RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623691.3

GPS1-226, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene GPS1, Length 1,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-226ENST00000623691 ARAP1Q96P48 1450 aa26.17■■□□□ 1.78
GPS1-226ENST00000623691 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
GPS1-226ENST00000623691 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.15■■□□□ 1.78
GPS1-226ENST00000623691 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.1■■□□□ 1.77
GPS1-226ENST00000623691 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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GPS1-226ENST00000623691 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.04■■□□□ 1.76
GPS1-226ENST00000623691 GRIN2AQ12879 1464 aa26■■□□□ 1.75
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GPS1-226ENST00000623691 CEP170Q5SW79 1584 aa25.87■■□□□ 1.73
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GPS1-226ENST00000623691 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.39■■□□□ 1.66
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GPS1-226ENST00000623691 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.33■■□□□ 1.64
GPS1-226ENST00000623691 HECW1Q76N89 1606 aa25.29■■□□□ 1.64
GPS1-226ENST00000623691 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.29■■□□□ 1.64
GPS1-226ENST00000623691 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.26■■□□□ 1.63
GPS1-226ENST00000623691 PTPRGP23470 1445 aa25.25■■□□□ 1.63
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GPS1-226ENST00000623691 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.2■■□□□ 1.63
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GPS1-226ENST00000623691 ABCC2Q92887 1545 aa25.08■■□□□ 1.61
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GPS1-226ENST00000623691 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.08■■□□□ 1.6
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GPS1-226ENST00000623691 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.01■■□□□ 1.59
GPS1-226ENST00000623691 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25■■□□□ 1.59
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GPS1-226ENST00000623691 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GPS1-226ENST00000623691 MIA2Q96PC5 1412 aa24.93■■□□□ 1.58
GPS1-226ENST00000623691 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.91■■□□□ 1.58
GPS1-226ENST00000623691 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.87■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.85■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 HFM1A2PYH4 1435 aa24.85■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 MAPKBP1O60336 1514 aa24.84■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 KIF14Q15058 1648 aa24.83■■□□□ 1.56
GPS1-226ENST00000623691 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
GPS1-226ENST00000623691 NAIPQ13075 1403 aa24.78■■□□□ 1.56
GPS1-226ENST00000623691 AKNAQ7Z591 1439 aa24.75■■□□□ 1.55
GPS1-226ENST00000623691 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.72■■□□□ 1.55
GPS1-226ENST00000623691 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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