RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590561.5

APLP1-208, Transcript of amyloid beta precursor like protein 1, human

TSL 2

Gene APLP1, Length 2,295 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APLP1-208	ENST00000590561	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
APLP1-208	ENST00000590561	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.91	■■■□□ 2.22
APLP1-208	ENST00000590561	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		28.89	■■■□□ 2.21
APLP1-208	ENST00000590561	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.87	■■■□□ 2.21
APLP1-208	ENST00000590561	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
APLP1-208	ENST00000590561	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.86	■■■□□ 2.21
APLP1-208	ENST00000590561	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.86	■■■□□ 2.21
APLP1-208	ENST00000590561	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
APLP1-208	ENST00000590561	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.82	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.82	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	ITGAE	P38570	1179 aa		28.8	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.79	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.79	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.78	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.78	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.77	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.77	■■■□□ 2.2
APLP1-208	ENST00000590561	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
APLP1-208	ENST00000590561	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.76	■■■□□ 2.19
APLP1-208	ENST00000590561	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.73	■■■□□ 2.19
APLP1-208	ENST00000590561	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
APLP1-208	ENST00000590561	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.7	■■■□□ 2.19
APLP1-208	ENST00000590561	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.68	■■■□□ 2.18
APLP1-208	ENST00000590561	MIER1	Q8N108	512 aa		28.65	■■■□□ 2.18
APLP1-208	ENST00000590561	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.64	■■■□□ 2.18
APLP1-208	ENST00000590561	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
APLP1-208	ENST00000590561	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.6	■■■□□ 2.17
APLP1-208	ENST00000590561	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.6	■■■□□ 2.17
APLP1-208	ENST00000590561	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.59	■■■□□ 2.17
APLP1-208	ENST00000590561	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
APLP1-208	ENST00000590561	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.56	■■■□□ 2.16
APLP1-208	ENST00000590561	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.54	■■■□□ 2.16
APLP1-208	ENST00000590561	ERCC6	Q03468	1493 aa		28.5	■■■□□ 2.15
APLP1-208	ENST00000590561	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.46	■■■□□ 2.15
APLP1-208	ENST00000590561	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.46	■■■□□ 2.15
APLP1-208	ENST00000590561	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		28.45	■■■□□ 2.15
APLP1-208	ENST00000590561	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
APLP1-208	ENST00000590561	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.44	■■■□□ 2.14
APLP1-208	ENST00000590561	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
APLP1-208	ENST00000590561	WDR62	O43379	1518 aa		28.39	■■■□□ 2.14
APLP1-208	ENST00000590561	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.39	■■■□□ 2.13
APLP1-208	ENST00000590561	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.37	■■■□□ 2.13
APLP1-208	ENST00000590561	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.33	■■■□□ 2.13
APLP1-208	ENST00000590561	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.33	■■■□□ 2.13
APLP1-208	ENST00000590561	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.31	■■■□□ 2.12
APLP1-208	ENST00000590561	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.3	■■■□□ 2.12
APLP1-208	ENST00000590561	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
APLP1-208	ENST00000590561	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.29	■■■□□ 2.12
APLP1-208	ENST00000590561	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.29	■■■□□ 2.12
APLP1-208	ENST00000590561	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
APLP1-208	ENST00000590561	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.27	■■■□□ 2.12
APLP1-208	ENST00000590561	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.27	■■■□□ 2.12
APLP1-208	ENST00000590561	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		28.27	■■■□□ 2.12
APLP1-208	ENST00000590561	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.24	■■■□□ 2.11
APLP1-208	ENST00000590561	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.24	■■■□□ 2.11
APLP1-208	ENST00000590561	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.22	■■■□□ 2.11
APLP1-208	ENST00000590561	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.21	■■■□□ 2.11
APLP1-208	ENST00000590561	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.21	■■■□□ 2.11
APLP1-208	ENST00000590561	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.2	■■■□□ 2.1
APLP1-208	ENST00000590561	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.16	■■■□□ 2.1
APLP1-208	ENST00000590561	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
APLP1-208	ENST00000590561	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
APLP1-208	ENST00000590561	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.14	■■■□□ 2.09
APLP1-208	ENST00000590561	NAIP	Q13075	1403 aa		28.13	■■■□□ 2.09
APLP1-208	ENST00000590561	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
APLP1-208	ENST00000590561	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
APLP1-208	ENST00000590561	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
APLP1-208	ENST00000590561	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.07	■■■□□ 2.08
APLP1-208	ENST00000590561	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
APLP1-208	ENST00000590561	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.01	■■■□□ 2.07
APLP1-208	ENST00000590561	DISP1	Q96F81	1524 aa		27.99	■■■□□ 2.07
APLP1-208	ENST00000590561	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.99	■■■□□ 2.07
APLP1-208	ENST00000590561	TONSL	Q96HA7	1378 aa		27.99	■■■□□ 2.07
APLP1-208	ENST00000590561	KIAA0556	O60303	1618 aa		27.98	■■■□□ 2.07
APLP1-208	ENST00000590561	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.96	■■■□□ 2.07
APLP1-208	ENST00000590561	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.94	■■■□□ 2.06
APLP1-208	ENST00000590561	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.94	■■■□□ 2.06
APLP1-208	ENST00000590561	FBLN2	P98095	1184 aa		27.92	■■■□□ 2.06
APLP1-208	ENST00000590561	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.92	■■■□□ 2.06
APLP1-208	ENST00000590561	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.92	■■■□□ 2.06
APLP1-208	ENST00000590561	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
APLP1-208	ENST00000590561	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
APLP1-208	ENST00000590561	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
APLP1-208	ENST00000590561	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
APLP1-208	ENST00000590561	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.86	■■■□□ 2.05
APLP1-208	ENST00000590561	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.82	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	TRIM52	Q96A61	297 aa		27.79	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	KDM6B	O15054	1643 aa		27.79	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.78	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		27.78	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	DAPK1	P53355	1430 aa		27.77	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	ROCK1	Q13464	1354 aa		27.77	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	KCNH8	Q96L42	1107 aa		27.76	■■■□□ 2.04
APLP1-208	ENST00000590561	ABCC5	O15440	1437 aa		27.72	■■■□□ 2.03
APLP1-208	ENST00000590561	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.72	■■■□□ 2.03
APLP1-208	ENST00000590561	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03

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