RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587009.5

UBXN6-203, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 1,967 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-203ENST00000587009 PBRM1Q86U86 1689 aa30.94■■■□□ 2.54
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UBXN6-203ENST00000587009 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.87■■■□□ 2.53
UBXN6-203ENST00000587009 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.86■■■□□ 2.53
UBXN6-203ENST00000587009 GRIN2BQ13224 1484 aa30.85■■■□□ 2.53
UBXN6-203ENST00000587009 CUL7Q14999 1698 aa30.74■■■□□ 2.51
UBXN6-203ENST00000587009 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
UBXN6-203ENST00000587009 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.72■■■□□ 2.51
UBXN6-203ENST00000587009 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
UBXN6-203ENST00000587009 ADAMTS12P58397 1594 aa30.69■■■□□ 2.5
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UBXN6-203ENST00000587009 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.62■■■□□ 2.49
UBXN6-203ENST00000587009 MAP3K1Q13233 1512 aa30.61■■■□□ 2.49
UBXN6-203ENST00000587009 SYNJ2O15056 1496 aa30.57■■■□□ 2.48
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UBXN6-203ENST00000587009 CHD1O14646 1710 aa30.53■■■□□ 2.48
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UBXN6-203ENST00000587009 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.5■■■□□ 2.47
UBXN6-203ENST00000587009 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
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UBXN6-203ENST00000587009 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
UBXN6-203ENST00000587009 GRIN2AQ12879 1464 aa30.47■■■□□ 2.47
UBXN6-203ENST00000587009 FBLN2P98095 1184 aa30.45■■■□□ 2.47
UBXN6-203ENST00000587009 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.43■■■□□ 2.46
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UBXN6-203ENST00000587009 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.39■■■□□ 2.46
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UBXN6-203ENST00000587009 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.31■■■□□ 2.44
UBXN6-203ENST00000587009 CEP170Q5SW79 1584 aa30.31■■■□□ 2.44
UBXN6-203ENST00000587009 P3H3Q8IVL6 736 aa30.3■■■□□ 2.44
UBXN6-203ENST00000587009 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.3■■■□□ 2.44
UBXN6-203ENST00000587009 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.29■■■□□ 2.44
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UBXN6-203ENST00000587009 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.27■■■□□ 2.44
UBXN6-203ENST00000587009 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.21■■■□□ 2.43
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UBXN6-203ENST00000587009 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.18■■■□□ 2.42
UBXN6-203ENST00000587009 IQGAP2Q13576 1575 aa30.16■■■□□ 2.42
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UBXN6-203ENST00000587009 OSCARQ8IYS5 282 aa30.15■■■□□ 2.42
UBXN6-203ENST00000587009 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.14■■■□□ 2.42
UBXN6-203ENST00000587009 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
UBXN6-203ENST00000587009 SAMD9Q5K651 1589 aa30.12■■■□□ 2.41
UBXN6-203ENST00000587009 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.09■■■□□ 2.41
UBXN6-203ENST00000587009 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.06■■■□□ 2.4
UBXN6-203ENST00000587009 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
UBXN6-203ENST00000587009 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
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UBXN6-203ENST00000587009 SHROOM2Q13796 1616 aa30.02■■■□□ 2.4
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UBXN6-203ENST00000587009 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
UBXN6-203ENST00000587009 KIAA0556O60303 1618 aa29.86■■■□□ 2.37
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UBXN6-203ENST00000587009 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.82■■■□□ 2.36
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UBXN6-203ENST00000587009 PTPRGP23470 1445 aa29.6■■■□□ 2.33
UBXN6-203ENST00000587009 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.59■■■□□ 2.33
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UBXN6-203ENST00000587009 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.59■■■□□ 2.33
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UBXN6-203ENST00000587009 ABCA8O94911 1581 aa29.47■■■□□ 2.31
UBXN6-203ENST00000587009 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.46■■■□□ 2.31
UBXN6-203ENST00000587009 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
UBXN6-203ENST00000587009 AKNAQ7Z591 1439 aa29.42■■■□□ 2.3
UBXN6-203ENST00000587009 ABCC2Q92887 1545 aa29.39■■■□□ 2.3
UBXN6-203ENST00000587009 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.36■■■□□ 2.29
UBXN6-203ENST00000587009 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
UBXN6-203ENST00000587009 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.36■■■□□ 2.29
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