RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF11O15085 1522 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SYNJ2O15056 1496 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAMTS12P58397 1594 aa18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF39Q9H2S5 420 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 GRIN2AQ12879 1464 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ARAP1Q96P48 1450 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.46■□□□□ 0.55
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP170Q5SW79 1584 aa18.42■□□□□ 0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 NUP160Q12769 1436 aa18.38■□□□□ 0.53
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF27Q86VH2 1401 aa18.37■□□□□ 0.53
EFTUD2-209ENST00000587957 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
EFTUD2-209ENST00000587957 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.33■□□□□ 0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 CUL7Q14999 1698 aa18.31■□□□□ 0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.28■□□□□ 0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 SHROOM2Q13796 1616 aa18.27■□□□□ 0.52
EFTUD2-209ENST00000587957 IGF1RP08069 1367 aa18.27■□□□□ 0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 JPH4Q96JJ6 628 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-209ENST00000587957 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.08■□□□□ 0.49
EFTUD2-209ENST00000587957 IQGAP2Q13576 1575 aa18.08■□□□□ 0.48
EFTUD2-209ENST00000587957 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18■□□□□ 0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.99■□□□□ 0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNA4P22459 653 aa17.99■□□□□ 0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.475e-9■□□□□ 9.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.99■□□□□ 0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPRGP23470 1445 aa17.96■□□□□ 0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.94■□□□□ 0.46
EFTUD2-209ENST00000587957 DISP1Q96F81 1524 aa17.92■□□□□ 0.46
EFTUD2-209ENST00000587957 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.92■□□□□ 0.46
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA0556O60303 1618 aa17.91■□□□□ 0.46
EFTUD2-209ENST00000587957 PRXQ9BXM0 1461 aa17.91■□□□□ 0.46
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.91■□□□□ 0.46
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
EFTUD2-209ENST00000587957 MAPKBP1O60336 1514 aa17.88■□□□□ 0.45
EFTUD2-209ENST00000587957 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-209ENST00000587957 DIP2BQ9P265 1576 aa17.83■□□□□ 0.45
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCC2Q92887 1545 aa17.83■□□□□ 0.45
EFTUD2-209ENST00000587957 EEA1Q15075 1411 aa17.83■□□□□ 0.45
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA3Q08378 1498 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-209ENST00000587957 UACAQ9BZF9 1416 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-209ENST00000587957 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
EFTUD2-209ENST00000587957 TSPOAP1O95153 1857 aa17.79■□□□□ 0.44
EFTUD2-209ENST00000587957 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.78■□□□□ 0.44
EFTUD2-209ENST00000587957 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.78■□□□□ 0.44
EFTUD2-209ENST00000587957 P3H3Q8IVL6 736 aa17.77■□□□□ 0.44
EFTUD2-209ENST00000587957 ASXL2Q76L83 1435 aa17.76■□□□□ 0.43
EFTUD2-209ENST00000587957 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
EFTUD2-209ENST00000587957 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.75■□□□□ 0.43
EFTUD2-209ENST00000587957 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF21BO75037 1637 aa17.71■□□□□ 0.43
EFTUD2-209ENST00000587957 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.71■□□□□ 0.43
EFTUD2-209ENST00000587957 ARID3CA6NKF2 412 aa17.69■□□□□ 0.42
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCA8O94911 1581 aa17.69■□□□□ 0.42
EFTUD2-209ENST00000587957 SAMD9Q5K651 1589 aa17.67■□□□□ 0.42
EFTUD2-209ENST00000587957 KDM6BO15054 1643 aa17.65■□□□□ 0.42
EFTUD2-209ENST00000587957 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.63■□□□□ 0.41
EFTUD2-209ENST00000587957 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
EFTUD2-209ENST00000587957 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.63■□□□□ 0.41
EFTUD2-209ENST00000587957 GLI2P10070 1586 aa17.62■□□□□ 0.41
EFTUD2-209ENST00000587957 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
EFTUD2-209ENST00000587957 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.6■□□□□ 0.41
EFTUD2-209ENST00000587957 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNH8Q96L42 1107 aa17.59■□□□□ 0.41
EFTUD2-209ENST00000587957 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa17.58■□□□□ 0.41
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC4A2P04920 1241 aa17.58■□□□□ 0.4
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
EFTUD2-209ENST00000587957 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.56■□□□□ 0.4
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP10BO94823 1461 aa17.53■□□□□ 0.4
EFTUD2-209ENST00000587957 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.53■□□□□ 0.4
EFTUD2-209ENST00000587957 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.51■□□□□ 0.39
EFTUD2-209ENST00000587957 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
EFTUD2-209ENST00000587957 CD109Q6YHK3 1445 aa17.49■□□□□ 0.39
EFTUD2-209ENST00000587957 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.44■□□□□ 0.38
EFTUD2-209ENST00000587957 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
EFTUD2-209ENST00000587957 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
EFTUD2-209ENST00000587957 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.42■□□□□ 0.38
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.4■□□□□ 0.38
EFTUD2-209ENST00000587957 HECW1Q76N89 1606 aa17.39■□□□□ 0.38
EFTUD2-209ENST00000587957 FMN1Q68DA7 1419 aa17.39■□□□□ 0.38
EFTUD2-209ENST00000587957 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.37■□□□□ 0.37
EFTUD2-209ENST00000587957 CAPN15O75808 1086 aa17.34■□□□□ 0.37
EFTUD2-209ENST00000587957 DSG3P32926 999 aa17.33■□□□□ 0.36
EFTUD2-209ENST00000587957 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms