RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CAPNS1-208ENST00000589162 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.74□□□□□ -0.69
CAPNS1-208ENST00000589162 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CAPNS1-208ENST00000589162 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CAPNS1-208ENST00000589162 NCAPD3P42695 1498 aa10.71□□□□□ -0.69
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEIP0CG38 1075 aa10.7□□□□□ -0.7
CAPNS1-208ENST00000589162 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CAPNS1-208ENST00000589162 HMGXB3Q12766 1538 aa10.68□□□□□ -0.7
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB22O15209 634 aa10.68□□□□□ -0.7
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.62□□□□□ -0.71
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.58□□□□□ -0.72
CAPNS1-208ENST00000589162 NESP48681 1621 aa10.52□□□□□ -0.73
CAPNS1-208ENST00000589162 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.52□□□□□ -0.73
CAPNS1-208ENST00000589162 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.51□□□□□ -0.73
CAPNS1-208ENST00000589162 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CAPNS1-208ENST00000589162 OTUD5Q96G74 571 aa10.47□□□□□ -0.73
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEMA6NI47 508 aa10.46□□□□□ -0.73
CAPNS1-208ENST00000589162 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.43□□□□□ -0.74
CAPNS1-208ENST00000589162 CFTRP13569 1480 aa10.42□□□□□ -0.74
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEGQ6S5H5 508 aa10.41□□□□□ -0.74
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.39□□□□□ -0.75
CAPNS1-208ENST00000589162 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.39□□□□□ -0.75
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC8Q09428 1581 aa10.39□□□□□ -0.75
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM2Q13029 1718 aa10.38□□□□□ -0.75
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.38□□□□□ -0.75
CAPNS1-208ENST00000589162 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CAPNS1-208ENST00000589162 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-208ENST00000589162 CREBZFQ9NS37 354 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-208ENST00000589162 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEB2H3BUK9 544 aa10.32□□□□□ -0.76
CAPNS1-208ENST00000589162 C7P10643 843 aa10.32□□□□□ -0.76
CAPNS1-208ENST00000589162 ERCC6Q03468 1493 aa10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A7Q92504 469 aa10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-208ENST00000589162 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNJ1O43426 1573 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-208ENST00000589162 CUX1P39880 1505 aa10.28□□□□□ -0.76
CAPNS1-208ENST00000589162 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 METRNQ9UJH8 293 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TOPBP1Q92547 1522 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM41Q8WV44 630 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PHF12Q96QT6 1004 aa10.21□□□□□ -0.77
CAPNS1-208ENST00000589162 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.21□□□□□ -0.78
CAPNS1-208ENST00000589162 TOP2BQ02880 1626 aa10.2□□□□□ -0.78
CAPNS1-208ENST00000589162 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.19□□□□□ -0.78
CAPNS1-208ENST00000589162 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR62O43379 1518 aa10.18□□□□□ -0.78
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.17□□□□□ -0.78
CAPNS1-208ENST00000589162 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CAPNS1-208ENST00000589162 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-208ENST00000589162 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.13□□□□□ -0.79
CAPNS1-208ENST00000589162 CUX2O14529 1486 aa10.13□□□□□ -0.79
CAPNS1-208ENST00000589162 SOGA1O94964 1423 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-208ENST00000589162 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CAPNS1-208ENST00000589162 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.1□□□□□ -0.79
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR97A6NE52 1622 aa10.09□□□□□ -0.79
CAPNS1-208ENST00000589162 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CAPNS1-208ENST00000589162 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.08□□□□□ -0.8
CAPNS1-208ENST00000589162 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEJP0CG39 1038 aa10.07□□□□□ -0.8
CAPNS1-208ENST00000589162 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.07□□□□□ -0.8
CAPNS1-208ENST00000589162 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
CAPNS1-208ENST00000589162 IFT140Q96RY7 1462 aa10.04□□□□□ -0.8
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.04□□□□□ -0.8
CAPNS1-208ENST00000589162 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.02□□□□□ -0.81
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.02□□□□□ -0.81
CAPNS1-208ENST00000589162 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CAPNS1-208ENST00000589162 PBRM1Q86U86 1689 aa9.99□□□□□ -0.81
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF27Q86VH2 1401 aa9.99□□□□□ -0.81
CAPNS1-208ENST00000589162 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.99□□□□□ -0.81
CAPNS1-208ENST00000589162 TIE1P35590 1138 aa9.98□□□□□ -0.81
CAPNS1-208ENST00000589162 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.97□□□□□ -0.81
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.96□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC24BO95487 1268 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF12Q96FN5 646 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 IGF1RP08069 1367 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHG5O94827 1062 aa9.94□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIN2BQ13224 1484 aa9.93□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 IER5LQ5T953 404 aa9.92□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 EEA1Q15075 1411 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTS12P58397 1594 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms