RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592265.5

GTF3C2-AS1-210, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 665 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.1■■□□□ 1.45
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.1■■□□□ 1.45
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 IQGAP2Q13576 1575 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SHROOM2Q13796 1616 aa23.98■■□□□ 1.43
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 JPH4Q96JJ6 628 aa23.97■■□□□ 1.43
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.91■■□□□ 1.42
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.91■■□□□ 1.42
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.89■■□□□ 1.41
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.88■■□□□ 1.41
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARHGEF11O15085 1522 aa23.88■■□□□ 1.41
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.87■■□□□ 1.41
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.83■■□□□ 1.41
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.83■■□□□ 1.41
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.83■■□□□ 1.41
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.82■■□□□ 1.4
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KIAA0556O60303 1618 aa23.81■■□□□ 1.4
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DISP1Q96F81 1524 aa23.8■■□□□ 1.4
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.79■■□□□ 1.4
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SAMD9Q5K651 1589 aa23.78■■□□□ 1.4
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CLIP1P30622 1438 aa23.72■■□□□ 1.39
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CEP162Q5TB80 1403 aa23.71■■□□□ 1.39
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 P3H3Q8IVL6 736 aa23.71■■□□□ 1.39
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARAP1Q96P48 1450 aa23.7■■□□□ 1.38
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.68■■□□□ 1.38
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PTPRGP23470 1445 aa23.67■■□□□ 1.38
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.67■■□□□ 1.38
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.63■■□□□ 1.37
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 FMN1Q68DA7 1419 aa23.57■■□□□ 1.36
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 UACAQ9BZF9 1416 aa23.53■■□□□ 1.36
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.5■■□□□ 1.35
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ABCA8O94911 1581 aa23.5■■□□□ 1.35
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ABCC2Q92887 1545 aa23.49■■□□□ 1.35
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.49■■□□□ 1.35
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.48■■□□□ 1.35
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.47■■□□□ 1.35
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 HECW1Q76N89 1606 aa23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARID3CA6NKF2 412 aa23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ATP10BO94823 1461 aa23.3■■□□□ 1.32
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.3■■□□□ 1.32
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MAPKBP1O60336 1514 aa23.26■■□□□ 1.31
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.25■■□□□ 1.31
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 APLP2Q06481 763 aa23.21■■□□□ 1.31
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ASXL2Q76L83 1435 aa23.21■■□□□ 1.31
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.19■■□□□ 1.3
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.18■■□□□ 1.3
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.17■■□□□ 1.3
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TIAM1Q13009 1591 aa23.14■■□□□ 1.3
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MAP3K1Q13233 1512 aa23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KCNH8Q96L42 1107 aa23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.08■■□□□ 1.28
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 DIP2BQ9P265 1576 aa23.07■■□□□ 1.28
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KIF14Q15058 1648 aa23.05■■□□□ 1.28
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.05■■□□□ 1.28
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.04■■□□□ 1.28
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.04■■□□□ 1.28
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 GLI2P10070 1586 aa23.02■■□□□ 1.28
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.01■■□□□ 1.27
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.97■■□□□ 1.27
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CD109Q6YHK3 1445 aa22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 NCOA2Q15596 1464 aa22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.9■■□□□ 1.26
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TSPOAP1O95153 1857 aa22.89■■□□□ 1.25
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.88■■□□□ 1.25
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.85■■□□□ 1.25
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.84■■□□□ 1.25
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PLCH2O75038 1416 aa22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 PREX2Q70Z35 1606 aa22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2-AS1-210ENST00000592265 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms