RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.29■■■■■ 4.2
SCAMP4-210ENST00000588555 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
SCAMP4-210ENST00000588555 ARAP1Q96P48 1450 aa41.23■■■■■ 4.19
SCAMP4-210ENST00000588555 IQGAP2Q13576 1575 aa41.18■■■■■ 4.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP170Q5SW79 1584 aa41.16■■■■■ 4.18
SCAMP4-210ENST00000588555 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.15■■■■■ 4.18
SCAMP4-210ENST00000588555 FBLN2P98095 1184 aa41.14■■■■■ 4.18
SCAMP4-210ENST00000588555 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.14■■■■■ 4.18
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.14■■■■■ 4.18
SCAMP4-210ENST00000588555 NUP160Q12769 1436 aa41.13■■■■■ 4.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CHD1O14646 1710 aa41.09■■■■■ 4.17
SCAMP4-210ENST00000588555 SAMD9Q5K651 1589 aa41.08■■■■■ 4.17
SCAMP4-210ENST00000588555 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.99■■■■■ 4.15
SCAMP4-210ENST00000588555 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.93■■■■■ 4.14
SCAMP4-210ENST00000588555 P3H3Q8IVL6 736 aa40.9■■■■■ 4.14
SCAMP4-210ENST00000588555 DISP1Q96F81 1524 aa40.81■■■■■ 4.12
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0556O60303 1618 aa40.77■■■■■ 4.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FMN1Q68DA7 1419 aa40.73■■■■■ 4.11
SCAMP4-210ENST00000588555 JPH4Q96JJ6 628 aa40.72■■■■■ 4.11
SCAMP4-210ENST00000588555 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
SCAMP4-210ENST00000588555 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.66■■■■■ 4.1
SCAMP4-210ENST00000588555 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SCAMP4-210ENST00000588555 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.64■■■■■ 4.1
SCAMP4-210ENST00000588555 SHROOM2Q13796 1616 aa40.64■■■■■ 4.1
SCAMP4-210ENST00000588555 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.63■■■■■ 4.09
SCAMP4-210ENST00000588555 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.59■■■■■ 4.09
SCAMP4-210ENST00000588555 APLP2Q06481 763 aa40.58■■■■■ 4.09
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP3K1Q13233 1512 aa40.53■■■■■ 4.08
SCAMP4-210ENST00000588555 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
SCAMP4-210ENST00000588555 TIAM1Q13009 1591 aa40.48■■■■■ 4.07
SCAMP4-210ENST00000588555 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.44■■■■■ 4.07
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.4■■■■■ 4.06
SCAMP4-210ENST00000588555 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.06
SCAMP4-210ENST00000588555 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
SCAMP4-210ENST00000588555 HECW1Q76N89 1606 aa40.37■■■■■ 4.05
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
SCAMP4-210ENST00000588555 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.34■■■■■ 4.05
SCAMP4-210ENST00000588555 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.31■■■■■ 4.04
SCAMP4-210ENST00000588555 OSCARQ8IYS5 282 aa40.31■■■■■ 4.04
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.28■■■■■ 4.04
SCAMP4-210ENST00000588555 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.28■■■■■ 4.04
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.25■■■■■ 4.03
SCAMP4-210ENST00000588555 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.25■■■■■ 4.03
SCAMP4-210ENST00000588555 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
SCAMP4-210ENST00000588555 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPRGP23470 1445 aa40.22■■■■■ 4.03
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCA8O94911 1581 aa40.22■■■■■ 4.03
SCAMP4-210ENST00000588555 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
SCAMP4-210ENST00000588555 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.06■■■■■ 4
SCAMP4-210ENST00000588555 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.03■■■■■ 4
SCAMP4-210ENST00000588555 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.02■■■■■ 4
SCAMP4-210ENST00000588555 UACAQ9BZF9 1416 aa40.01■■■■■ 4
SCAMP4-210ENST00000588555 ARID3CA6NKF2 412 aa40■■■■□ 3.99
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCC2Q92887 1545 aa39.93■■■■□ 3.98
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP10BO94823 1461 aa39.91■■■■□ 3.98
SCAMP4-210ENST00000588555 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.89■■■■□ 3.98
SCAMP4-210ENST00000588555 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
SCAMP4-210ENST00000588555 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
SCAMP4-210ENST00000588555 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.86■■■■□ 3.97
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF11O15085 1522 aa39.85■■■■□ 3.97
SCAMP4-210ENST00000588555 NCOA2Q15596 1464 aa39.84■■■■□ 3.97
SCAMP4-210ENST00000588555 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.96
SCAMP4-210ENST00000588555 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.96
SCAMP4-210ENST00000588555 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.96
SCAMP4-210ENST00000588555 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
SCAMP4-210ENST00000588555 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.73■■■■□ 3.95
SCAMP4-210ENST00000588555 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.72■■■■□ 3.95
SCAMP4-210ENST00000588555 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.7■■■■□ 3.95
SCAMP4-210ENST00000588555 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.66■■■■□ 3.94
SCAMP4-210ENST00000588555 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.64■■■■□ 3.94
SCAMP4-210ENST00000588555 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.64■■■■□ 3.94
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF14Q15058 1648 aa39.63■■■■□ 3.93
SCAMP4-210ENST00000588555 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.55■■■■□ 3.92
SCAMP4-210ENST00000588555 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.55■■■■□ 3.92
SCAMP4-210ENST00000588555 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.55■■■■□ 3.92
SCAMP4-210ENST00000588555 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.53■■■■□ 3.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.49■■■■□ 3.91
SCAMP4-210ENST00000588555 MIA2Q96PC5 1412 aa39.47■■■■□ 3.91
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.46■■■■□ 3.91
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
SCAMP4-210ENST00000588555 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
SCAMP4-210ENST00000588555 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
SCAMP4-210ENST00000588555 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.41■■■■□ 3.9
SCAMP4-210ENST00000588555 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.36■■■■□ 3.89
SCAMP4-210ENST00000588555 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.32■■■■□ 3.896e-6■■■■■ 38.2
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.31■■■■□ 3.88
SCAMP4-210ENST00000588555 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.3■■■■□ 3.88
SCAMP4-210ENST00000588555 ITGAEP38570 1179 aa39.28■■■■□ 3.88
SCAMP4-210ENST00000588555 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.26■■■■□ 3.88
SCAMP4-210ENST00000588555 ASXL2Q76L83 1435 aa39.26■■■■□ 3.87
SCAMP4-210ENST00000588555 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
SCAMP4-210ENST00000588555 PREX2Q70Z35 1606 aa39.23■■■■□ 3.87
SCAMP4-210ENST00000588555 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.22■■■■□ 3.87
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNH8Q96L42 1107 aa39.22■■■■□ 3.87
SCAMP4-210ENST00000588555 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.19■■■■□ 3.86
SCAMP4-210ENST00000588555 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.19■■■■□ 3.86
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPRKQ15262 1439 aa39.18■■■■□ 3.86
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
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