RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIAM1Q13009 1591 aa17.4■□□□□ 0.38
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.37■□□□□ 0.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.37■□□□□ 0.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIER1Q8N108 512 aa17.37■□□□□ 0.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.36■□□□□ 0.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.36■□□□□ 0.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.34■□□□□ 0.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.32■□□□□ 0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP3K1Q13233 1512 aa17.31■□□□□ 0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa17.31■□□□□ 0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.28■□□□□ 0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CUL7Q14999 1698 aa17.28■□□□□ 0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.25■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR97A6NE52 1622 aa17.24■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.24■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.24■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.22■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.22■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.22■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.22■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SETD5Q9C0A6 1442 aa17.22■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.21■□□□□ 0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FMN1Q68DA7 1419 aa17.19■□□□□ 0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.18■□□□□ 0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAPKBP1O60336 1514 aa17.17■□□□□ 0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.16■□□□□ 0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.16■□□□□ 0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARID3CA6NKF2 412 aa17.11■□□□□ 0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAMD9Q5K651 1589 aa17.1■□□□□ 0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.1■□□□□ 0.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.07■□□□□ 0.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRIN2BQ13224 1484 aa17.06■□□□□ 0.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTPRKQ15262 1439 aa17.06■□□□□ 0.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCOA2Q15596 1464 aa17.04■□□□□ 0.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.04■□□□□ 0.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PBRM1Q86U86 1689 aa17.01■□□□□ 0.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.99■□□□□ 0.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.99■□□□□ 0.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.99■□□□□ 0.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IQGAP2Q13576 1575 aa16.97■□□□□ 0.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAMTS12P58397 1594 aa16.97■□□□□ 0.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.97■□□□□ 0.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.96■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HFM1A2PYH4 1435 aa16.93■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.93■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NAIPQ13075 1403 aa16.93■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNH8Q96L42 1107 aa16.93■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFT140Q96RY7 1462 aa16.91■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.91■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.9■□□□□ 0.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBLN2P98095 1184 aa16.89■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UACAQ9BZF9 1416 aa16.88■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.88■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF11O15085 1522 aa16.87■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HECW1Q76N89 1606 aa16.87■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR62O43379 1518 aa16.87■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TONSLQ96HA7 1378 aa16.87■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERCC6Q03468 1493 aa16.87■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM52Q96A61 297 aa16.85■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DISP1Q96F81 1524 aa16.83■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.83■□□□□ 0.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRIN2AQ12879 1464 aa16.82■□□□□ 0.28
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXD1Q16676 465 aa16.8■□□□□ 0.28
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA0556O60303 1618 aa16.78■□□□□ 0.28
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM6BO15054 1643 aa16.78■□□□□ 0.28
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIA2Q96PC5 1412 aa16.76■□□□□ 0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.74■□□□□ 0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.72■□□□□ 0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 JPH4Q96JJ6 628 aa16.72■□□□□ 0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP170Q5SW79 1584 aa16.7■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.7■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYNJ2O15056 1496 aa16.69■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCC5O15440 1437 aa16.69■□□□□ 0.26
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