RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IFT140Q96RY7 1462 aa7.95□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TOPBP1Q92547 1522 aa7.94□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POTEMA6NI47 508 aa7.93□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PITPNM1O00562 1244 aa7.93□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.93□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.93□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FBLN2P98095 1184 aa7.89□□□□□ -1.15
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POLA2Q14181 598 aa7.88□□□□□ -1.15
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NPM3O75607 178 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POTEGQ6S5H5 508 aa7.87□□□□□ -1.15
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.87□□□□□ -1.15
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.87□□□□□ -1.15
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.86□□□□□ -1.15
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PBRM1Q86U86 1689 aa7.83□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.83□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.82□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SYNJ1O43426 1573 aa7.82□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.81□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WDR97A6NE52 1622 aa7.81□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.8□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TSPOAP1O95153 1857 aa7.79□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.79□□□□□ -1.16
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABCC8Q09428 1581 aa7.77□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.77□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.75□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC4A2P04920 1241 aa7.74□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POTEIP0CG38 1075 aa7.74□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SOGA1O94964 1423 aa7.74□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CEP170Q5SW79 1584 aa7.73□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SYNJ2O15056 1496 aa7.72□□□□□ -1.17
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CUX1P39880 1505 aa7.71□□□□□ -1.18
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SHROOM2Q13796 1616 aa7.7□□□□□ -1.18
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GRIN2BQ13224 1484 aa7.7□□□□□ -1.18
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.69□□□□□ -1.18
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DIP2BQ9P265 1576 aa7.68□□□□□ -1.18
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KDM6BO15054 1643 aa7.68□□□□□ -1.18
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OTUD5Q96G74 571 aa7.66□□□□□ -1.18
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.66□□□□□ -1.18
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADAMTS12P58397 1594 aa7.64□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GRIN2AQ12879 1464 aa7.64□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.63□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.62□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.62□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NUP160Q12769 1436 aa7.61□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.61□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADGRL1O94910 1474 aa7.61□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.59□□□□□ -1.19
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAPKBP1O60336 1514 aa7.58□□□□□ -1.2
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CUL7Q14999 1698 aa7.54□□□□□ -1.2
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.54□□□□□ -1.2
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.51□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.51□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 JPH4Q96JJ6 628 aa7.5□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FBXO41Q8TF61 875 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIF21BO75037 1637 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.49□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.47□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POTEB2H3BUK9 544 aa7.47□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABCC2Q92887 1545 aa7.47□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GLI2P10070 1586 aa7.46□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TOP2BQ02880 1626 aa7.46□□□□□ -1.21
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CHADLQ6NUI6 762 aa7.46□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ILDR2Q71H61 639 aa7.46□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CLCN6P51797 869 aa7.45□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ASXL2Q76L83 1435 aa7.44□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.43□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.4□□□□□ -1.23
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.37□□□□□ -1.23
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PTPRGP23470 1445 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MADDQ8WXG6 1647 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms