RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.11■■□□□ 1.45
EFTUD2-214ENST00000589769 GRIN2AQ12879 1464 aa24.09■■□□□ 1.45
EFTUD2-214ENST00000589769 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.09■■□□□ 1.45
EFTUD2-214ENST00000589769 SAMD9Q5K651 1589 aa24.05■■□□□ 1.44
EFTUD2-214ENST00000589769 IQGAP2Q13576 1575 aa24.03■■□□□ 1.44
EFTUD2-214ENST00000589769 CEP170Q5SW79 1584 aa23.97■■□□□ 1.43
EFTUD2-214ENST00000589769 NUP160Q12769 1436 aa23.96■■□□□ 1.43
EFTUD2-214ENST00000589769 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.95■■□□□ 1.43
EFTUD2-214ENST00000589769 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.94■■□□□ 1.42
EFTUD2-214ENST00000589769 CHD1O14646 1710 aa23.91■■□□□ 1.42
EFTUD2-214ENST00000589769 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
EFTUD2-214ENST00000589769 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
EFTUD2-214ENST00000589769 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.83■■□□□ 1.4
EFTUD2-214ENST00000589769 KIAA0556O60303 1618 aa23.82■■□□□ 1.4
EFTUD2-214ENST00000589769 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
EFTUD2-214ENST00000589769 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.8■■□□□ 1.4
EFTUD2-214ENST00000589769 MAP3K1Q13233 1512 aa23.79■■□□□ 1.4
EFTUD2-214ENST00000589769 FMN1Q68DA7 1419 aa23.78■■□□□ 1.4
EFTUD2-214ENST00000589769 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.78■■□□□ 1.4
EFTUD2-214ENST00000589769 DISP1Q96F81 1524 aa23.77■■□□□ 1.4
EFTUD2-214ENST00000589769 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.74■■□□□ 1.39
EFTUD2-214ENST00000589769 SHROOM2Q13796 1616 aa23.73■■□□□ 1.39
EFTUD2-214ENST00000589769 TIAM1Q13009 1591 aa23.72■■□□□ 1.39
EFTUD2-214ENST00000589769 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.69■■□□□ 1.38
EFTUD2-214ENST00000589769 FBLN2P98095 1184 aa23.66■■□□□ 1.38
EFTUD2-214ENST00000589769 HECW1Q76N89 1606 aa23.64■■□□□ 1.38
EFTUD2-214ENST00000589769 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
EFTUD2-214ENST00000589769 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.63■■□□□ 1.37
EFTUD2-214ENST00000589769 P3H3Q8IVL6 736 aa23.6■■□□□ 1.37
EFTUD2-214ENST00000589769 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.59■■□□□ 1.37
EFTUD2-214ENST00000589769 APLP2Q06481 763 aa23.59■■□□□ 1.37
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-214ENST00000589769 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.55■■□□□ 1.36
EFTUD2-214ENST00000589769 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.54■■□□□ 1.36
EFTUD2-214ENST00000589769 JPH4Q96JJ6 628 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-214ENST00000589769 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-214ENST00000589769 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
EFTUD2-214ENST00000589769 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCA8O94911 1581 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-214ENST00000589769 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-214ENST00000589769 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-214ENST00000589769 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
EFTUD2-214ENST00000589769 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
EFTUD2-214ENST00000589769 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.4■■□□□ 1.34
EFTUD2-214ENST00000589769 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.38■■□□□ 1.33
EFTUD2-214ENST00000589769 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
EFTUD2-214ENST00000589769 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.38■■□□□ 1.33
EFTUD2-214ENST00000589769 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
EFTUD2-214ENST00000589769 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
EFTUD2-214ENST00000589769 ARHGEF11O15085 1522 aa23.35■■□□□ 1.33
EFTUD2-214ENST00000589769 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
EFTUD2-214ENST00000589769 PTPRGP23470 1445 aa23.31■■□□□ 1.32
EFTUD2-214ENST00000589769 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.29■■□□□ 1.32
EFTUD2-214ENST00000589769 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
EFTUD2-214ENST00000589769 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.28■■□□□ 1.32
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCC2Q92887 1545 aa23.28■■□□□ 1.32
EFTUD2-214ENST00000589769 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.26■■□□□ 1.31
EFTUD2-214ENST00000589769 NCOA2Q15596 1464 aa23.25■■□□□ 1.31
EFTUD2-214ENST00000589769 UACAQ9BZF9 1416 aa23.25■■□□□ 1.31
EFTUD2-214ENST00000589769 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.24■■□□□ 1.31
EFTUD2-214ENST00000589769 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.21■■□□□ 1.31
EFTUD2-214ENST00000589769 OSCARQ8IYS5 282 aa23.2■■□□□ 1.3
EFTUD2-214ENST00000589769 ATP10BO94823 1461 aa23.19■■□□□ 1.3
EFTUD2-214ENST00000589769 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
EFTUD2-214ENST00000589769 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.17■■□□□ 1.3
EFTUD2-214ENST00000589769 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
EFTUD2-214ENST00000589769 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.16■■□□□ 1.3
EFTUD2-214ENST00000589769 KIF14Q15058 1648 aa23.13■■□□□ 1.29
EFTUD2-214ENST00000589769 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.12■■□□□ 1.29
EFTUD2-214ENST00000589769 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.12■■□□□ 1.29
EFTUD2-214ENST00000589769 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
EFTUD2-214ENST00000589769 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
EFTUD2-214ENST00000589769 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-214ENST00000589769 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-214ENST00000589769 MIA2Q96PC5 1412 aa23.08■■□□□ 1.28
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-214ENST00000589769 ARID3CA6NKF2 412 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-214ENST00000589769 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23■■□□□ 1.27
EFTUD2-214ENST00000589769 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
EFTUD2-214ENST00000589769 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
EFTUD2-214ENST00000589769 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
EFTUD2-214ENST00000589769 PREX2Q70Z35 1606 aa22.96■■□□□ 1.27
EFTUD2-214ENST00000589769 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.94■■□□□ 1.26
EFTUD2-214ENST00000589769 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.93■■□□□ 1.26
EFTUD2-214ENST00000589769 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.92■■□□□ 1.26
EFTUD2-214ENST00000589769 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.92■■□□□ 1.26
EFTUD2-214ENST00000589769 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
EFTUD2-214ENST00000589769 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.92■■□□□ 1.26
EFTUD2-214ENST00000589769 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
EFTUD2-214ENST00000589769 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.88■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.88■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.87■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.87■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.86■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 AKNAQ7Z591 1439 aa22.86■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 HRCP23327 699 aa22.85■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.84■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.83■■□□□ 1.25
EFTUD2-214ENST00000589769 PTPRKQ15262 1439 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms