RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592107.5

AP000547.3-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000547.3, Length 1,019 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000547.3-202ENST00000592107 SHROOM2Q13796 1616 aa44.1■■■■■ 4.65
AP000547.3-202ENST00000592107 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.09■■■■■ 4.65
AP000547.3-202ENST00000592107 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.04■■■■■ 4.64
AP000547.3-202ENST00000592107 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
AP000547.3-202ENST00000592107 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.94■■■■■ 4.62
AP000547.3-202ENST00000592107 IQGAP2Q13576 1575 aa43.92■■■■■ 4.62
AP000547.3-202ENST00000592107 JPH4Q96JJ6 628 aa43.87■■■■■ 4.61
AP000547.3-202ENST00000592107 ARAP1Q96P48 1450 aa43.87■■■■■ 4.61
AP000547.3-202ENST00000592107 KIF21BO75037 1637 aa43.87■■■■■ 4.61
AP000547.3-202ENST00000592107 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.86■■■■■ 4.61
AP000547.3-202ENST00000592107 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
AP000547.3-202ENST00000592107 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.68■■■■■ 4.58
AP000547.3-202ENST00000592107 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.65■■■■■ 4.58
AP000547.3-202ENST00000592107 GOLGA3Q08378 1498 aa43.58■■■■■ 4.57
AP000547.3-202ENST00000592107 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.58■■■■■ 4.57
AP000547.3-202ENST00000592107 DISP1Q96F81 1524 aa43.52■■■■■ 4.56
AP000547.3-202ENST00000592107 KIAA0556O60303 1618 aa43.5■■■■■ 4.55
AP000547.3-202ENST00000592107 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.41■■■■■ 4.54
AP000547.3-202ENST00000592107 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.4■■■■■ 4.54
AP000547.3-202ENST00000592107 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
AP000547.3-202ENST00000592107 PTPRGP23470 1445 aa43.32■■■■■ 4.53
AP000547.3-202ENST00000592107 SAMD9Q5K651 1589 aa43.31■■■■■ 4.52
AP000547.3-202ENST00000592107 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
AP000547.3-202ENST00000592107 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.19■■■■■ 4.51
AP000547.3-202ENST00000592107 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.17■■■■■ 4.5
AP000547.3-202ENST00000592107 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
AP000547.3-202ENST00000592107 UACAQ9BZF9 1416 aa43.07■■■■■ 4.49
AP000547.3-202ENST00000592107 P3H3Q8IVL6 736 aa43.07■■■■■ 4.49
AP000547.3-202ENST00000592107 ABCC2Q92887 1545 aa43.04■■■■■ 4.48
AP000547.3-202ENST00000592107 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.04■■■■■ 4.48
AP000547.3-202ENST00000592107 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43■■■■■ 4.47
AP000547.3-202ENST00000592107 ABCA8O94911 1581 aa42.98■■■■■ 4.47
AP000547.3-202ENST00000592107 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.95■■■■■ 4.47
AP000547.3-202ENST00000592107 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.94■■■■■ 4.46
AP000547.3-202ENST00000592107 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.94■■■■■ 4.46
AP000547.3-202ENST00000592107 MAPKBP1O60336 1514 aa42.86■■■■■ 4.45
AP000547.3-202ENST00000592107 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.85■■■■■ 4.45
AP000547.3-202ENST00000592107 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.82■■■■■ 4.45
AP000547.3-202ENST00000592107 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.44
AP000547.3-202ENST00000592107 CLIP1P30622 1438 aa42.77■■■■■ 4.44
AP000547.3-202ENST00000592107 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.73■■■■■ 4.43
AP000547.3-202ENST00000592107 FMN1Q68DA7 1419 aa42.72■■■■■ 4.43
AP000547.3-202ENST00000592107 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
AP000547.3-202ENST00000592107 CEP162Q5TB80 1403 aa42.65■■■■■ 4.42
AP000547.3-202ENST00000592107 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.63■■■■■ 4.41
AP000547.3-202ENST00000592107 ASXL2Q76L83 1435 aa42.63■■■■■ 4.41
AP000547.3-202ENST00000592107 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
AP000547.3-202ENST00000592107 DIP2BQ9P265 1576 aa42.58■■■■■ 4.41
AP000547.3-202ENST00000592107 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.58■■■■■ 4.41
AP000547.3-202ENST00000592107 HECW1Q76N89 1606 aa42.57■■■■■ 4.4
