RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614794.4

SPPL2B-211, Transcript of signal peptide peptidase like 2B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPPL2B, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2B-211ENST00000614794 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.48■■■■□ 3.43
SPPL2B-211ENST00000614794 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
SPPL2B-211ENST00000614794 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.37■■■■□ 3.41
SPPL2B-211ENST00000614794 IQGAP2Q13576 1575 aa36.34■■■■□ 3.41
SPPL2B-211ENST00000614794 JPH4Q96JJ6 628 aa36.33■■■■□ 3.41
SPPL2B-211ENST00000614794 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.31■■■■□ 3.4
SPPL2B-211ENST00000614794 SHROOM2Q13796 1616 aa36.25■■■■□ 3.39
SPPL2B-211ENST00000614794 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.23■■■■□ 3.39
SPPL2B-211ENST00000614794 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.19■■■■□ 3.38
SPPL2B-211ENST00000614794 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.18■■■■□ 3.38
SPPL2B-211ENST00000614794 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
SPPL2B-211ENST00000614794 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
SPPL2B-211ENST00000614794 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.09■■■■□ 3.37
SPPL2B-211ENST00000614794 ARHGEF11O15085 1522 aa36.07■■■■□ 3.37
SPPL2B-211ENST00000614794 DISP1Q96F81 1524 aa36.05■■■■□ 3.36
SPPL2B-211ENST00000614794 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.04■■■■□ 3.36
SPPL2B-211ENST00000614794 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.98■■■■□ 3.35
SPPL2B-211ENST00000614794 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.98■■■■□ 3.35
SPPL2B-211ENST00000614794 KIAA0556O60303 1618 aa35.98■■■■□ 3.35
SPPL2B-211ENST00000614794 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.98■■■■□ 3.35
SPPL2B-211ENST00000614794 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.97■■■■□ 3.35
SPPL2B-211ENST00000614794 SAMD9Q5K651 1589 aa35.96■■■■□ 3.35
SPPL2B-211ENST00000614794 CLIP1P30622 1438 aa35.92■■■■□ 3.34
SPPL2B-211ENST00000614794 CEP162Q5TB80 1403 aa35.92■■■■□ 3.34
SPPL2B-211ENST00000614794 P3H3Q8IVL6 736 aa35.92■■■■□ 3.34
SPPL2B-211ENST00000614794 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.88■■■■□ 3.33
SPPL2B-211ENST00000614794 PTPRGP23470 1445 aa35.85■■■■□ 3.33
SPPL2B-211ENST00000614794 ARAP1Q96P48 1450 aa35.83■■■■□ 3.33
SPPL2B-211ENST00000614794 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.81■■■■□ 3.32
SPPL2B-211ENST00000614794 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
SPPL2B-211ENST00000614794 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.76■■■■□ 3.32
SPPL2B-211ENST00000614794 FMN1Q68DA7 1419 aa35.65■■■■□ 3.3
SPPL2B-211ENST00000614794 UACAQ9BZF9 1416 aa35.61■■■■□ 3.29
SPPL2B-211ENST00000614794 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.59■■■■□ 3.29
SPPL2B-211ENST00000614794 ABCA8O94911 1581 aa35.55■■■■□ 3.28
SPPL2B-211ENST00000614794 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.53■■■■□ 3.28
SPPL2B-211ENST00000614794 ABCC2Q92887 1545 aa35.51■■■■□ 3.28
SPPL2B-211ENST00000614794 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.49■■■■□ 3.27
SPPL2B-211ENST00000614794 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.49■■■■□ 3.27
SPPL2B-211ENST00000614794 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.44■■■■□ 3.26
SPPL2B-211ENST00000614794 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.43■■■■□ 3.26
SPPL2B-211ENST00000614794 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
SPPL2B-211ENST00000614794 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.39■■■■□ 3.26
SPPL2B-211ENST00000614794 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
SPPL2B-211ENST00000614794 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
SPPL2B-211ENST00000614794 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.38■■■■□ 3.25
SPPL2B-211ENST00000614794 HECW1Q76N89 1606 aa35.36■■■■□ 3.25
SPPL2B-211ENST00000614794 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.35■■■■□ 3.25
