RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588439.1

TYROBP-208, Transcript of TYRO protein tyrosine kinase binding protein, human

TSL 2

Gene TYROBP, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TYROBP-208	ENST00000588439	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.48	■■■□□ 2.95
TYROBP-208	ENST00000588439	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TYROBP-208	ENST00000588439	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TYROBP-208	ENST00000588439	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TYROBP-208	ENST00000588439	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.32	■■■□□ 2.92
TYROBP-208	ENST00000588439	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
TYROBP-208	ENST00000588439	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TYROBP-208	ENST00000588439	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TYROBP-208	ENST00000588439	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TYROBP-208	ENST00000588439	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
TYROBP-208	ENST00000588439	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TYROBP-208	ENST00000588439	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TYROBP-208	ENST00000588439	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TYROBP-208	ENST00000588439	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TYROBP-208	ENST00000588439	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TYROBP-208	ENST00000588439	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TYROBP-208	ENST00000588439	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TYROBP-208	ENST00000588439	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TYROBP-208	ENST00000588439	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TYROBP-208	ENST00000588439	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TYROBP-208	ENST00000588439	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TYROBP-208	ENST00000588439	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TYROBP-208	ENST00000588439	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TYROBP-208	ENST00000588439	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TYROBP-208	ENST00000588439	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.95	■■■□□ 2.87
TYROBP-208	ENST00000588439	CLIP1	P30622	1438 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TYROBP-208	ENST00000588439	PTPRG	P23470	1445 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TYROBP-208	ENST00000588439	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TYROBP-208	ENST00000588439	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TYROBP-208	ENST00000588439	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TYROBP-208	ENST00000588439	ABCA8	O94911	1581 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TYROBP-208	ENST00000588439	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TYROBP-208	ENST00000588439	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TYROBP-208	ENST00000588439	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
TYROBP-208	ENST00000588439	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TYROBP-208	ENST00000588439	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TYROBP-208	ENST00000588439	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TYROBP-208	ENST00000588439	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TYROBP-208	ENST00000588439	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TYROBP-208	ENST00000588439	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TYROBP-208	ENST00000588439	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TYROBP-208	ENST00000588439	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TYROBP-208	ENST00000588439	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TYROBP-208	ENST00000588439	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TYROBP-208	ENST00000588439	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TYROBP-208	ENST00000588439	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TYROBP-208	ENST00000588439	ATP10B	O94823	1461 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TYROBP-208	ENST00000588439	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TYROBP-208	ENST00000588439	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TYROBP-208	ENST00000588439	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TYROBP-208	ENST00000588439	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78
TYROBP-208	ENST00000588439	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TYROBP-208	ENST00000588439	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TYROBP-208	ENST00000588439	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TYROBP-208	ENST00000588439	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
TYROBP-208	ENST00000588439	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TYROBP-208	ENST00000588439	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TYROBP-208	ENST00000588439	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TYROBP-208	ENST00000588439	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TYROBP-208	ENST00000588439	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TYROBP-208	ENST00000588439	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TYROBP-208	ENST00000588439	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TYROBP-208	ENST00000588439	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TYROBP-208	ENST00000588439	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TYROBP-208	ENST00000588439	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TYROBP-208	ENST00000588439	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
TYROBP-208	ENST00000588439	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TYROBP-208	ENST00000588439	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TYROBP-208	ENST00000588439	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TYROBP-208	ENST00000588439	GLI2	P10070	1586 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TYROBP-208	ENST00000588439	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TYROBP-208	ENST00000588439	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TYROBP-208	ENST00000588439	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TYROBP-208	ENST00000588439	APLP2	Q06481	763 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TYROBP-208	ENST00000588439	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TYROBP-208	ENST00000588439	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32	■■■□□ 2.71
TYROBP-208	ENST00000588439	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
TYROBP-208	ENST00000588439	KIF14	Q15058	1648 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TYROBP-208	ENST00000588439	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TYROBP-208	ENST00000588439	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.96	■■■□□ 2.71
TYROBP-208	ENST00000588439	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.96	■■■□□ 2.71
TYROBP-208	ENST00000588439	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TYROBP-208	ENST00000588439	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TYROBP-208	ENST00000588439	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
TYROBP-208	ENST00000588439	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TYROBP-208	ENST00000588439	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TYROBP-208	ENST00000588439	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TYROBP-208	ENST00000588439	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
TYROBP-208	ENST00000588439	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TYROBP-208	ENST00000588439	PLCH2	O75038	1416 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TYROBP-208	ENST00000588439	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TYROBP-208	ENST00000588439	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.68
TYROBP-208	ENST00000588439	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TYROBP-208	ENST00000588439	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TYROBP-208	ENST00000588439	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TYROBP-208	ENST00000588439	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TYROBP-208	ENST00000588439	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TYROBP-208	ENST00000588439	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TYROBP-208	ENST00000588439	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TYROBP-208	ENST00000588439	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.68	■■■□□ 2.66

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