RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585313.5

IFT20-215, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

APPRIS P4 TSL 3 BASIC

Gene IFT20, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-215ENST00000585313 ARAP1Q96P48 1450 aa26.21■■□□□ 1.79
IFT20-215ENST00000585313 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.21■■□□□ 1.79
IFT20-215ENST00000585313 GRIN2AQ12879 1464 aa26.2■■□□□ 1.78
IFT20-215ENST00000585313 IQGAP2Q13576 1575 aa26.15■■□□□ 1.78
IFT20-215ENST00000585313 SAMD9Q5K651 1589 aa26.12■■□□□ 1.77
IFT20-215ENST00000585313 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
IFT20-215ENST00000585313 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.07■■□□□ 1.76
IFT20-215ENST00000585313 CEP170Q5SW79 1584 aa26.04■■□□□ 1.76
IFT20-215ENST00000585313 NUP160Q12769 1436 aa26.04■■□□□ 1.76
IFT20-215ENST00000585313 CHD1O14646 1710 aa26.03■■□□□ 1.76
IFT20-215ENST00000585313 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.03■■□□□ 1.76
IFT20-215ENST00000585313 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
IFT20-215ENST00000585313 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.93■■□□□ 1.74
IFT20-215ENST00000585313 FMN1Q68DA7 1419 aa25.91■■□□□ 1.74
IFT20-215ENST00000585313 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
IFT20-215ENST00000585313 KIAA0556O60303 1618 aa25.88■■□□□ 1.73
IFT20-215ENST00000585313 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.88■■□□□ 1.73
IFT20-215ENST00000585313 MAP3K1Q13233 1512 aa25.88■■□□□ 1.73
IFT20-215ENST00000585313 FBLN2P98095 1184 aa25.87■■□□□ 1.73
IFT20-215ENST00000585313 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.85■■□□□ 1.73
IFT20-215ENST00000585313 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
IFT20-215ENST00000585313 APLP2Q06481 763 aa25.84■■□□□ 1.73
IFT20-215ENST00000585313 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.84■■□□□ 1.73
IFT20-215ENST00000585313 DISP1Q96F81 1524 aa25.83■■□□□ 1.72
IFT20-215ENST00000585313 P3H3Q8IVL6 736 aa25.8■■□□□ 1.72
IFT20-215ENST00000585313 TIAM1Q13009 1591 aa25.8■■□□□ 1.72
IFT20-215ENST00000585313 SHROOM2Q13796 1616 aa25.77■■□□□ 1.72
IFT20-215ENST00000585313 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.73■■□□□ 1.71
IFT20-215ENST00000585313 HECW1Q76N89 1606 aa25.72■■□□□ 1.71
IFT20-215ENST00000585313 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.72■■□□□ 1.71
IFT20-215ENST00000585313 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
IFT20-215ENST00000585313 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.7■■□□□ 1.7
IFT20-215ENST00000585313 JPH4Q96JJ6 628 aa25.69■■□□□ 1.7
IFT20-215ENST00000585313 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.69■■□□□ 1.7
IFT20-215ENST00000585313 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.65■■□□□ 1.7
IFT20-215ENST00000585313 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.63■■□□□ 1.69
IFT20-215ENST00000585313 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.62■■□□□ 1.69
IFT20-215ENST00000585313 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
IFT20-215ENST00000585313 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
IFT20-215ENST00000585313 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
IFT20-215ENST00000585313 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
IFT20-215ENST00000585313 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.52■■□□□ 1.68
IFT20-215ENST00000585313 ABCA8O94911 1581 aa25.52■■□□□ 1.68
IFT20-215ENST00000585313 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
IFT20-215ENST00000585313 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
IFT20-215ENST00000585313 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
IFT20-215ENST00000585313 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.44■■□□□ 1.66
IFT20-215ENST00000585313 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
IFT20-215ENST00000585313 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
IFT20-215ENST00000585313 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.43■■□□□ 1.66
IFT20-215ENST00000585313 PTPRGP23470 1445 aa25.42■■□□□ 1.66
IFT20-215ENST00000585313 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.42■■□□□ 1.66
IFT20-215ENST00000585313 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.39■■□□□ 1.66
IFT20-215ENST00000585313 ARHGEF11O15085 1522 aa25.35■■□□□ 1.65
IFT20-215ENST00000585313 OSCARQ8IYS5 282 aa25.33■■□□□ 1.65
IFT20-215ENST00000585313 UACAQ9BZF9 1416 aa25.31■■□□□ 1.64
IFT20-215ENST00000585313 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.31■■□□□ 1.64
IFT20-215ENST00000585313 NCOA2Q15596 1464 aa25.31■■□□□ 1.64
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IFT20-215ENST00000585313 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.31■■□□□ 1.64
IFT20-215ENST00000585313 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.3■■□□□ 1.64
IFT20-215ENST00000585313 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
IFT20-215ENST00000585313 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.27■■□□□ 1.64
IFT20-215ENST00000585313 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
IFT20-215ENST00000585313 ATP10BO94823 1461 aa25.25■■□□□ 1.63
IFT20-215ENST00000585313 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.23■■□□□ 1.63
IFT20-215ENST00000585313 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
IFT20-215ENST00000585313 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.2■■□□□ 1.63
IFT20-215ENST00000585313 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
IFT20-215ENST00000585313 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.17■■□□□ 1.62
IFT20-215ENST00000585313 KIF14Q15058 1648 aa25.17■■□□□ 1.62
IFT20-215ENST00000585313 ARID3CA6NKF2 412 aa25.17■■□□□ 1.62
IFT20-215ENST00000585313 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
IFT20-215ENST00000585313 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
IFT20-215ENST00000585313 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
IFT20-215ENST00000585313 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.14■■□□□ 1.61
IFT20-215ENST00000585313 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.13■■□□□ 1.61
IFT20-215ENST00000585313 MIA2Q96PC5 1412 aa25.12■■□□□ 1.61
IFT20-215ENST00000585313 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
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IFT20-215ENST00000585313 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.04■■□□□ 1.6
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IFT20-215ENST00000585313 PREX2Q70Z35 1606 aa24.97■■□□□ 1.59
IFT20-215ENST00000585313 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.94■■□□□ 1.58
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IFT20-215ENST00000585313 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.93■■□□□ 1.58
IFT20-215ENST00000585313 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.93■■□□□ 1.58
IFT20-215ENST00000585313 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
IFT20-215ENST00000585313 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.92■■□□□ 1.58
IFT20-215ENST00000585313 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.91■■□□□ 1.58
IFT20-215ENST00000585313 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
IFT20-215ENST00000585313 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.89■■□□□ 1.58
IFT20-215ENST00000585313 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.89■■□□□ 1.57
IFT20-215ENST00000585313 ITGAEP38570 1179 aa24.87■■□□□ 1.57
IFT20-215ENST00000585313 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.87■■□□□ 1.57
IFT20-215ENST00000585313 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
IFT20-215ENST00000585313 AKNAQ7Z591 1439 aa24.85■■□□□ 1.57
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