RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623691.3

GPS1-226, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene GPS1, Length 1,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-226ENST00000623691 ARAP1Q96P48 1450 aa26.17■■□□□ 1.78
GPS1-226ENST00000623691 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
GPS1-226ENST00000623691 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.15■■□□□ 1.78
GPS1-226ENST00000623691 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.1■■□□□ 1.77
GPS1-226ENST00000623691 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
GPS1-226ENST00000623691 SYNJ2O15056 1496 aa26.05■■□□□ 1.76
GPS1-226ENST00000623691 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.04■■□□□ 1.76
GPS1-226ENST00000623691 GRIN2AQ12879 1464 aa26■■□□□ 1.75
GPS1-226ENST00000623691 FBLN2P98095 1184 aa25.99■■□□□ 1.75
GPS1-226ENST00000623691 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
GPS1-226ENST00000623691 CHD1O14646 1710 aa25.98■■□□□ 1.75
GPS1-226ENST00000623691 APLP2Q06481 763 aa25.91■■□□□ 1.74
GPS1-226ENST00000623691 CEP170Q5SW79 1584 aa25.87■■□□□ 1.73
GPS1-226ENST00000623691 IQGAP2Q13576 1575 aa25.83■■□□□ 1.73
GPS1-226ENST00000623691 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.82■■□□□ 1.72
GPS1-226ENST00000623691 NUP160Q12769 1436 aa25.8■■□□□ 1.72
GPS1-226ENST00000623691 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.78■■□□□ 1.72
GPS1-226ENST00000623691 MAP3K1Q13233 1512 aa25.77■■□□□ 1.72
GPS1-226ENST00000623691 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
GPS1-226ENST00000623691 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
GPS1-226ENST00000623691 P3H3Q8IVL6 736 aa25.72■■□□□ 1.71
GPS1-226ENST00000623691 SAMD9Q5K651 1589 aa25.71■■□□□ 1.71
GPS1-226ENST00000623691 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.69■■□□□ 1.7
GPS1-226ENST00000623691 TIAM1Q13009 1591 aa25.68■■□□□ 1.7
GPS1-226ENST00000623691 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.65■■□□□ 1.7
GPS1-226ENST00000623691 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
GPS1-226ENST00000623691 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.62■■□□□ 1.69
GPS1-226ENST00000623691 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
GPS1-226ENST00000623691 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.61■■□□□ 1.69
GPS1-226ENST00000623691 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.6■■□□□ 1.69
GPS1-226ENST00000623691 FMN1Q68DA7 1419 aa25.59■■□□□ 1.69
GPS1-226ENST00000623691 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
GPS1-226ENST00000623691 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.58■■□□□ 1.69
GPS1-226ENST00000623691 KIAA0556O60303 1618 aa25.58■■□□□ 1.69
GPS1-226ENST00000623691 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.57■■□□□ 1.68
GPS1-226ENST00000623691 JPH4Q96JJ6 628 aa25.56■■□□□ 1.68
GPS1-226ENST00000623691 SHROOM2Q13796 1616 aa25.55■■□□□ 1.68
GPS1-226ENST00000623691 DISP1Q96F81 1524 aa25.54■■□□□ 1.68
GPS1-226ENST00000623691 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
GPS1-226ENST00000623691 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
GPS1-226ENST00000623691 OSCARQ8IYS5 282 aa25.51■■□□□ 1.67
GPS1-226ENST00000623691 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.49■■□□□ 1.67
GPS1-226ENST00000623691 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
GPS1-226ENST00000623691 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
GPS1-226ENST00000623691 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.43■■□□□ 1.66
GPS1-226ENST00000623691 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.4■■□□□ 1.66
GPS1-226ENST00000623691 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.39■■□□□ 1.66
GPS1-226ENST00000623691 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.38■■□□□ 1.65
GPS1-226ENST00000623691 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.33■■□□□ 1.64
GPS1-226ENST00000623691 HECW1Q76N89 1606 aa25.29■■□□□ 1.64
GPS1-226ENST00000623691 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.29■■□□□ 1.64
GPS1-226ENST00000623691 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.26■■□□□ 1.63
GPS1-226ENST00000623691 PTPRGP23470 1445 aa25.25■■□□□ 1.63
GPS1-226ENST00000623691 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.24■■□□□ 1.63
GPS1-226ENST00000623691 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
GPS1-226ENST00000623691 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GPS1-226ENST00000623691 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.21■■□□□ 1.63
GPS1-226ENST00000623691 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.2■■□□□ 1.63
GPS1-226ENST00000623691 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.2■■□□□ 1.63
GPS1-226ENST00000623691 ABCA8O94911 1581 aa25.2■■□□□ 1.62
GPS1-226ENST00000623691 ARHGEF11O15085 1522 aa25.18■■□□□ 1.62
GPS1-226ENST00000623691 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GPS1-226ENST00000623691 ITGAEP38570 1179 aa25.16■■□□□ 1.62
GPS1-226ENST00000623691 NCOA2Q15596 1464 aa25.15■■□□□ 1.62
GPS1-226ENST00000623691 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 ARID3CA6NKF2 412 aa25.14■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.13■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 UACAQ9BZF9 1416 aa25.12■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.08■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 ABCC2Q92887 1545 aa25.08■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
GPS1-226ENST00000623691 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.08■■□□□ 1.6
GPS1-226ENST00000623691 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.02■■□□□ 1.6
GPS1-226ENST00000623691 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.01■■□□□ 1.59
GPS1-226ENST00000623691 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.01■■□□□ 1.59
GPS1-226ENST00000623691 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25■■□□□ 1.59
GPS1-226ENST00000623691 ATP10BO94823 1461 aa24.99■■□□□ 1.59
GPS1-226ENST00000623691 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
GPS1-226ENST00000623691 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
GPS1-226ENST00000623691 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.95■■□□□ 1.58
GPS1-226ENST00000623691 PTPRKQ15262 1439 aa24.94■■□□□ 1.58
GPS1-226ENST00000623691 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GPS1-226ENST00000623691 MIA2Q96PC5 1412 aa24.93■■□□□ 1.58
GPS1-226ENST00000623691 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.91■■□□□ 1.58
GPS1-226ENST00000623691 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.87■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.85■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 HFM1A2PYH4 1435 aa24.85■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 MAPKBP1O60336 1514 aa24.84■■□□□ 1.57
GPS1-226ENST00000623691 KIF14Q15058 1648 aa24.83■■□□□ 1.56
GPS1-226ENST00000623691 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
GPS1-226ENST00000623691 NAIPQ13075 1403 aa24.78■■□□□ 1.56
GPS1-226ENST00000623691 AKNAQ7Z591 1439 aa24.75■■□□□ 1.55
GPS1-226ENST00000623691 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.72■■□□□ 1.55
GPS1-226ENST00000623691 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms