RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611388.1

ANKRD20A3-201, Transcript of ankyrin repeat domain 20 family member A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD20A3, Length 3,964 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
ANKRD20A3-201ENST00000611388 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD20A3-201ENST00000611388 TNIKQ9UKE5 1360 aa18.75■□□□□ 0.59
ANKRD20A3-201ENST00000611388 GRIN2BQ13224 1484 aa18.74■□□□□ 0.59
ANKRD20A3-201ENST00000611388 TRIM52Q96A61 297 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.72■□□□□ 0.59
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.7■□□□□ 0.58
ANKRD20A3-201ENST00000611388 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.68■□□□□ 0.58
ANKRD20A3-201ENST00000611388 TOP2BQ02880 1626 aa18.64■□□□□ 0.58
ANKRD20A3-201ENST00000611388 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.63■□□□□ 0.57
ANKRD20A3-201ENST00000611388 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.63■□□□□ 0.57
ANKRD20A3-201ENST00000611388 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.62■□□□□ 0.57
ANKRD20A3-201ENST00000611388 PTPRGP23470 1445 aa18.59■□□□□ 0.57
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
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ANKRD20A3-201ENST00000611388 TSPY10P0CW01 314 aa18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3-201ENST00000611388 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
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ANKRD20A3-201ENST00000611388 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ANKRD20A3-201ENST00000611388 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.46■□□□□ 0.55
ANKRD20A3-201ENST00000611388 NEUROD1Q13562 356 aa18.44■□□□□ 0.54
ANKRD20A3-201ENST00000611388 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.41■□□□□ 0.54
ANKRD20A3-201ENST00000611388 FMN1Q68DA7 1419 aa18.41■□□□□ 0.54
ANKRD20A3-201ENST00000611388 SYNJ2O15056 1496 aa18.4■□□□□ 0.54
ANKRD20A3-201ENST00000611388 MLECQ14165 292 aa18.4■□□□□ 0.54
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.38■□□□□ 0.53
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ANKRD20A3-201ENST00000611388 WDR62O43379 1518 aa18.37■□□□□ 0.53
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
ANKRD20A3-201ENST00000611388 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
ANKRD20A3-201ENST00000611388 PRXQ9BXM0 1461 aa18.35■□□□□ 0.53
ANKRD20A3-201ENST00000611388 GRIN2AQ12879 1464 aa18.35■□□□□ 0.53
ANKRD20A3-201ENST00000611388 BCANQ96GW7 911 aa18.35■□□□□ 0.53
ANKRD20A3-201ENST00000611388 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
ANKRD20A3-201ENST00000611388 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.34■□□□□ 0.53
ANKRD20A3-201ENST00000611388 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.32■□□□□ 0.52
ANKRD20A3-201ENST00000611388 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.3■□□□□ 0.52
ANKRD20A3-201ENST00000611388 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.29■□□□□ 0.52
ANKRD20A3-201ENST00000611388 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.29■□□□□ 0.52
ANKRD20A3-201ENST00000611388 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.28■□□□□ 0.52
ANKRD20A3-201ENST00000611388 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.26■□□□□ 0.51
ANKRD20A3-201ENST00000611388 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ANKRD20A3-201ENST00000611388 PRDM2Q13029 1718 aa18.22■□□□□ 0.51
ANKRD20A3-201ENST00000611388 GGT6Q6P531 493 aa18.22■□□□□ 0.51
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.17■□□□□ 0.5
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ANKRD20A3-201ENST00000611388 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
ANKRD20A3-201ENST00000611388 IQGAP2Q13576 1575 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD20A3-201ENST00000611388 KIF21BO75037 1637 aa18.13■□□□□ 0.49
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ANKRD20A3-201ENST00000611388 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.12■□□□□ 0.49
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CUL7Q14999 1698 aa18.1■□□□□ 0.49
ANKRD20A3-201ENST00000611388 UACAQ9BZF9 1416 aa18.09■□□□□ 0.49
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.09■□□□□ 0.49
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ANKRD20A3-201ENST00000611388 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ANKRD20A3-201ENST00000611388 KIF3BO15066 747 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD20A3-201ENST00000611388 RGL3Q3MIN7 710 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD20A3-201ENST00000611388 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD20A3-201ENST00000611388 AFAP1Q8N556 730 aa18.06■□□□□ 0.48
ANKRD20A3-201ENST00000611388 RAPGEF3O95398 923 aa18.02■□□□□ 0.48
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ADAMTS12P58397 1594 aa18.02■□□□□ 0.47
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.99■□□□□ 0.47
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ANKRD20A3-201ENST00000611388 FOXD1Q16676 465 aa17.96■□□□□ 0.46
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.95■□□□□ 0.46
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ANKRD20A3-201ENST00000611388 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.95■□□□□ 0.46
ANKRD20A3-201ENST00000611388 NUP160Q12769 1436 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD20A3-201ENST00000611388 PBRM1Q86U86 1689 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD20A3-201ENST00000611388 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD20A3-201ENST00000611388 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa17.89■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.89■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.88■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 TONSLQ96HA7 1378 aa17.87■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.87■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.85■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CEP170Q5SW79 1584 aa17.85■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CD109Q6YHK3 1445 aa17.85■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.85■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.85■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 NUP155O75694 1391 aa17.85■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 PKD2Q13563 968 aa17.84■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.84■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 NCOA2Q15596 1464 aa17.84■□□□□ 0.45
ANKRD20A3-201ENST00000611388 KANK1Q14678 1352 aa17.83■□□□□ 0.44
ANKRD20A3-201ENST00000611388 HRCP23327 699 aa17.83■□□□□ 0.44
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ARHGEF11O15085 1522 aa17.81■□□□□ 0.44
ANKRD20A3-201ENST00000611388 ASXL2Q76L83 1435 aa17.8■□□□□ 0.44
ANKRD20A3-201ENST00000611388 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.8■□□□□ 0.44
ANKRD20A3-201ENST00000611388 CHD1O14646 1710 aa17.79■□□□□ 0.44
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