RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623882.3

CERS1-204, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-204ENST00000623882 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CERS1-204ENST00000623882 CUL7Q14999 1698 aa35.62■■■■□ 3.29
CERS1-204ENST00000623882 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.61■■■■□ 3.29
CERS1-204ENST00000623882 WDR97A6NE52 1622 aa35.61■■■■□ 3.29
CERS1-204ENST00000623882 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.6■■■■□ 3.29
CERS1-204ENST00000623882 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.58■■■■□ 3.29
CERS1-204ENST00000623882 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
CERS1-204ENST00000623882 MAP3K1Q13233 1512 aa35.56■■■■□ 3.28
CERS1-204ENST00000623882 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.54■■■■□ 3.28
CERS1-204ENST00000623882 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.52■■■■□ 3.28
CERS1-204ENST00000623882 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.51■■■■□ 3.27
CERS1-204ENST00000623882 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.48■■■■□ 3.27
CERS1-204ENST00000623882 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.44■■■■□ 3.26
CERS1-204ENST00000623882 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CERS1-204ENST00000623882 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.4■■■■□ 3.26
CERS1-204ENST00000623882 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.39■■■■□ 3.26
CERS1-204ENST00000623882 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.38■■■■□ 3.25
CERS1-204ENST00000623882 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.37■■■■□ 3.25
CERS1-204ENST00000623882 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
CERS1-204ENST00000623882 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
CERS1-204ENST00000623882 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.33■■■■□ 3.25
CERS1-204ENST00000623882 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.28■■■■□ 3.24
CERS1-204ENST00000623882 FMN1Q68DA7 1419 aa35.28■■■■□ 3.24
CERS1-204ENST00000623882 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CERS1-204ENST00000623882 NEUROD1Q13562 356 aa35.25■■■■□ 3.23
CERS1-204ENST00000623882 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.24■■■■□ 3.23
CERS1-204ENST00000623882 SAMD9Q5K651 1589 aa35.2■■■■□ 3.23
CERS1-204ENST00000623882 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.19■■■■□ 3.22
CERS1-204ENST00000623882 MIER1Q8N108 512 aa35.19■■■■□ 3.22
CERS1-204ENST00000623882 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CERS1-204ENST00000623882 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.18■■■■□ 3.22
CERS1-204ENST00000623882 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.12■■■■□ 3.21
CERS1-204ENST00000623882 PBRM1Q86U86 1689 aa35.11■■■■□ 3.21
CERS1-204ENST00000623882 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.08■■■■□ 3.21
CERS1-204ENST00000623882 MAPKBP1O60336 1514 aa35.07■■■■□ 3.21
CERS1-204ENST00000623882 GRIN2BQ13224 1484 aa35.05■■■■□ 3.2
CERS1-204ENST00000623882 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CERS1-204ENST00000623882 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CERS1-204ENST00000623882 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
CERS1-204ENST00000623882 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.01■■■■□ 3.2
CERS1-204ENST00000623882 ADAMTS12P58397 1594 aa34.99■■■■□ 3.19
CERS1-204ENST00000623882 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.96■■■■□ 3.19
CERS1-204ENST00000623882 ARID3CA6NKF2 412 aa34.93■■■■□ 3.18
CERS1-204ENST00000623882 NCOA2Q15596 1464 aa34.93■■■■□ 3.18
CERS1-204ENST00000623882 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.93■■■■□ 3.18
CERS1-204ENST00000623882 IQGAP2Q13576 1575 aa34.92■■■■□ 3.18
CERS1-204ENST00000623882 IFT140Q96RY7 1462 aa34.9■■■■□ 3.18
CERS1-204ENST00000623882 WDR62O43379 1518 aa34.88■■■■□ 3.17
CERS1-204ENST00000623882 PTPRKQ15262 1439 aa34.87■■■■□ 3.17
CERS1-204ENST00000623882 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.86■■■■□ 3.17
CERS1-204ENST00000623882 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CERS1-204ENST00000623882 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.83■■■■□ 3.17
CERS1-204ENST00000623882 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.81■■■■□ 3.16
CERS1-204ENST00000623882 ERCC6Q03468 1493 aa34.79■■■■□ 3.16
CERS1-204ENST00000623882 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.79■■■■□ 3.16
CERS1-204ENST00000623882 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
CERS1-204ENST00000623882 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
CERS1-204ENST00000623882 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.74■■■■□ 3.15
CERS1-204ENST00000623882 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CERS1-204ENST00000623882 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.72■■■■□ 3.15
CERS1-204ENST00000623882 HECW1Q76N89 1606 aa34.72■■■■□ 3.15
CERS1-204ENST00000623882 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
CERS1-204ENST00000623882 HFM1A2PYH4 1435 aa34.67■■■■□ 3.14
CERS1-204ENST00000623882 ARHGEF11O15085 1522 aa34.67■■■■□ 3.14
CERS1-204ENST00000623882 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.66■■■■□ 3.14
CERS1-204ENST00000623882 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.66■■■■□ 3.14
CERS1-204ENST00000623882 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.65■■■■□ 3.14
CERS1-204ENST00000623882 GRIN2AQ12879 1464 aa34.63■■■■□ 3.13
CERS1-204ENST00000623882 NAIPQ13075 1403 aa34.63■■■■□ 3.13
CERS1-204ENST00000623882 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.61■■■■□ 3.13
CERS1-204ENST00000623882 DISP1Q96F81 1524 aa34.61■■■■□ 3.13
CERS1-204ENST00000623882 FBLN2P98095 1184 aa34.61■■■■□ 3.13
CERS1-204ENST00000623882 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CERS1-204ENST00000623882 KIAA0556O60303 1618 aa34.56■■■■□ 3.12
CERS1-204ENST00000623882 UACAQ9BZF9 1416 aa34.54■■■■□ 3.12
CERS1-204ENST00000623882 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
CERS1-204ENST00000623882 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
CERS1-204ENST00000623882 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.49■■■■□ 3.11
CERS1-204ENST00000623882 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
CERS1-204ENST00000623882 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
CERS1-204ENST00000623882 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
CERS1-204ENST00000623882 CEP170Q5SW79 1584 aa34.42■■■■□ 3.1
CERS1-204ENST00000623882 SYNJ2O15056 1496 aa34.41■■■■□ 3.1
CERS1-204ENST00000623882 TONSLQ96HA7 1378 aa34.41■■■■□ 3.1
CERS1-204ENST00000623882 MIA2Q96PC5 1412 aa34.39■■■■□ 3.1
CERS1-204ENST00000623882 TRIM52Q96A61 297 aa34.38■■■■□ 3.09
CERS1-204ENST00000623882 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
CERS1-204ENST00000623882 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
CERS1-204ENST00000623882 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.37■■■■□ 3.09
CERS1-204ENST00000623882 KDM6BO15054 1643 aa34.35■■■■□ 3.09
CERS1-204ENST00000623882 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.33■■■■□ 3.09
CERS1-204ENST00000623882 JPH4Q96JJ6 628 aa34.32■■■■□ 3.08
CERS1-204ENST00000623882 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CERS1-204ENST00000623882 KCNH8Q96L42 1107 aa34.29■■■■□ 3.08
CERS1-204ENST00000623882 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CERS1-204ENST00000623882 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.26■■■■□ 3.07
CERS1-204ENST00000623882 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
CERS1-204ENST00000623882 FOXD1Q16676 465 aa34.22■■■■□ 3.07
CERS1-204ENST00000623882 NUP160Q12769 1436 aa34.22■■■■□ 3.07
CERS1-204ENST00000623882 DAPK1P53355 1430 aa34.21■■■■□ 3.07
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