RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619037.1

CYFIP1-209, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene CYFIP1, Length 575 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-209ENST00000619037 KIF21BO75037 1637 aa21.57■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.56■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.56■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.56■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 SHROOM2Q13796 1616 aa21.55■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.54■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.53■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 IQGAP2Q13576 1575 aa21.53■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 JPH4Q96JJ6 628 aa21.52■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.49■■□□□ 1.03
CYFIP1-209ENST00000619037 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CYFIP1-209ENST00000619037 GOLGA3Q08378 1498 aa21.45■■□□□ 1.03
CYFIP1-209ENST00000619037 ARAP1Q96P48 1450 aa21.41■■□□□ 1.02
CYFIP1-209ENST00000619037 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CYFIP1-209ENST00000619037 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.39■■□□□ 1.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.37■■□□□ 1.01
CYFIP1-209ENST00000619037 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.35■■□□□ 1.01
CYFIP1-209ENST00000619037 DISP1Q96F81 1524 aa21.34■■□□□ 1.01
CYFIP1-209ENST00000619037 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CYFIP1-209ENST00000619037 KIAA0556O60303 1618 aa21.32■■□□□ 1
CYFIP1-209ENST00000619037 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CYFIP1-209ENST00000619037 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.26■□□□□ 0.99
CYFIP1-209ENST00000619037 P3H3Q8IVL6 736 aa21.26■□□□□ 0.99
CYFIP1-209ENST00000619037 SAMD9Q5K651 1589 aa21.25■□□□□ 0.99
CYFIP1-209ENST00000619037 PTPRGP23470 1445 aa21.24■□□□□ 0.99
CYFIP1-209ENST00000619037 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.24■□□□□ 0.99
CYFIP1-209ENST00000619037 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.18■□□□□ 0.98
CYFIP1-209ENST00000619037 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.16■□□□□ 0.98
CYFIP1-209ENST00000619037 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.13■□□□□ 0.97
CYFIP1-209ENST00000619037 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.13■□□□□ 0.97
CYFIP1-209ENST00000619037 UACAQ9BZF9 1416 aa21.1■□□□□ 0.97
CYFIP1-209ENST00000619037 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.09■□□□□ 0.97
CYFIP1-209ENST00000619037 CLIP1P30622 1438 aa21.09■□□□□ 0.97
CYFIP1-209ENST00000619037 ABCC2Q92887 1545 aa21.07■□□□□ 0.96
CYFIP1-209ENST00000619037 ABCA8O94911 1581 aa21.06■□□□□ 0.96
CYFIP1-209ENST00000619037 CEP162Q5TB80 1403 aa21.05■□□□□ 0.96
CYFIP1-209ENST00000619037 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.05■□□□□ 0.96
CYFIP1-209ENST00000619037 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
CYFIP1-209ENST00000619037 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.01■□□□□ 0.95
CYFIP1-209ENST00000619037 FMN1Q68DA7 1419 aa20.98■□□□□ 0.95
CYFIP1-209ENST00000619037 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.96■□□□□ 0.95
CYFIP1-209ENST00000619037 ARID3CA6NKF2 412 aa20.96■□□□□ 0.95
CYFIP1-209ENST00000619037 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CYFIP1-209ENST00000619037 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CYFIP1-209ENST00000619037 MAPKBP1O60336 1514 aa20.91■□□□□ 0.94
CYFIP1-209ENST00000619037 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CYFIP1-209ENST00000619037 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
CYFIP1-209ENST00000619037 ATP10BO94823 1461 aa20.89■□□□□ 0.94
CYFIP1-209ENST00000619037 HECW1Q76N89 1606 aa20.88■□□□□ 0.93
CYFIP1-209ENST00000619037 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CYFIP1-209ENST00000619037 ASXL2Q76L83 1435 aa20.87■□□□□ 0.93
CYFIP1-209ENST00000619037 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CYFIP1-209ENST00000619037 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CYFIP1-209ENST00000619037 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.85■□□□□ 0.93
CYFIP1-209ENST00000619037 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CYFIP1-209ENST00000619037 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.83■□□□□ 0.92
CYFIP1-209ENST00000619037 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.81■□□□□ 0.92
CYFIP1-209ENST00000619037 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CYFIP1-209ENST00000619037 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.79■□□□□ 0.92
CYFIP1-209ENST00000619037 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.79■□□□□ 0.92
CYFIP1-209ENST00000619037 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.79■□□□□ 0.92
CYFIP1-209ENST00000619037 DIP2BQ9P265 1576 aa20.79■□□□□ 0.92
CYFIP1-209ENST00000619037 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.78■□□□□ 0.92
CYFIP1-209ENST00000619037 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.76■□□□□ 0.91
CYFIP1-209ENST00000619037 KCNH8Q96L42 1107 aa20.75■□□□□ 0.91
CYFIP1-209ENST00000619037 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.74■□□□□ 0.91
CYFIP1-209ENST00000619037 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.72■□□□□ 0.91
CYFIP1-209ENST00000619037 GLI2P10070 1586 aa20.69■□□□□ 0.9
CYFIP1-209ENST00000619037 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CYFIP1-209ENST00000619037 TSPOAP1O95153 1857 aa20.65■□□□□ 0.9
CYFIP1-209ENST00000619037 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.64■□□□□ 0.9
CYFIP1-209ENST00000619037 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.64■□□□□ 0.89
CYFIP1-209ENST00000619037 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CYFIP1-209ENST00000619037 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.63■□□□□ 0.89
CYFIP1-209ENST00000619037 KIF14Q15058 1648 aa20.6■□□□□ 0.89
CYFIP1-209ENST00000619037 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.6■□□□□ 0.89
CYFIP1-209ENST00000619037 TIAM1Q13009 1591 aa20.6■□□□□ 0.89
CYFIP1-209ENST00000619037 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
CYFIP1-209ENST00000619037 CD109Q6YHK3 1445 aa20.58■□□□□ 0.88
CYFIP1-209ENST00000619037 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CYFIP1-209ENST00000619037 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.57■□□□□ 0.88
CYFIP1-209ENST00000619037 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.57■□□□□ 0.88
CYFIP1-209ENST00000619037 APLP2Q06481 763 aa20.54■□□□□ 0.88
CYFIP1-209ENST00000619037 MAP3K1Q13233 1512 aa20.53■□□□□ 0.88
CYFIP1-209ENST00000619037 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.53■□□□□ 0.88
CYFIP1-209ENST00000619037 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.5■□□□□ 0.87
CYFIP1-209ENST00000619037 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CYFIP1-209ENST00000619037 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.5■□□□□ 0.87
CYFIP1-209ENST00000619037 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.48■□□□□ 0.87
CYFIP1-209ENST00000619037 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 PLCH2O75038 1416 aa20.44■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.43■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 NCOA2Q15596 1464 aa20.42■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 PREX2Q70Z35 1606 aa20.42■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.41■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 FANCAO15360 1455 aa20.41■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.41■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 KDM6BO15054 1643 aa20.4■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.4■□□□□ 0.86
CYFIP1-209ENST00000619037 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 186.1 ms