RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611394.4

PRR5-216, Transcript of proline rich 5, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRR5, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR5-216ENST00000611394 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.31■■■■■ 5.8
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PRR5-216ENST00000611394 CHD1O14646 1710 aa51.06■■■■■ 5.76
PRR5-216ENST00000611394 IQGAP2Q13576 1575 aa51.05■■■■■ 5.76
PRR5-216ENST00000611394 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa51.05■■■■■ 5.76
PRR5-216ENST00000611394 CEP170Q5SW79 1584 aa51.02■■■■■ 5.76
PRR5-216ENST00000611394 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa51■■■■■ 5.76
PRR5-216ENST00000611394 NUP160Q12769 1436 aa50.99■■■■■ 5.75
PRR5-216ENST00000611394 EFCAB5A4FU69 1503 aa50.95■■■■■ 5.75
PRR5-216ENST00000611394 ARAP1Q96P48 1450 aa50.95■■■■■ 5.75
PRR5-216ENST00000611394 VPS8Q8N3P4 1428 aa50.86■■■■■ 5.73
PRR5-216ENST00000611394 SAMD9Q5K651 1589 aa50.83■■■■■ 5.73
PRR5-216ENST00000611394 UGGT2Q9NYU1 1516 aa50.78■■■■■ 5.72
PRR5-216ENST00000611394 P3H3Q8IVL6 736 aa50.73■■■■■ 5.71
PRR5-216ENST00000611394 FHOD3Q2V2M9 1422 aa50.69■■■■■ 5.7
PRR5-216ENST00000611394 JPH4Q96JJ6 628 aa50.55■■■■■ 5.68
PRR5-216ENST00000611394 DISP1Q96F81 1524 aa50.53■■■■■ 5.68
PRR5-216ENST00000611394 KIAA0556O60303 1618 aa50.53■■■■■ 5.68
PRR5-216ENST00000611394 FMN1Q68DA7 1419 aa50.48■■■■■ 5.67
PRR5-216ENST00000611394 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.44■■■■■ 5.67
PRR5-216ENST00000611394 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa50.41■■■■■ 5.66
PRR5-216ENST00000611394 SHROOM2Q13796 1616 aa50.39■■■■■ 5.66
PRR5-216ENST00000611394 APLP2Q06481 763 aa50.37■■■■■ 5.65
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PRR5-216ENST00000611394 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa50.29■■■■■ 5.64
PRR5-216ENST00000611394 FYCO1Q9BQS8 1478 aa50.29■■■■■ 5.64
PRR5-216ENST00000611394 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP50.25■■■■■ 5.64
PRR5-216ENST00000611394 OSCARQ8IYS5 282 aa50.2■■■■■ 5.63
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PRR5-216ENST00000611394 TIAM1Q13009 1591 aa50.06■■■■■ 5.6
PRR5-216ENST00000611394 HECW1Q76N89 1606 aa50.04■■■■■ 5.6
PRR5-216ENST00000611394 CFAP43Q8NDM7 1665 aa50.03■■■■■ 5.6
PRR5-216ENST00000611394 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.01■■■■■ 5.6
PRR5-216ENST00000611394 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa49.99■■■■■ 5.59
PRR5-216ENST00000611394 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa49.95■■■■■ 5.59
PRR5-216ENST00000611394 PTPRGP23470 1445 aa49.94■■■■■ 5.58
PRR5-216ENST00000611394 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP49.9■■■■■ 5.58
PRR5-216ENST00000611394 CCDC18Q5T9S5 1454 aa49.88■■■■■ 5.58
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PRR5-216ENST00000611394 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP49.86■■■■■ 5.57
PRR5-216ENST00000611394 ABCA8O94911 1581 aa49.83■■■■■ 5.57
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PRR5-216ENST00000611394 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP49.8■■■■■ 5.56
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PRR5-216ENST00000611394 ARID3CA6NKF2 412 aa49.65■■■■■ 5.54
PRR5-216ENST00000611394 UACAQ9BZF9 1416 aa49.65■■■■■ 5.54
PRR5-216ENST00000611394 PCGF6Q9BYE7 350 aa49.64■■■■■ 5.54
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PRR5-216ENST00000611394 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa49.56■■■■■ 5.52
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PRR5-216ENST00000611394 PHLDB1Q86UU1 1377 aa49.3■■■■■ 5.48
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PRR5-216ENST00000611394 PLEKHD1A6NEE1 506 aa49.23■■■■■ 5.47
PRR5-216ENST00000611394 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
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PRR5-216ENST00000611394 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP49.21■■■■■ 5.47
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PRR5-216ENST00000611394 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.2■■■■■ 5.47
PRR5-216ENST00000611394 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.2■■■■■ 5.47
PRR5-216ENST00000611394 CCNB3Q8WWL7 1395 aa49.12■■■■■ 5.45
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PRR5-216ENST00000611394 KIF14Q15058 1648 aa49.07■■■■■ 5.45
PRR5-216ENST00000611394 FGD6Q6ZV73 1430 aa49.02■■■■■ 5.44
PRR5-216ENST00000611394 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.89■■■■■ 5.42
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PRR5-216ENST00000611394 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.41
PRR5-216ENST00000611394 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.87■■■■■ 5.41
PRR5-216ENST00000611394 ITSN2Q9NZM3 1697 aa48.87■■■■■ 5.41
PRR5-216ENST00000611394 MIA2Q96PC5 1412 aa48.86■■■■■ 5.41
PRR5-216ENST00000611394 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP48.85■■■■■ 5.41
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PRR5-216ENST00000611394 WDR7Q9Y4E6 1490 aa48.8■■■■■ 5.4
PRR5-216ENST00000611394 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP48.79■■■■■ 5.4
PRR5-216ENST00000611394 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa48.76■■■■■ 5.4
PRR5-216ENST00000611394 KCNH8Q96L42 1107 aa48.75■■■■■ 5.39
PRR5-216ENST00000611394 ASXL2Q76L83 1435 aa48.74■■■■■ 5.39
PRR5-216ENST00000611394 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP48.74■■■■■ 5.39
PRR5-216ENST00000611394 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP48.73■■■■■ 5.392e-6■■■■■ 51.7
PRR5-216ENST00000611394 TTC37Q6PGP7 1564 aa48.7■■■■■ 5.39
PRR5-216ENST00000611394 ITGAEP38570 1179 aa48.67■■■■■ 5.38
PRR5-216ENST00000611394 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP48.67■■■■■ 5.38
PRR5-216ENST00000611394 PREX2Q70Z35 1606 aa48.62■■■■■ 5.37
PRR5-216ENST00000611394 MYO5CQ9NQX4 1742 aa48.59■■■■■ 5.37
PRR5-216ENST00000611394 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa48.56■■■■■ 5.36
PRR5-216ENST00000611394 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa48.53■■■■■ 5.36
PRR5-216ENST00000611394 MAPKBP1O60336 1514 aa48.52■■■■■ 5.36
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