RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602312.2

SDR42E2-201, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SDR42E2, Length 2,630 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2-201ENST00000602312 CUL7Q14999 1698 aa22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2-201ENST00000602312 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SDR42E2-201ENST00000602312 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SDR42E2-201ENST00000602312 PBRM1Q86U86 1689 aa22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2-201ENST00000602312 IFT140Q96RY7 1462 aa22.15■■□□□ 1.14
SDR42E2-201ENST00000602312 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2-201ENST00000602312 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SDR42E2-201ENST00000602312 ARAP1Q96P48 1450 aa22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2-201ENST00000602312 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2-201ENST00000602312 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2-201ENST00000602312 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2-201ENST00000602312 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2-201ENST00000602312 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2-201ENST00000602312 GRIN2BQ13224 1484 aa22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2-201ENST00000602312 MYT1Q01538 1121 aa22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2-201ENST00000602312 ADAMTS12P58397 1594 aa22■■□□□ 1.11
SDR42E2-201ENST00000602312 APLP2Q06481 763 aa21.99■■□□□ 1.11
SDR42E2-201ENST00000602312 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2-201ENST00000602312 P3H3Q8IVL6 736 aa21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2-201ENST00000602312 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.94■■□□□ 1.1
SDR42E2-201ENST00000602312 MIER1Q8N108 512 aa21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2-201ENST00000602312 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.88■■□□□ 1.09
SDR42E2-201ENST00000602312 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.86■■□□□ 1.09
SDR42E2-201ENST00000602312 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 FBLN2P98095 1184 aa21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 IQGAP2Q13576 1575 aa21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 GRIN2AQ12879 1464 aa21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 SAMD9Q5K651 1589 aa21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2-201ENST00000602312 SYNJ2O15056 1496 aa21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2-201ENST00000602312 TIAM1Q13009 1591 aa21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2-201ENST00000602312 FMN1Q68DA7 1419 aa21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2-201ENST00000602312 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2-201ENST00000602312 CEP170Q5SW79 1584 aa21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2-201ENST00000602312 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.67■■□□□ 1.06
SDR42E2-201ENST00000602312 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.66■■□□□ 1.06
SDR42E2-201ENST00000602312 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.64■■□□□ 1.05
SDR42E2-201ENST00000602312 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.63■■□□□ 1.05
SDR42E2-201ENST00000602312 MAP3K1Q13233 1512 aa21.61■■□□□ 1.05
SDR42E2-201ENST00000602312 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.59■■□□□ 1.05
SDR42E2-201ENST00000602312 NUP160Q12769 1436 aa21.58■■□□□ 1.04
SDR42E2-201ENST00000602312 KIAA0556O60303 1618 aa21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2-201ENST00000602312 CHD1O14646 1710 aa21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2-201ENST00000602312 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.57■■□□□ 1.04
SDR42E2-201ENST00000602312 DISP1Q96F81 1524 aa21.56■■□□□ 1.04
SDR42E2-201ENST00000602312 ARID3CA6NKF2 412 aa21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2-201ENST00000602312 JPH4Q96JJ6 628 aa21.49■■□□□ 1.03
SDR42E2-201ENST00000602312 HECW1Q76N89 1606 aa21.48■■□□□ 1.03
SDR42E2-201ENST00000602312 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2-201ENST00000602312 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2-201ENST00000602312 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2-201ENST00000602312 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2-201ENST00000602312 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2-201ENST00000602312 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2-201ENST00000602312 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2-201ENST00000602312 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2-201ENST00000602312 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2-201ENST00000602312 ITGAEP38570 1179 aa21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2-201ENST00000602312 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2-201ENST00000602312 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2-201ENST00000602312 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2-201ENST00000602312 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2-201ENST00000602312 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2-201ENST00000602312 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2-201ENST00000602312 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2-201ENST00000602312 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2-201ENST00000602312 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SDR42E2-201ENST00000602312 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.33■■□□□ 1
SDR42E2-201ENST00000602312 NCOA2Q15596 1464 aa21.31■■□□□ 1
SDR42E2-201ENST00000602312 SHROOM2Q13796 1616 aa21.26■□□□□ 0.99
SDR42E2-201ENST00000602312 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.25■□□□□ 0.99
SDR42E2-201ENST00000602312 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.23■□□□□ 0.99
SDR42E2-201ENST00000602312 PTPRGP23470 1445 aa21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2-201ENST00000602312 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2-201ENST00000602312 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2-201ENST00000602312 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2-201ENST00000602312 ABCA8O94911 1581 aa21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2-201ENST00000602312 ARHGEF11O15085 1522 aa21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2-201ENST00000602312 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2-201ENST00000602312 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.14■□□□□ 0.98
SDR42E2-201ENST00000602312 KCNH8Q96L42 1107 aa21.13■□□□□ 0.97
SDR42E2-201ENST00000602312 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
SDR42E2-201ENST00000602312 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2-201ENST00000602312 ATP10BO94823 1461 aa21.11■□□□□ 0.97
SDR42E2-201ENST00000602312 KIF14Q15058 1648 aa21.09■□□□□ 0.97
SDR42E2-201ENST00000602312 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.08■□□□□ 0.97
SDR42E2-201ENST00000602312 UACAQ9BZF9 1416 aa21.08■□□□□ 0.97
SDR42E2-201ENST00000602312 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.06■□□□□ 0.96
SDR42E2-201ENST00000602312 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.06■□□□□ 0.96
SDR42E2-201ENST00000602312 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.05■□□□□ 0.96
SDR42E2-201ENST00000602312 PTPRKQ15262 1439 aa21.04■□□□□ 0.96
SDR42E2-201ENST00000602312 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.03■□□□□ 0.96
SDR42E2-201ENST00000602312 MIA2Q96PC5 1412 aa21.03■□□□□ 0.96
SDR42E2-201ENST00000602312 BCANQ96GW7 911 aa21.03■□□□□ 0.96
SDR42E2-201ENST00000602312 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SDR42E2-201ENST00000602312 ABCC2Q92887 1545 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms