RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ARAP1Q96P48 1450 aa39.37■■■■□ 3.89
CAPNS1-215ENST00000628018 FBLN2P98095 1184 aa39.34■■■■□ 3.89
CAPNS1-215ENST00000628018 IQGAP2Q13576 1575 aa39.33■■■■□ 3.89
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.31■■■■□ 3.88
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.31■■■■□ 3.88
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.3■■■■□ 3.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP170Q5SW79 1584 aa39.3■■■■□ 3.88
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP160Q12769 1436 aa39.29■■■■□ 3.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CHD1O14646 1710 aa39.25■■■■□ 3.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD9Q5K651 1589 aa39.22■■■■□ 3.87
CAPNS1-215ENST00000628018 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.16■■■■□ 3.86
CAPNS1-215ENST00000628018 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.09■■■■□ 3.85
CAPNS1-215ENST00000628018 P3H3Q8IVL6 736 aa39.09■■■■□ 3.85
CAPNS1-215ENST00000628018 DISP1Q96F81 1524 aa38.97■■■■□ 3.83
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0556O60303 1618 aa38.94■■■■□ 3.82
CAPNS1-215ENST00000628018 FMN1Q68DA7 1419 aa38.93■■■■□ 3.82
CAPNS1-215ENST00000628018 JPH4Q96JJ6 628 aa38.93■■■■□ 3.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
CAPNS1-215ENST00000628018 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.83■■■■□ 3.81
CAPNS1-215ENST00000628018 APLP2Q06481 763 aa38.83■■■■□ 3.81
CAPNS1-215ENST00000628018 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
CAPNS1-215ENST00000628018 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.82■■■■□ 3.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SHROOM2Q13796 1616 aa38.81■■■■□ 3.8
CAPNS1-215ENST00000628018 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.8■■■■□ 3.8
CAPNS1-215ENST00000628018 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.8■■■■□ 3.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K1Q13233 1512 aa38.72■■■■□ 3.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TIAM1Q13009 1591 aa38.66■■■■□ 3.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.62■■■■□ 3.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-215ENST00000628018 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
CAPNS1-215ENST00000628018 HECW1Q76N89 1606 aa38.57■■■■□ 3.76
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-215ENST00000628018 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-215ENST00000628018 OSCARQ8IYS5 282 aa38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-215ENST00000628018 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.52■■■■□ 3.76
CAPNS1-215ENST00000628018 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.51■■■■□ 3.76
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.48■■■■□ 3.75
CAPNS1-215ENST00000628018 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.48■■■■□ 3.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.46■■■■□ 3.75
CAPNS1-215ENST00000628018 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.44■■■■□ 3.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRGP23470 1445 aa38.44■■■■□ 3.74
CAPNS1-215ENST00000628018 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCA8O94911 1581 aa38.41■■■■□ 3.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.72
CAPNS1-215ENST00000628018 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-215ENST00000628018 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-215ENST00000628018 UACAQ9BZF9 1416 aa38.23■■■■□ 3.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ARID3CA6NKF2 412 aa38.21■■■■□ 3.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCC2Q92887 1545 aa38.14■■■■□ 3.7
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP10BO94823 1461 aa38.14■■■■□ 3.7
CAPNS1-215ENST00000628018 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
CAPNS1-215ENST00000628018 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.09■■■■□ 3.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
CAPNS1-215ENST00000628018 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.09■■■■□ 3.69
CAPNS1-215ENST00000628018 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
CAPNS1-215ENST00000628018 NCOA2Q15596 1464 aa38.05■■■■□ 3.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF11O15085 1522 aa38.04■■■■□ 3.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.96■■■■□ 3.67
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.93■■■■□ 3.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-215ENST00000628018 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.66
CAPNS1-215ENST00000628018 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.85■■■■□ 3.65
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF14Q15058 1648 aa37.83■■■■□ 3.65
CAPNS1-215ENST00000628018 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-215ENST00000628018 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-215ENST00000628018 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-215ENST00000628018 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MIA2Q96PC5 1412 aa37.72■■■■□ 3.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.62■■■■□ 3.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-215ENST00000628018 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.56■■■■□ 3.66e-24■■□□□ 13
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-215ENST00000628018 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGAEP38570 1179 aa37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ASXL2Q76L83 1435 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNH8Q96L42 1107 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PREX2Q70Z35 1606 aa37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
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