SPPL2B-211ENST00000614794 ARID3CA6NKF2 412 aa35.33■■■■□ 3.25
SPPL2B-211ENST00000614794 ATP10BO94823 1461 aa35.3■■■■□ 3.24
SPPL2B-211ENST00000614794 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
SPPL2B-211ENST00000614794 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
SPPL2B-211ENST00000614794 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
SPPL2B-211ENST00000614794 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
SPPL2B-211ENST00000614794 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.22■■■■□ 3.23
SPPL2B-211ENST00000614794 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
SPPL2B-211ENST00000614794 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.16■■■■□ 3.22
SPPL2B-211ENST00000614794 MAPKBP1O60336 1514 aa35.15■■■■□ 3.22
SPPL2B-211ENST00000614794 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
SPPL2B-211ENST00000614794 ASXL2Q76L83 1435 aa35.12■■■■□ 3.21
SPPL2B-211ENST00000614794 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.1■■■■□ 3.21
SPPL2B-211ENST00000614794 APLP2Q06481 763 aa35.1■■■■□ 3.21
SPPL2B-211ENST00000614794 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.05■■■■□ 3.2
SPPL2B-211ENST00000614794 MAP3K1Q13233 1512 aa35.05■■■■□ 3.2
SPPL2B-211ENST00000614794 TIAM1Q13009 1591 aa35.02■■■■□ 3.2
SPPL2B-211ENST00000614794 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.99■■■■□ 3.19
SPPL2B-211ENST00000614794 KCNH8Q96L42 1107 aa34.96■■■■□ 3.19
SPPL2B-211ENST00000614794 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
SPPL2B-211ENST00000614794 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.95■■■■□ 3.19
SPPL2B-211ENST00000614794 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.93■■■■□ 3.18
SPPL2B-211ENST00000614794 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.91■■■■□ 3.18
SPPL2B-211ENST00000614794 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.88■■■■□ 3.17
SPPL2B-211ENST00000614794 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
SPPL2B-211ENST00000614794 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.86■■■■□ 3.17
SPPL2B-211ENST00000614794 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.85■■■■□ 3.17
SPPL2B-211ENST00000614794 DIP2BQ9P265 1576 aa34.84■■■■□ 3.17
SPPL2B-211ENST00000614794 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
SPPL2B-211ENST00000614794 GLI2P10070 1586 aa34.8■■■■□ 3.16
SPPL2B-211ENST00000614794 KIF14Q15058 1648 aa34.8■■■■□ 3.16
SPPL2B-211ENST00000614794 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.74■■■■□ 3.15
SPPL2B-211ENST00000614794 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.74■■■■□ 3.151e-6■■■□□ 19.2
SPPL2B-211ENST00000614794 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.73■■■■□ 3.15
SPPL2B-211ENST00000614794 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
SPPL2B-211ENST00000614794 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.68■■■■□ 3.14
SPPL2B-211ENST00000614794 NCOA2Q15596 1464 aa34.67■■■■□ 3.14
SPPL2B-211ENST00000614794 CD109Q6YHK3 1445 aa34.67■■■■□ 3.14
SPPL2B-211ENST00000614794 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
SPPL2B-211ENST00000614794 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.65■■■■□ 3.14
SPPL2B-211ENST00000614794 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.62■■■■□ 3.13
SPPL2B-211ENST00000614794 PLCH2O75038 1416 aa34.58■■■■□ 3.13
SPPL2B-211ENST00000614794 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
SPPL2B-211ENST00000614794 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.55■■■■□ 3.12
SPPL2B-211ENST00000614794 TSPOAP1O95153 1857 aa34.52■■■■□ 3.12
SPPL2B-211ENST00000614794 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.51■■■■□ 3.12
SPPL2B-211ENST00000614794 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.51■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.49■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.49■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 PREX2Q70Z35 1606 aa34.49■■■■□ 3.11
SPPL2B-211ENST00000614794 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms