 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SZT2-217ENST00000640484 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SZT2-217ENST00000640484 ITGAEP38570 1179 aa22.96■■□□□ 1.27
SZT2-217ENST00000640484 TOP2BQ02880 1626 aa22.95■■□□□ 1.26
SZT2-217ENST00000640484 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SZT2-217ENST00000640484 PRXQ9BXM0 1461 aa22.93■■□□□ 1.26
SZT2-217ENST00000640484 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.92■■□□□ 1.26
SZT2-217ENST00000640484 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.89■■□□□ 1.26
SZT2-217ENST00000640484 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.89■■□□□ 1.26
SZT2-217ENST00000640484 PRDM2Q13029 1718 aa22.88■■□□□ 1.25
SZT2-217ENST00000640484 TRIM52Q96A61 297 aa22.85■■□□□ 1.25
SZT2-217ENST00000640484 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SZT2-217ENST00000640484 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.84■■□□□ 1.25
SZT2-217ENST00000640484 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.83■■□□□ 1.24
SZT2-217ENST00000640484 ANP32CO43423 234 aa22.82■■□□□ 1.24
SZT2-217ENST00000640484 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SZT2-217ENST00000640484 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.81■■□□□ 1.24
SZT2-217ENST00000640484 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.8■■□□□ 1.24
SZT2-217ENST00000640484 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.79■■□□□ 1.24
SZT2-217ENST00000640484 MAP3K1Q13233 1512 aa22.78■■□□□ 1.24
SZT2-217ENST00000640484 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.78■■□□□ 1.24
SZT2-217ENST00000640484 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SZT2-217ENST00000640484 TIAM1Q13009 1591 aa22.72■■□□□ 1.23
SZT2-217ENST00000640484 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.72■■□□□ 1.23
SZT2-217ENST00000640484 CUX1P39880 1505 aa22.71■■□□□ 1.23
SZT2-217ENST00000640484 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.66■■□□□ 1.22
SZT2-217ENST00000640484 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.65■■□□□ 1.22
SZT2-217ENST00000640484 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.62■■□□□ 1.21
SZT2-217ENST00000640484 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SZT2-217ENST00000640484 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.58■■□□□ 1.21
SZT2-217ENST00000640484 ERCC6Q03468 1493 aa22.57■■□□□ 1.2
SZT2-217ENST00000640484 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.57■■□□□ 1.2
SZT2-217ENST00000640484 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
SZT2-217ENST00000640484 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SZT2-217ENST00000640484 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SZT2-217ENST00000640484 TOPBP1Q92547 1522 aa22.53■■□□□ 1.2
SZT2-217ENST00000640484 KIF27Q86VH2 1401 aa22.53■■□□□ 1.2
SZT2-217ENST00000640484 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SZT2-217ENST00000640484 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.51■■□□□ 1.19
SZT2-217ENST00000640484 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.49■■□□□ 1.19
SZT2-217ENST00000640484 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.49■■□□□ 1.19
SZT2-217ENST00000640484 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.48■■□□□ 1.19
SZT2-217ENST00000640484 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
SZT2-217ENST00000640484 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.44■■□□□ 1.18
SZT2-217ENST00000640484 TONSLQ96HA7 1378 aa22.43■■□□□ 1.18
SZT2-217ENST00000640484 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.43■■□□□ 1.18
SZT2-217ENST00000640484 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SZT2-217ENST00000640484 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.4■■□□□ 1.18
SZT2-217ENST00000640484 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SZT2-217ENST00000640484 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SZT2-217ENST00000640484 NCOA2Q15596 1464 aa22.39■■□□□ 1.18
SZT2-217ENST00000640484 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SZT2-217ENST00000640484 NBR1Q14596 966 aa22.36■■□□□ 1.17
SZT2-217ENST00000640484 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SZT2-217ENST00000640484 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SZT2-217ENST00000640484 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.34■■□□□ 1.17
SZT2-217ENST00000640484 UACAQ9BZF9 1416 aa22.32■■□□□ 1.16
SZT2-217ENST00000640484 WDR62O43379 1518 aa22.32■■□□□ 1.16
SZT2-217ENST00000640484 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.32■■□□□ 1.16
SZT2-217ENST00000640484 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.31■■□□□ 1.16
SZT2-217ENST00000640484 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.3■■□□□ 1.16
SZT2-217ENST00000640484 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SZT2-217ENST00000640484 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.28■■□□□ 1.16
SZT2-217ENST00000640484 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SZT2-217ENST00000640484 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.27■■□□□ 1.16
SZT2-217ENST00000640484 HFM1A2PYH4 1435 aa22.26■■□□□ 1.15
SZT2-217ENST00000640484 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SZT2-217ENST00000640484 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SZT2-217ENST00000640484 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SZT2-217ENST00000640484 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SZT2-217ENST00000640484 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
SZT2-217ENST00000640484 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SZT2-217ENST00000640484 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.19■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.18■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 CCDC184Q52MB2 194 aa22.18■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.18■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.145e-6■■■□□ 16.9
SZT2-217ENST00000640484 IGF1RP08069 1367 aa22.16■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.15■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SZT2-217ENST00000640484 IL27Q8NEV9 243 aa22.14■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 NCOA1Q15788 1441 aa22.13■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 HECW1Q76N89 1606 aa22.13■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 NAIPQ13075 1403 aa22.11■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.11■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 MRS2Q9HD23 443 aa22.09■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 PTPRKQ15262 1439 aa22.09■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 USP35Q9P2H5 1018 aa22.09■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.08■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 CCDC7Q96M83 1385 aa22.08■■□□□ 1.13
SZT2-217ENST00000640484 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.08■■□□□ 1.12
SZT2-217ENST00000640484 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
SZT2-217ENST00000640484 AKNAQ7Z591 1439 aa22.07■■□□□ 1.12
SZT2-217ENST00000640484 IFT140Q96RY7 1462 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms