RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585149.1

TSPOAP1-211, Transcript of TSPO associated protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1, Length 381 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-211ENST00000585149 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
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TSPOAP1-211ENST00000585149 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.84■■■□□ 2.05
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TSPOAP1-211ENST00000585149 IQGAP2Q13576 1575 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-211ENST00000585149 SHROOM2Q13796 1616 aa27.74■■■□□ 2.03
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TSPOAP1-211ENST00000585149 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-211ENST00000585149 ARHGEF11O15085 1522 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-211ENST00000585149 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.65■■■□□ 2.02
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TSPOAP1-211ENST00000585149 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPOAP1-211ENST00000585149 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPOAP1-211ENST00000585149 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.61■■■□□ 2.01
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TSPOAP1-211ENST00000585149 PTPRGP23470 1445 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-211ENST00000585149 SAMD9Q5K651 1589 aa27.46■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-211ENST00000585149 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.19■■□□□ 1.94
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TSPOAP1-211ENST00000585149 ABCA8O94911 1581 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPOAP1-211ENST00000585149 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPOAP1-211ENST00000585149 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TSPOAP1-211ENST00000585149 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.15■■□□□ 1.94
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TSPOAP1-211ENST00000585149 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.04■■□□□ 1.92
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TSPOAP1-211ENST00000585149 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
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TSPOAP1-211ENST00000585149 GLI2P10070 1586 aa26.67■■□□□ 1.86
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TSPOAP1-211ENST00000585149 CD109Q6YHK3 1445 aa26.57■■□□□ 1.84
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TSPOAP1-211ENST00000585149 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPOAP1-211ENST00000585149 NCOA2Q15596 1464 aa26.46■■□□□ 1.83
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TSPOAP1-211ENST00000585149 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPOAP1-211ENST00000585149 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.4■■□□□ 1.82
TSPOAP1-211ENST00000585149 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
TSPOAP1-211ENST00000585149 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.39■■□□□ 1.82
TSPOAP1-211ENST00000585149 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.39■■□□□ 1.82
TSPOAP1-211ENST00000585149 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.39■■□□□ 1.82
TSPOAP1-211ENST00000585149 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
TSPOAP1-211ENST00000585149 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.39■■□□□ 1.81
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