AP000547.3-202ENST00000592107 ATP10BO94823 1461 aa42.55■■■■■ 4.4
AP000547.3-202ENST00000592107 ARID3CA6NKF2 412 aa42.51■■■■■ 4.4
AP000547.3-202ENST00000592107 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.49■■■■■ 4.39
AP000547.3-202ENST00000592107 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
AP000547.3-202ENST00000592107 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.41■■■■■ 4.38
AP000547.3-202ENST00000592107 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.4■■■■■ 4.38
AP000547.3-202ENST00000592107 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
AP000547.3-202ENST00000592107 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
AP000547.3-202ENST00000592107 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
AP000547.3-202ENST00000592107 GLI2P10070 1586 aa42.39■■■■■ 4.38
AP000547.3-202ENST00000592107 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
AP000547.3-202ENST00000592107 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
AP000547.3-202ENST00000592107 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.36■■■■■ 4.37
AP000547.3-202ENST00000592107 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.36■■■■■ 4.37
AP000547.3-202ENST00000592107 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.26■■■■■ 4.36
AP000547.3-202ENST00000592107 TSPOAP1O95153 1857 aa42.26■■■■■ 4.35
AP000547.3-202ENST00000592107 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.24■■■■■ 4.35
AP000547.3-202ENST00000592107 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.2■■■■■ 4.35
AP000547.3-202ENST00000592107 KCNH8Q96L42 1107 aa42.2■■■■■ 4.35
AP000547.3-202ENST00000592107 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.19■■■■■ 4.34
AP000547.3-202ENST00000592107 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.13■■■■■ 4.34
AP000547.3-202ENST00000592107 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.13■■■■■ 4.33
AP000547.3-202ENST00000592107 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
AP000547.3-202ENST00000592107 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
AP000547.3-202ENST00000592107 CD109Q6YHK3 1445 aa42.03■■■■■ 4.32
AP000547.3-202ENST00000592107 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
AP000547.3-202ENST00000592107 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.99■■■■■ 4.31
AP000547.3-202ENST00000592107 KIF14Q15058 1648 aa41.99■■■■■ 4.31
AP000547.3-202ENST00000592107 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.312e-24■□□□□ 10.9
AP000547.3-202ENST00000592107 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.96■■■■■ 4.31
AP000547.3-202ENST00000592107 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.95■■■■■ 4.31
AP000547.3-202ENST00000592107 TIAM1Q13009 1591 aa41.85■■■■■ 4.29
AP000547.3-202ENST00000592107 KDM6BO15054 1643 aa41.84■■■■■ 4.29
AP000547.3-202ENST00000592107 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.82■■■■■ 4.29
AP000547.3-202ENST00000592107 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.81■■■■■ 4.28
AP000547.3-202ENST00000592107 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.79■■■■■ 4.28
AP000547.3-202ENST00000592107 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.75■■■■■ 4.27
AP000547.3-202ENST00000592107 MAP3K1Q13233 1512 aa41.74■■■■■ 4.27
AP000547.3-202ENST00000592107 NEO1Q92859 1461 aa41.71■■■■■ 4.27
AP000547.3-202ENST00000592107 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.69■■■■■ 4.26
AP000547.3-202ENST00000592107 PLCH2O75038 1416 aa41.68■■■■■ 4.26
AP000547.3-202ENST00000592107 FANCAO15360 1455 aa41.66■■■■■ 4.26
AP000547.3-202ENST00000592107 PREX2Q70Z35 1606 aa41.66■■■■■ 4.26
AP000547.3-202ENST00000592107 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.64■■■■■ 4.26
AP000547.3-202ENST00000592107 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.64■■■■■ 4.26
AP000547.3-202ENST00000592107 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
AP000547.3-202ENST00000592107 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.61■■■■■ 4.25
AP000547.3-202ENST00000592107 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.61■■■■■ 4.25
AP000547.3-202ENST00000592107 APLP2Q06481 763 aa41.6■■■■■ 4.25
AP000547.3-202ENST00000592107 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms