RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599471.5

USF2-211, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 1,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-211ENST00000599471 ARHGEF11O15085 1522 aa29.17■■■□□ 2.26
USF2-211ENST00000599471 PRXQ9BXM0 1461 aa29.15■■■□□ 2.26
USF2-211ENST00000599471 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.12■■■□□ 2.25
USF2-211ENST00000599471 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.08■■■□□ 2.25
USF2-211ENST00000599471 JPH4Q96JJ6 628 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-211ENST00000599471 SHROOM2Q13796 1616 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-211ENST00000599471 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.03■■■□□ 2.24
USF2-211ENST00000599471 IQGAP2Q13576 1575 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-211ENST00000599471 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-211ENST00000599471 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
USF2-211ENST00000599471 KIF21BO75037 1637 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-211ENST00000599471 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.96■■■□□ 2.23
USF2-211ENST00000599471 ARAP1Q96P48 1450 aa28.96■■■□□ 2.23
USF2-211ENST00000599471 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
USF2-211ENST00000599471 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
USF2-211ENST00000599471 GOLGA3Q08378 1498 aa28.86■■■□□ 2.21
USF2-211ENST00000599471 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
USF2-211ENST00000599471 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.82■■■□□ 2.2
USF2-211ENST00000599471 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.8■■■□□ 2.2
USF2-211ENST00000599471 DISP1Q96F81 1524 aa28.75■■■□□ 2.19
USF2-211ENST00000599471 KIAA0556O60303 1618 aa28.73■■■□□ 2.19
USF2-211ENST00000599471 P3H3Q8IVL6 736 aa28.7■■■□□ 2.18
USF2-211ENST00000599471 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.69■■■□□ 2.18
USF2-211ENST00000599471 PTPRGP23470 1445 aa28.68■■■□□ 2.18
USF2-211ENST00000599471 SAMD9Q5K651 1589 aa28.58■■■□□ 2.17
USF2-211ENST00000599471 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.53■■■□□ 2.16
USF2-211ENST00000599471 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.52■■■□□ 2.16
USF2-211ENST00000599471 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.52■■■□□ 2.16
USF2-211ENST00000599471 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.5■■■□□ 2.15
USF2-211ENST00000599471 UACAQ9BZF9 1416 aa28.47■■■□□ 2.15
USF2-211ENST00000599471 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
USF2-211ENST00000599471 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.45■■■□□ 2.14
USF2-211ENST00000599471 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.42■■■□□ 2.14
USF2-211ENST00000599471 ABCC2Q92887 1545 aa28.42■■■□□ 2.14
USF2-211ENST00000599471 CLIP1P30622 1438 aa28.37■■■□□ 2.13
USF2-211ENST00000599471 ARID3CA6NKF2 412 aa28.37■■■□□ 2.13
USF2-211ENST00000599471 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
USF2-211ENST00000599471 ABCA8O94911 1581 aa28.37■■■□□ 2.13
USF2-211ENST00000599471 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.36■■■□□ 2.13
USF2-211ENST00000599471 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.33■■■□□ 2.13
USF2-211ENST00000599471 CEP162Q5TB80 1403 aa28.3■■■□□ 2.12
USF2-211ENST00000599471 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
USF2-211ENST00000599471 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
USF2-211ENST00000599471 FMN1Q68DA7 1419 aa28.25■■■□□ 2.11
USF2-211ENST00000599471 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.24■■■□□ 2.11
USF2-211ENST00000599471 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
USF2-211ENST00000599471 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
USF2-211ENST00000599471 MAPKBP1O60336 1514 aa28.22■■■□□ 2.11
USF2-211ENST00000599471 ASXL2Q76L83 1435 aa28.18■■■□□ 2.1
USF2-211ENST00000599471 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
USF2-211ENST00000599471 ATP10BO94823 1461 aa28.15■■■□□ 2.1
USF2-211ENST00000599471 HECW1Q76N89 1606 aa28.14■■■□□ 2.1
USF2-211ENST00000599471 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
USF2-211ENST00000599471 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.12■■■□□ 2.09
USF2-211ENST00000599471 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.11■■■□□ 2.09
USF2-211ENST00000599471 DIP2BQ9P265 1576 aa28.09■■■□□ 2.09
USF2-211ENST00000599471 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
USF2-211ENST00000599471 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.08■■■□□ 2.09
USF2-211ENST00000599471 KCNH8Q96L42 1107 aa28.07■■■□□ 2.08
USF2-211ENST00000599471 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.07■■■□□ 2.08
USF2-211ENST00000599471 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.04■■■□□ 2.08
USF2-211ENST00000599471 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.03■■■□□ 2.08
USF2-211ENST00000599471 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
USF2-211ENST00000599471 TSPOAP1O95153 1857 aa28.01■■■□□ 2.07
USF2-211ENST00000599471 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.01■■■□□ 2.07
USF2-211ENST00000599471 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.97■■■□□ 2.07
USF2-211ENST00000599471 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.93■■■□□ 2.06
USF2-211ENST00000599471 GLI2P10070 1586 aa27.91■■■□□ 2.06
USF2-211ENST00000599471 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.91■■■□□ 2.06
USF2-211ENST00000599471 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
USF2-211ENST00000599471 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.85■■■□□ 2.05
USF2-211ENST00000599471 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.83■■■□□ 2.05
USF2-211ENST00000599471 CD109Q6YHK3 1445 aa27.81■■■□□ 2.04
USF2-211ENST00000599471 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
USF2-211ENST00000599471 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
USF2-211ENST00000599471 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.78■■■□□ 2.04
USF2-211ENST00000599471 KIF14Q15058 1648 aa27.77■■■□□ 2.04
USF2-211ENST00000599471 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.77■■■□□ 2.04
USF2-211ENST00000599471 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.74■■■□□ 2.03
USF2-211ENST00000599471 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
USF2-211ENST00000599471 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.73■■■□□ 2.03
USF2-211ENST00000599471 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.7■■■□□ 2.03
USF2-211ENST00000599471 TIAM1Q13009 1591 aa27.7■■■□□ 2.03
USF2-211ENST00000599471 APLP2Q06481 763 aa27.7■■■□□ 2.02
USF2-211ENST00000599471 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.64■■■□□ 2.02
USF2-211ENST00000599471 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.64■■■□□ 2.02
USF2-211ENST00000599471 KDM6BO15054 1643 aa27.63■■■□□ 2.01
USF2-211ENST00000599471 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.56■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 FANCAO15360 1455 aa27.55■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.55■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 MAP3K1Q13233 1512 aa27.55■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 PLCH2O75038 1416 aa27.54■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.53■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.53■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.52■■■□□ 2
USF2-211ENST00000599471 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.51■■□□□ 1.99
USF2-211ENST00000599471 PREX2Q70Z35 1606 aa27.51■■□□□ 1.99
USF2-211ENST00000599471 NEO1Q92859 1461 aa27.51■■□□□ 1.99
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