RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589753.1

ATG4D-211, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 931 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-211ENST00000589753 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
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ATG4D-211ENST00000589753 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.72■■□□□ 1.55
ATG4D-211ENST00000589753 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.71■■□□□ 1.55
ATG4D-211ENST00000589753 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4D-211ENST00000589753 IQGAP2Q13576 1575 aa24.67■■□□□ 1.54
ATG4D-211ENST00000589753 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.62■■□□□ 1.53
ATG4D-211ENST00000589753 JPH4Q96JJ6 628 aa24.58■■□□□ 1.53
ATG4D-211ENST00000589753 SHROOM2Q13796 1616 aa24.57■■□□□ 1.52
ATG4D-211ENST00000589753 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.54■■□□□ 1.52
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ATG4D-211ENST00000589753 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ATG4D-211ENST00000589753 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.45■■□□□ 1.51
ATG4D-211ENST00000589753 DISP1Q96F81 1524 aa24.45■■□□□ 1.5
ATG4D-211ENST00000589753 SAMD9Q5K651 1589 aa24.43■■□□□ 1.5
ATG4D-211ENST00000589753 KIAA0556O60303 1618 aa24.43■■□□□ 1.5
ATG4D-211ENST00000589753 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.42■■□□□ 1.5
ATG4D-211ENST00000589753 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.42■■□□□ 1.5
ATG4D-211ENST00000589753 CEP162Q5TB80 1403 aa24.42■■□□□ 1.5
ATG4D-211ENST00000589753 CLIP1P30622 1438 aa24.41■■□□□ 1.5
ATG4D-211ENST00000589753 ARHGEF11O15085 1522 aa24.4■■□□□ 1.5
ATG4D-211ENST00000589753 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.38■■□□□ 1.49
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ATG4D-211ENST00000589753 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
ATG4D-211ENST00000589753 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
ATG4D-211ENST00000589753 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
ATG4D-211ENST00000589753 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.32■■□□□ 1.48
ATG4D-211ENST00000589753 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-211ENST00000589753 PTPRGP23470 1445 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG4D-211ENST00000589753 ARAP1Q96P48 1450 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4D-211ENST00000589753 FMN1Q68DA7 1419 aa24.19■■□□□ 1.46
ATG4D-211ENST00000589753 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.15■■□□□ 1.46
ATG4D-211ENST00000589753 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.13■■□□□ 1.45
ATG4D-211ENST00000589753 UACAQ9BZF9 1416 aa24.12■■□□□ 1.45
ATG4D-211ENST00000589753 ABCA8O94911 1581 aa24.12■■□□□ 1.45
ATG4D-211ENST00000589753 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-211ENST00000589753 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4D-211ENST00000589753 ABCC2Q92887 1545 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-211ENST00000589753 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4D-211ENST00000589753 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-211ENST00000589753 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ATG4D-211ENST00000589753 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4D-211ENST00000589753 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG4D-211ENST00000589753 HECW1Q76N89 1606 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4D-211ENST00000589753 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ATG4D-211ENST00000589753 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
ATG4D-211ENST00000589753 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.95■■□□□ 1.43
ATG4D-211ENST00000589753 ARID3CA6NKF2 412 aa23.95■■□□□ 1.42
ATG4D-211ENST00000589753 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
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ATG4D-211ENST00000589753 ATP10BO94823 1461 aa23.92■■□□□ 1.42
ATG4D-211ENST00000589753 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.92■■□□□ 1.42
ATG4D-211ENST00000589753 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.91■■□□□ 1.42
ATG4D-211ENST00000589753 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
ATG4D-211ENST00000589753 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
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ATG4D-211ENST00000589753 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
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ATG4D-211ENST00000589753 TIAM1Q13009 1591 aa23.82■■□□□ 1.4
ATG4D-211ENST00000589753 MAP3K1Q13233 1512 aa23.81■■□□□ 1.4
ATG4D-211ENST00000589753 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
ATG4D-211ENST00000589753 MAPKBP1O60336 1514 aa23.79■■□□□ 1.4
ATG4D-211ENST00000589753 ASXL2Q76L83 1435 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG4D-211ENST00000589753 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG4D-211ENST00000589753 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.75■■□□□ 1.39
ATG4D-211ENST00000589753 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.73■■□□□ 1.39
ATG4D-211ENST00000589753 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.72■■□□□ 1.39
ATG4D-211ENST00000589753 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
ATG4D-211ENST00000589753 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.7■■□□□ 1.38
ATG4D-211ENST00000589753 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.69■■□□□ 1.38
ATG4D-211ENST00000589753 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
ATG4D-211ENST00000589753 KCNH8Q96L42 1107 aa23.66■■□□□ 1.38
ATG4D-211ENST00000589753 KIF14Q15058 1648 aa23.63■■□□□ 1.37
ATG4D-211ENST00000589753 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.62■■□□□ 1.37
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ATG4D-211ENST00000589753 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ATG4D-211ENST00000589753 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ATG4D-211ENST00000589753 GLI2P10070 1586 aa23.57■■□□□ 1.36
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ATG4D-211ENST00000589753 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4D-211ENST00000589753 NCOA2Q15596 1464 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4D-211ENST00000589753 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4D-211ENST00000589753 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4D-211ENST00000589753 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ATG4D-211ENST00000589753 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG4D-211ENST00000589753 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-211ENST00000589753 CD109Q6YHK3 1445 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-211ENST00000589753 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-211ENST00000589753 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-211ENST00000589753 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-211ENST00000589753 PLCH2O75038 1416 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-211ENST00000589753 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-211ENST00000589753 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-211ENST00000589753 PREX2Q70Z35 1606 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-211ENST00000589753 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-211ENST00000589753 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-211ENST00000589753 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.39■■□□□ 1.34
ATG4D-211ENST00000589753 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.38■■□□□ 1.33
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