RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598532.1

GTPBP3-218, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, humanhuman

TSL 4

Gene GTPBP3, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3-218ENST00000598532 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.08■■□□□ 1.28
GTPBP3-218ENST00000598532 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.08■■□□□ 1.28
GTPBP3-218ENST00000598532 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.06■■□□□ 1.28
GTPBP3-218ENST00000598532 PRXQ9BXM0 1461 aa23.05■■□□□ 1.28
GTPBP3-218ENST00000598532 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.03■■□□□ 1.28
GTPBP3-218ENST00000598532 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GTPBP3-218ENST00000598532 SHROOM2Q13796 1616 aa22.94■■□□□ 1.26
GTPBP3-218ENST00000598532 ARAP1Q96P48 1450 aa22.93■■□□□ 1.26
GTPBP3-218ENST00000598532 IQGAP2Q13576 1575 aa22.89■■□□□ 1.26
GTPBP3-218ENST00000598532 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.88■■□□□ 1.25
GTPBP3-218ENST00000598532 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.86■■□□□ 1.25
GTPBP3-218ENST00000598532 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.83■■□□□ 1.25
GTPBP3-218ENST00000598532 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GTPBP3-218ENST00000598532 KIF21BO75037 1637 aa22.81■■□□□ 1.24
GTPBP3-218ENST00000598532 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.78■■□□□ 1.24
GTPBP3-218ENST00000598532 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GTPBP3-218ENST00000598532 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.77■■□□□ 1.24
GTPBP3-218ENST00000598532 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.76■■□□□ 1.23
GTPBP3-218ENST00000598532 PTPRGP23470 1445 aa22.75■■□□□ 1.23
GTPBP3-218ENST00000598532 GOLGA3Q08378 1498 aa22.75■■□□□ 1.23
GTPBP3-218ENST00000598532 DISP1Q96F81 1524 aa22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3-218ENST00000598532 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3-218ENST00000598532 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
GTPBP3-218ENST00000598532 P3H3Q8IVL6 736 aa22.66■■□□□ 1.22
GTPBP3-218ENST00000598532 KIAA0556O60303 1618 aa22.65■■□□□ 1.22
GTPBP3-218ENST00000598532 UACAQ9BZF9 1416 aa22.57■■□□□ 1.2
GTPBP3-218ENST00000598532 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GTPBP3-218ENST00000598532 SAMD9Q5K651 1589 aa22.52■■□□□ 1.2
GTPBP3-218ENST00000598532 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3-218ENST00000598532 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3-218ENST00000598532 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3-218ENST00000598532 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.48■■□□□ 1.19
GTPBP3-218ENST00000598532 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3-218ENST00000598532 ABCC2Q92887 1545 aa22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3-218ENST00000598532 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.45■■□□□ 1.18
GTPBP3-218ENST00000598532 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.41■■□□□ 1.18
GTPBP3-218ENST00000598532 ABCA8O94911 1581 aa22.4■■□□□ 1.18
GTPBP3-218ENST00000598532 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.38■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 CLIP1P30622 1438 aa22.38■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 MAPKBP1O60336 1514 aa22.37■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 ARID3CA6NKF2 412 aa22.36■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 FMN1Q68DA7 1419 aa22.36■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 ASXL2Q76L83 1435 aa22.33■■□□□ 1.17
GTPBP3-218ENST00000598532 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.31■■□□□ 1.16
GTPBP3-218ENST00000598532 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.29■■□□□ 1.16
GTPBP3-218ENST00000598532 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GTPBP3-218ENST00000598532 CEP162Q5TB80 1403 aa22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3-218ENST00000598532 ATP10BO94823 1461 aa22.28■■□□□ 1.16
GTPBP3-218ENST00000598532 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GTPBP3-218ENST00000598532 KCNH8Q96L42 1107 aa22.24■■□□□ 1.15
GTPBP3-218ENST00000598532 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3-218ENST00000598532 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.22■■□□□ 1.15
GTPBP3-218ENST00000598532 DIP2BQ9P265 1576 aa22.2■■□□□ 1.14
GTPBP3-218ENST00000598532 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GTPBP3-218ENST00000598532 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GTPBP3-218ENST00000598532 HECW1Q76N89 1606 aa22.17■■□□□ 1.14
GTPBP3-218ENST00000598532 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.16■■□□□ 1.14
GTPBP3-218ENST00000598532 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.15■■□□□ 1.14
GTPBP3-218ENST00000598532 GLI2P10070 1586 aa22.13■■□□□ 1.13
GTPBP3-218ENST00000598532 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GTPBP3-218ENST00000598532 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.09■■□□□ 1.13
GTPBP3-218ENST00000598532 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
GTPBP3-218ENST00000598532 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.07■■□□□ 1.12
GTPBP3-218ENST00000598532 CD109Q6YHK3 1445 aa22.06■■□□□ 1.12
GTPBP3-218ENST00000598532 TSPOAP1O95153 1857 aa22.02■■□□□ 1.12
GTPBP3-218ENST00000598532 VPS8Q8N3P4 1428 aa22■■□□□ 1.11
GTPBP3-218ENST00000598532 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.99■■□□□ 1.11
GTPBP3-218ENST00000598532 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP3-218ENST00000598532 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
GTPBP3-218ENST00000598532 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.97■■□□□ 1.11
GTPBP3-218ENST00000598532 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.95■■□□□ 1.1
GTPBP3-218ENST00000598532 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.94■■□□□ 1.1
GTPBP3-218ENST00000598532 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.94■■□□□ 1.1
GTPBP3-218ENST00000598532 APLP2Q06481 763 aa21.92■■□□□ 1.1
GTPBP3-218ENST00000598532 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.91■■□□□ 1.1
GTPBP3-218ENST00000598532 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
GTPBP3-218ENST00000598532 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
GTPBP3-218ENST00000598532 KIF14Q15058 1648 aa21.88■■□□□ 1.09
GTPBP3-218ENST00000598532 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.87■■□□□ 1.09
GTPBP3-218ENST00000598532 KDM6BO15054 1643 aa21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3-218ENST00000598532 PLCH2O75038 1416 aa21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3-218ENST00000598532 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.84■■□□□ 1.09
GTPBP3-218ENST00000598532 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.83■■□□□ 1.09
GTPBP3-218ENST00000598532 NEO1Q92859 1461 aa21.83■■□□□ 1.08
GTPBP3-218ENST00000598532 FANCAO15360 1455 aa21.79■■□□□ 1.08
GTPBP3-218ENST00000598532 TIAM1Q13009 1591 aa21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3-218ENST00000598532 MAP3K1Q13233 1512 aa21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3-218ENST00000598532 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3-218ENST00000598532 AKNAQ7Z591 1439 aa21.78■■□□□ 1.08
GTPBP3-218ENST00000598532 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3-218ENST00000598532 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.77■■□□□ 1.08
GTPBP3-218ENST00000598532 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.75■■□□□ 1.07
GTPBP3-218ENST00000598532 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3-218ENST00000598532 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3-218ENST00000598532 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.74■■□□□ 1.07
GTPBP3-218ENST00000598532 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.74■■□□□ 1.07
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