RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637888.1

AC107871.1-201, humanhuman

TSL 5

Gene AC107871.1, Length 2,941 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC107871.1-201ENST00000637888 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.73■■□□□ 1.55
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AC107871.1-201ENST00000637888 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
AC107871.1-201ENST00000637888 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.71■■□□□ 1.55
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AC107871.1-201ENST00000637888 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
AC107871.1-201ENST00000637888 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.67■■□□□ 1.54
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AC107871.1-201ENST00000637888 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
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AC107871.1-201ENST00000637888 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.54■■□□□ 1.52
AC107871.1-201ENST00000637888 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
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AC107871.1-201ENST00000637888 MAP3K1Q13233 1512 aa24.42■■□□□ 1.5
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AC107871.1-201ENST00000637888 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.36■■□□□ 1.49
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AC107871.1-201ENST00000637888 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.34■■□□□ 1.49
AC107871.1-201ENST00000637888 ARID3CA6NKF2 412 aa24.33■■□□□ 1.49
AC107871.1-201ENST00000637888 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.33■■□□□ 1.49
AC107871.1-201ENST00000637888 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.31■■□□□ 1.48
AC107871.1-201ENST00000637888 WDR97A6NE52 1622 aa24.31■■□□□ 1.48
AC107871.1-201ENST00000637888 FMN1Q68DA7 1419 aa24.31■■□□□ 1.48
AC107871.1-201ENST00000637888 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.3■■□□□ 1.48
AC107871.1-201ENST00000637888 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.483e-6■■■□□ 19
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AC107871.1-201ENST00000637888 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.3■■□□□ 1.48
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AC107871.1-201ENST00000637888 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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AC107871.1-201ENST00000637888 NCOA2Q15596 1464 aa24.11■■□□□ 1.45
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AC107871.1-201ENST00000637888 ERCC6Q03468 1493 aa23.89■■□□□ 1.42
AC107871.1-201ENST00000637888 IFT140Q96RY7 1462 aa23.89■■□□□ 1.42
AC107871.1-201ENST00000637888 MSH5O43196 834 aa23.88■■□□□ 1.41
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AC107871.1-201ENST00000637888 GRIN2AQ12879 1464 aa23.77■■□□□ 1.4
AC107871.1-201ENST00000637888 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
AC107871.1-201ENST00000637888 KDM6BO15054 1643 aa23.73■■□□□ 1.39
AC107871.1-201ENST00000637888 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
AC107871.1-201ENST00000637888 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
AC107871.1-201ENST00000637888 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
AC107871.1-201ENST00000637888 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.71■■□□□ 1.39
AC107871.1-201ENST00000637888 KIAA0556O60303 1618 aa23.71■■□□□ 1.39
AC107871.1-201ENST00000637888 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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