RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.39■■■□□ 2.29
HERC3-214ENST00000601319 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.37■■■□□ 2.29
HERC3-214ENST00000601319 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
HERC3-214ENST00000601319 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.26■■■□□ 2.27
HERC3-214ENST00000601319 JPH4Q96JJ6 628 aa29.26■■■□□ 2.27
HERC3-214ENST00000601319 IQGAP2Q13576 1575 aa29.24■■■□□ 2.27
HERC3-214ENST00000601319 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.19■■■□□ 2.26
HERC3-214ENST00000601319 PRXQ9BXM0 1461 aa29.13■■■□□ 2.25
HERC3-214ENST00000601319 EEA1Q15075 1411 aa29.07■■■□□ 2.24
HERC3-214ENST00000601319 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.06■■■□□ 2.24
HERC3-214ENST00000601319 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.03■■■□□ 2.24
HERC3-214ENST00000601319 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.02■■■□□ 2.24
HERC3-214ENST00000601319 DISP1Q96F81 1524 aa28.99■■■□□ 2.23
HERC3-214ENST00000601319 KIAA0556O60303 1618 aa28.98■■■□□ 2.23
HERC3-214ENST00000601319 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.93■■■□□ 2.22
HERC3-214ENST00000601319 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
HERC3-214ENST00000601319 MAPKBP1O60336 1514 aa28.9■■■□□ 2.22
HERC3-214ENST00000601319 PTPRGP23470 1445 aa28.9■■■□□ 2.22
HERC3-214ENST00000601319 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.9■■■□□ 2.22
HERC3-214ENST00000601319 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.88■■■□□ 2.21
HERC3-214ENST00000601319 KIF21BO75037 1637 aa28.87■■■□□ 2.21
HERC3-214ENST00000601319 GOLGA3Q08378 1498 aa28.85■■■□□ 2.21
HERC3-214ENST00000601319 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.85■■■□□ 2.21
HERC3-214ENST00000601319 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.82■■■□□ 2.2
HERC3-214ENST00000601319 ABCC2Q92887 1545 aa28.79■■■□□ 2.2
HERC3-214ENST00000601319 UACAQ9BZF9 1416 aa28.75■■■□□ 2.19
HERC3-214ENST00000601319 SAMD9Q5K651 1589 aa28.75■■■□□ 2.19
HERC3-214ENST00000601319 DIP2BQ9P265 1576 aa28.74■■■□□ 2.19
HERC3-214ENST00000601319 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
HERC3-214ENST00000601319 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.72■■■□□ 2.19
HERC3-214ENST00000601319 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.67■■■□□ 2.18
HERC3-214ENST00000601319 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
HERC3-214ENST00000601319 ABCA8O94911 1581 aa28.66■■■□□ 2.18
HERC3-214ENST00000601319 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HERC3-214ENST00000601319 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
HERC3-214ENST00000601319 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.59■■■□□ 2.17
HERC3-214ENST00000601319 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.56■■■□□ 2.16
HERC3-214ENST00000601319 ASXL2Q76L83 1435 aa28.56■■■□□ 2.16
HERC3-214ENST00000601319 GLI2P10070 1586 aa28.54■■■□□ 2.16
HERC3-214ENST00000601319 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.5■■■□□ 2.15
HERC3-214ENST00000601319 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.48■■■□□ 2.15
HERC3-214ENST00000601319 TSPOAP1O95153 1857 aa28.47■■■□□ 2.15
HERC3-214ENST00000601319 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.43■■■□□ 2.14
HERC3-214ENST00000601319 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HERC3-214ENST00000601319 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HERC3-214ENST00000601319 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.42■■■□□ 2.14
HERC3-214ENST00000601319 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.39■■■□□ 2.14
HERC3-214ENST00000601319 P3H3Q8IVL6 736 aa28.39■■■□□ 2.14
HERC3-214ENST00000601319 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.33■■■□□ 2.13
HERC3-214ENST00000601319 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
HERC3-214ENST00000601319 ATP10BO94823 1461 aa28.32■■■□□ 2.12
HERC3-214ENST00000601319 KDM6BO15054 1643 aa28.32■■■□□ 2.12
HERC3-214ENST00000601319 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
HERC3-214ENST00000601319 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.27■■■□□ 2.12
HERC3-214ENST00000601319 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
HERC3-214ENST00000601319 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.23■■■□□ 2.11
HERC3-214ENST00000601319 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.21■■■□□ 2.11
HERC3-214ENST00000601319 FMN1Q68DA7 1419 aa28.2■■■□□ 2.11
HERC3-214ENST00000601319 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.2■■■□□ 2.1
HERC3-214ENST00000601319 HECW1Q76N89 1606 aa28.18■■■□□ 2.1
HERC3-214ENST00000601319 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.17■■■□□ 2.1
HERC3-214ENST00000601319 ARID3CA6NKF2 412 aa28.12■■■□□ 2.09
HERC3-214ENST00000601319 CD109Q6YHK3 1445 aa28.11■■■□□ 2.09
HERC3-214ENST00000601319 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.08■■■□□ 2.09
HERC3-214ENST00000601319 KCNH8Q96L42 1107 aa28.07■■■□□ 2.08
HERC3-214ENST00000601319 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
HERC3-214ENST00000601319 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HERC3-214ENST00000601319 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
HERC3-214ENST00000601319 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
HERC3-214ENST00000601319 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
HERC3-214ENST00000601319 CLIP1P30622 1438 aa28■■■□□ 2.07
HERC3-214ENST00000601319 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.96■■■□□ 2.07
HERC3-214ENST00000601319 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.96■■■□□ 2.07
HERC3-214ENST00000601319 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.95■■■□□ 2.06
HERC3-214ENST00000601319 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.94■■■□□ 2.06
HERC3-214ENST00000601319 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.94■■■□□ 2.06
HERC3-214ENST00000601319 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.94■■■□□ 2.06
HERC3-214ENST00000601319 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.92■■■□□ 2.06
HERC3-214ENST00000601319 NEO1Q92859 1461 aa27.92■■■□□ 2.06
HERC3-214ENST00000601319 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.91■■■□□ 2.06
HERC3-214ENST00000601319 KIF14Q15058 1648 aa27.89■■■□□ 2.05
HERC3-214ENST00000601319 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.87■■■□□ 2.05
HERC3-214ENST00000601319 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
HERC3-214ENST00000601319 CEP162Q5TB80 1403 aa27.84■■■□□ 2.05
HERC3-214ENST00000601319 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
HERC3-214ENST00000601319 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
HERC3-214ENST00000601319 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.8■■■□□ 2.04
HERC3-214ENST00000601319 RICTORQ6R327 1708 aa27.78■■■□□ 2.04
HERC3-214ENST00000601319 FANCAO15360 1455 aa27.78■■■□□ 2.04
HERC3-214ENST00000601319 PLCH2O75038 1416 aa27.74■■■□□ 2.03
HERC3-214ENST00000601319 AKNAQ7Z591 1439 aa27.71■■■□□ 2.03
HERC3-214ENST00000601319 PREX2Q70Z35 1606 aa27.7■■■□□ 2.03
HERC3-214ENST00000601319 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.69■■■□□ 2.02
HERC3-214ENST00000601319 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.67■■■□□ 2.02
HERC3-214ENST00000601319 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.67■■■□□ 2.02
HERC3-214ENST00000601319 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
HERC3-214ENST00000601319 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.64■■■□□ 2.02
HERC3-214ENST00000601319 ADGRL1O94910 1474 aa27.64■■■□□ 2.01
HERC3-214ENST00000601319 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.62■■■□□ 2.01
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