RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 CHD1O14646 1710 aa49.39■■■■■ 5.5
CAPNS1-206ENST00000588815 IQGAP2Q13576 1575 aa49.33■■■■■ 5.49
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.29■■■■■ 5.48
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP160Q12769 1436 aa49.28■■■■■ 5.48
CAPNS1-206ENST00000588815 EFCAB5A4FU69 1503 aa49.27■■■■■ 5.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP170Q5SW79 1584 aa49.27■■■■■ 5.48
CAPNS1-206ENST00000588815 FBLN2P98095 1184 aa49.25■■■■■ 5.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa49.22■■■■■ 5.47
CAPNS1-206ENST00000588815 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP49.15■■■■■ 5.46
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD9Q5K651 1589 aa49.14■■■■■ 5.46
CAPNS1-206ENST00000588815 UGGT2Q9NYU1 1516 aa49.1■■■■■ 5.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ARAP1Q96P48 1450 aa49.1■■■■■ 5.45
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS8Q8N3P4 1428 aa49.05■■■■■ 5.44
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0556O60303 1618 aa48.83■■■■■ 5.41
CAPNS1-206ENST00000588815 FHOD3Q2V2M9 1422 aa48.79■■■■■ 5.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.79■■■■■ 5.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SHROOM2Q13796 1616 aa48.78■■■■■ 5.4
CAPNS1-206ENST00000588815 DISP1Q96F81 1524 aa48.78■■■■■ 5.4
CAPNS1-206ENST00000588815 JPH4Q96JJ6 628 aa48.76■■■■■ 5.4
CAPNS1-206ENST00000588815 FMN1Q68DA7 1419 aa48.76■■■■■ 5.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.71■■■■■ 5.39
CAPNS1-206ENST00000588815 P3H3Q8IVL6 736 aa48.71■■■■■ 5.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP48.58■■■■■ 5.37
CAPNS1-206ENST00000588815 FYCO1Q9BQS8 1478 aa48.57■■■■■ 5.37
CAPNS1-206ENST00000588815 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa48.55■■■■■ 5.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.52■■■■■ 5.36
CAPNS1-206ENST00000588815 APLP2Q06481 763 aa48.49■■■■■ 5.35
CAPNS1-206ENST00000588815 OSCARQ8IYS5 282 aa48.48■■■■■ 5.35
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K1Q13233 1512 aa48.46■■■■■ 5.35
CAPNS1-206ENST00000588815 HECW1Q76N89 1606 aa48.36■■■■■ 5.33
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP43Q8NDM7 1665 aa48.36■■■■■ 5.33
CAPNS1-206ENST00000588815 TIAM1Q13009 1591 aa48.32■■■■■ 5.33
CAPNS1-206ENST00000588815 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa48.3■■■■■ 5.32
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa48.27■■■■■ 5.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.21■■■■■ 5.31
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC18Q5T9S5 1454 aa48.21■■■■■ 5.31
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRGP23470 1445 aa48.18■■■■■ 5.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA8O94911 1581 aa48.16■■■■■ 5.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
CAPNS1-206ENST00000588815 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.07■■■■■ 5.29
CAPNS1-206ENST00000588815 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
CAPNS1-206ENST00000588815 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP48.05■■■■■ 5.28
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa48.04■■■■■ 5.28
CAPNS1-206ENST00000588815 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.04■■■■■ 5.28
CAPNS1-206ENST00000588815 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
CAPNS1-206ENST00000588815 UACAQ9BZF9 1416 aa47.94■■■■■ 5.26
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
CAPNS1-206ENST00000588815 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa47.87■■■■■ 5.25
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCC2Q92887 1545 aa47.87■■■■■ 5.25
CAPNS1-206ENST00000588815 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.84■■■■■ 5.25
CAPNS1-206ENST00000588815 MTUS2Q5JR59 1369 aa47.81■■■■■ 5.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.75■■■■■ 5.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF11O15085 1522 aa47.73■■■■■ 5.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.72■■■■■ 5.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP10BO94823 1461 aa47.72■■■■■ 5.23
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.62■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.6■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ARID3CA6NKF2 412 aa47.6■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.59■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PCGF6Q9BYE7 350 aa47.58■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP47.57■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.57■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.57■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.57■■■■■ 5.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.56■■■■■ 5.2
CAPNS1-206ENST00000588815 NCOA2Q15596 1464 aa47.54■■■■■ 5.2
CAPNS1-206ENST00000588815 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.48■■■■■ 5.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.45■■■■■ 5.19
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF14Q15058 1648 aa47.41■■■■■ 5.18
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOM3Q5VTT5 1437 aa47.35■■■■■ 5.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNB3Q8WWL7 1395 aa47.33■■■■■ 5.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ITSN2Q9NZM3 1697 aa47.3■■■■■ 5.16
CAPNS1-206ENST00000588815 FGD6Q6ZV73 1430 aa47.26■■■■■ 5.16
CAPNS1-206ENST00000588815 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP47.23■■■■■ 5.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MIA2Q96PC5 1412 aa47.21■■■■■ 5.15
CAPNS1-206ENST00000588815 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.18■■■■■ 5.14
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.18■■■■■ 5.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa47.16■■■■■ 5.14
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPN23Q9H3S7 1636 aa47.14■■■■■ 5.14
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.13■■■■■ 5.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.09■■■■■ 5.13
CAPNS1-206ENST00000588815 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
CAPNS1-206ENST00000588815 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
CAPNS1-206ENST00000588815 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.05■■■■■ 5.126e-24■■□□□ 13
CAPNS1-206ENST00000588815 ASXL2Q76L83 1435 aa47.03■■■■■ 5.12
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO5CQ9NQX4 1742 aa47.03■■■■■ 5.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PREX2Q70Z35 1606 aa47.01■■■■■ 5.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC37Q6PGP7 1564 aa47■■■■■ 5.11
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPKBP1O60336 1514 aa46.97■■■■■ 5.11
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.96■■■■■ 5.11
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.91■■■■■ 5.1
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNH8Q96L42 1107 aa46.89■■■■■ 5.1
CAPNS1-206ENST00000588815 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP46.89■■■■■ 5.1
CAPNS1-206ENST00000588815 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.83■■■■■ 5.09
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